6-Aryl-4-amino-pyrimido[4,5-b]indole 2'-deoxyribonucleoside triphosphates (benzo-fused 7-deaza-dATP analogues): Synthesis, fluorescent properties, enzymatic incorporation into DNA and DNA-protein binding study
Jazyk angličtina Země Velká Británie, Anglie Médium print-electronic
Typ dokumentu časopisecké články
PubMed
27498304
DOI
10.1016/j.bmc.2016.07.054
PII: S0968-0896(16)30577-6
Knihovny.cz E-zdroje
- Klíčová slova
- DNA polymerase, Deazapurines, Fluorescence, Nucleosides, Nucleotides, Pyrimidoindoles,
- MeSH
- chybné párování bází MeSH
- deoxyadeninnukleotidy chemická syntéza chemie metabolismus MeSH
- deoxyribonukleosidy chemická syntéza chemie metabolismus MeSH
- DNA vazebné proteiny chemie metabolismus MeSH
- DNA-dependentní DNA-polymerasy metabolismus MeSH
- Escherichia coli chemie metabolismus MeSH
- fluorescenční barviva chemická syntéza chemie metabolismus MeSH
- fluorescenční spektrometrie MeSH
- indoly chemická syntéza chemie metabolismus MeSH
- oligonukleotidové sondy chemická syntéza chemie metabolismus MeSH
- proteiny z Escherichia coli chemie metabolismus MeSH
- sekvence nukleotidů MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Názvy látek
- 2'-deoxyadenosine triphosphate MeSH Prohlížeč
- deoxyadeninnukleotidy MeSH
- deoxyribonukleosidy MeSH
- DNA vazebné proteiny MeSH
- DNA-dependentní DNA-polymerasy MeSH
- fluorescenční barviva MeSH
- indoly MeSH
- oligonukleotidové sondy MeSH
- proteiny z Escherichia coli MeSH
- SSB protein, E coli MeSH Prohlížeč
Four 6-substituted 4-amino-pyrimido[4,5-b]indole 2'-deoxyribonucleoside triphosphates (dA(BX)TPs) were prepared by glycosylation of 4,6-dichloropyrimidoindole followed by ammonolysis, cross-coupling and triphosphorylation. They were found to be moderate to good substrates for DNA polymerases in primer extension. They also exerted fluorescence with emission maxima 335-378nm. When incorporated to oligonucleotide probes, they did not show significant mismatch discrimination but the 6-benzofuryl 4-amino-pyrimido[4,5-b]indole nucleotide displayed a useful sensitivity to protein binding in experiment with SSB protein.
Citace poskytuje Crossref.org
Synthesis and Biological Profiling of Quinolino-Fused 7-Deazapurine Nucleosides
