Stable Isotope Probing Techniques and Methodological Considerations Using 15N
Jazyk angličtina Země Spojené státy americké Médium print
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
- Klíčová slova
- 15N, Amplicon sequencing, BNF, DNA-SIP, Diazotrophs, Nitrogen, RNA-SIP,
- MeSH
- bakteriální RNA chemie genetika izolace a purifikace metabolismus MeSH
- bakterie fixující dusík genetika metabolismus MeSH
- centrifugace - gradient hustoty MeSH
- DNA bakterií chemie genetika izolace a purifikace metabolismus MeSH
- fixace dusíku genetika fyziologie MeSH
- izotopové značení metody MeSH
- izotopy dusíku metabolismus MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- bakteriální RNA MeSH
- DNA bakterií MeSH
- izotopy dusíku MeSH
- Nitrogen-15 MeSH Prohlížeč
Nitrogen fixation and assimilation processes are vital to the functioning of any ecosystem. Nevertheless, studying these processes using 15N-based stable isotope probing was so far limited because of technical challenges related to the relative rarity of nitrogen in nucleic acids and proteins compared to carbon, and because of its absence in lipids. However, the recent adoption of high-throughput sequencing and statistical modelling methods to SIP studies increased the sensitivity of the method and enabled overcoming some of the challenges. This chapter describes in detail how to perform DNA- and RNA-SIP using 15N.
Citace poskytuje Crossref.org