Development of a PCR assay based on the 16S-23S rDNA internal transcribed spacer for identification of strictly anaerobic bacterium Zymophilus
Jazyk angličtina Země Anglie, Velká Británie Médium print-electronic
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
PubMed
25725268
DOI
10.1016/j.anaerobe.2015.02.004
PII: S1075-9964(15)00025-6
Knihovny.cz E-zdroje
- Klíčová slova
- Brewing microbiology, PCR, Strictly anaerobic bacteria, Yeast contamination, Zymophilus paucivorans, Zymophilus raffinosivorans,
- MeSH
- anaerobióza MeSH
- anaerobní bakterie klasifikace genetika metabolismus MeSH
- intergenová DNA chemie genetika MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- RNA ribozomální chemie genetika MeSH
- sekvence nukleotidů MeSH
- sekvenční seřazení MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- intergenová DNA MeSH
- RNA ribozomální MeSH
PCR-primers were designed for identification of strictly anaerobic bacteria of the genus Zymophilus based on genus-specific sequences of the 16S-23S rDNA internal transcribed spacer region. The specificity of the primers was tested against 37 brewery-related non-target microorganisms that could potentially occur in the same brewery specimens. None DNA was amplified from any of the non-Zymophilus strains tested including genera from the same family (Pectinatus, Megasphaera, Selenomonas), showing thus 100% specificity. PCR assay developed in this study allows an extension of the spectra of detected beer spoilage microorganisms in brewery laboratories.
Citace poskytuje Crossref.org
