Differentiation of petroleum hydrocarbon-degrading Pseudomonas spp. based on PCR-RFLP of the 16S-23S rDNA intergenic spacer region
Jazyk angličtina Země Spojené státy americké Médium print-electronic
Typ dokumentu hodnotící studie, časopisecké články
- MeSH
- DNA bakterií genetika MeSH
- fylogeneze MeSH
- mezerníky ribozomální DNA genetika MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody MeSH
- polymorfismus délky restrikčních fragmentů * MeSH
- Pseudomonas klasifikace genetika izolace a purifikace metabolismus MeSH
- RNA ribozomální 16S genetika MeSH
- RNA ribozomální 23S genetika MeSH
- ropa mikrobiologie MeSH
- techniky typizace bakterií metody MeSH
- uhlovodíky metabolismus MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- hodnotící studie MeSH
- Názvy látek
- DNA bakterií MeSH
- mezerníky ribozomální DNA MeSH
- RNA ribozomální 16S MeSH
- RNA ribozomální 23S MeSH
- ropa MeSH
- uhlovodíky MeSH
Genetic diversity among 43 petroleum hydrocarbon-degrading Pseudomonas belonging to four different species and the type strain Pseudomonas aeruginosa MTCC1034 was assessed by using restriction fragment length polymorphism (RFLP) of polymerase chain reaction (PCR)-amplified 16S-23S rDNA intergenic spacer regions (ISRs) polymorphism. PCR amplification from all Pseudomonas species yielded almost identical ISR amplicons of "?" 800 bp and in nested PCR of "?" 550 bp. The RFLP analysis with MboI and AluI revealed considerable intraspecific variations within the Pseudomonas species. The dendrogram constructed on the basis of the PCR-RFLP patterns of 16S-23S rDNA intergenic spacer regions differentiated all the species into seven different clusters.
Zobrazit více v PubMed
Environ Microbiol. 2002 Dec;4(12):799-808 PubMed
Microbiology (Reading). 1996 Jan;142 ( Pt 1):3-16 PubMed
Appl Environ Microbiol. 1993 Apr;59(4):945-52 PubMed
Microbiol Rev. 1981 Mar;45(1):180-209 PubMed
Appl Environ Microbiol. 1992 Oct;58(10):3413-6 PubMed
Nat Rev Microbiol. 2003 Oct;1(1):35-44 PubMed
J Mol Evol. 1988 Dec-1989 Feb;28(1-2):98-112 PubMed
Int J Syst Bacteriol. 1997 Jul;47(3):863-9 PubMed
Microbiol Rev. 1987 Jun;51(2):221-71 PubMed
PCR Methods Appl. 1991 Aug;1(1):51-6 PubMed
Microb Ecol. 1986 Mar;12(1):155-72 PubMed
Syst Appl Microbiol. 1985;6:143-51 PubMed
