methyl CpG vazebná doména [Methyl CpG Binding Domain]

tematický
Termíny

methyl-CpG vazebná doména
metyl-CpG vazebná doména

 

Methyl CpG DNA Binding Domain

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/D000070593
Definice

Proteinová doména o délce přibližně 70 aminokyselin, která tvoří sendvičovou strukturu z beta-skládaného listu, alfa-helixu a C-koncové vlásenky. Vzniká tak vazebné místo pro hydrofobní methylovanou DNA. Váže se na methylované CpG ostrůvky eukaryot a vyskytuje se spolu s dalšími vazebnými doménami pro DNA a chromatin (např. motivy AT-kotvy) v DNA vazebných proteinech eukaryot.

A protein domain of about 70 amino acids in length that folds into a sandwich structure consisting of a beta sheet, alpha helix, and C-terminal hairpin loop which forms a hydrophobic methylated-DNA binding patch. It binds to methylated CPG ISLANDS in eukaryotes and occurs with other DNA and CHROMATIN binding domains such as AT-HOOK MOTIFS in eukaryotic DNA BINDING PROTEINS.

DUI
D000070593 MeSH Prohlížeč
CUI
M000611074
Předchozí užití
DNA-Binding Proteins (1993-2016)
Historická pozn.
2017
Veřejná pozn.
2017

G Jevy a procesy
G02.111.570 molekulární struktura 1 313
G02.111.570.820 molekulární konformace 228
G02.111.570.820.709 konformace proteinů 556
G02.111.570.820.709.275 strukturní prvky proteinů 1
G02.111.570.820.709.275.750 proteinové domény 178
G02.111.570.820.709.275.750.125 C2 domény
G02.111.570.820.709.275.750.157 moduly vázající sacharidy
G02.111.570.820.709.275.750.188 katalytická doména 217
G02.111.570.820.709.275.750.219 diskoidinová doména
G02.111.570.820.709.275.750.235 domény HMG-Box 2
G02.111.570.820.709.275.750.250 imunoglobulinové domény 4
G02.111.570.820.709.275.750.375 kringl 2
G02.111.570.820.709.275.750.438 methyl CpG vazebná doména
G02.111.570.820.709.275.750.469 PH-doména 2
G02.111.570.820.709.275.750.477 PR-SET-domény
G02.111.570.820.709.275.750.485 proteinové domény bohaté na prolin 3
G02.111.570.820.709.275.750.500 interakční proteinové domény a motivy 95
G03 metabolické jevy zastaralé