Fluorescence-based high-throughput screening of dicer cleavage activity
Jazyk angličtina Země Spojené státy americké Médium print-electronic
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
PubMed
23945873
DOI
10.1177/1087057113497400
PII: 1087057113497400
Knihovny.cz E-zdroje
- Klíčová slova
- Dicer, high-throughput screening, siRNA,
- MeSH
- buněčné linie MeSH
- fluorescenční spektrometrie metody MeSH
- knihovny malých molekul MeSH
- lidé MeSH
- objevování léků MeSH
- reprodukovatelnost výsledků MeSH
- ribonukleasa III antagonisté a inhibitory genetika metabolismus MeSH
- rychlé screeningové testy * MeSH
- substrátová specifita MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- knihovny malých molekul MeSH
- ribonukleasa III MeSH
Production of small RNAs by ribonuclease III Dicer is a key step in microRNA and RNA interference pathways, which employ Dicer-produced small RNAs as sequence-specific silencing guides. Further studies and manipulations of microRNA and RNA interference pathways would benefit from identification of small-molecule modulators. Here, we report a study of a fluorescence-based in vitro Dicer cleavage assay, which was adapted for high-throughput screening. The kinetic assay can be performed under single-turnover conditions (35 nM substrate and 70 nM Dicer) in a small volume (5 µL), which makes it suitable for high-throughput screening in a 1536-well format. As a proof of principle, a small library of bioactive compounds was analyzed, demonstrating potential of the assay.
Citace poskytuje Crossref.org
