domény HMG-Box [HMG-Box Domains]

tematický
2
Termíny

doména HMG-box
HMG-box doména
HMG-box domény

 

High Mobility Group-Box Domains
HMG-1-Box Domain
HMG-Box Domain

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/D024742
Definice

DNA-vazebná doména přítomná v proteinech nadrodiny HMG-box, kam patří archetypální proteiny HMGB, řada sekvenčně specifických transkripčních faktorů a další DNA vazebné proteiny. Tyto domény se skládají ze sedmdesáti až osmdesáti aminokyselin, které vytváří tři α-helixy uspořádané do tvaru písmene L. Tato doména rozeznává a/nebo indukuje specifické struktury DNA a ovlivňuje přístup DNA k dalším proteinům, které se účastní transkripce, rekombinace nebo opravy DNA (ale ne všechny proteiny s vysokou pohyblivostí obsahují tuto doménu).

DNA-binding domains present in proteins of the HMG-box superfamily including the archetypal HMGB PROTEINS, a number of sequence specific TRANSCRIPTION FACTORS, and other DNA-BINDING PROTEINS. The domains consist of 70-80 amino acids that form an L-shaped fold from three alpha-helical segments. The domain has the capacity to recognize and/or induce specific DNA structures and effect the accessibility of the DNA to other proteins involved in transcription, recombination, or DNA repair. (Note that not all HIGH MOBILITY GROUP PROTEINS contain this domain.)

Anotace
HIGH MOBILITY GROUP PROTEINS is also available
DUI
D024742 MeSH Prohlížeč
CUI
M0371731
Předchozí užití
High Mobility Group Proteins (1991-2001)
Historická pozn.
2002
Veřejná pozn.
2002

G Jevy a procesy
G02.111.570 molekulární struktura 1 314
G02.111.570.820 molekulární konformace 228
G02.111.570.820.709 konformace proteinů 556
G02.111.570.820.709.275 strukturní prvky proteinů 1
G02.111.570.820.709.275.750 proteinové domény 178
G02.111.570.820.709.275.750.125 C2 domény
G02.111.570.820.709.275.750.157 moduly vázající sacharidy
G02.111.570.820.709.275.750.188 katalytická doména 217
G02.111.570.820.709.275.750.219 diskoidinová doména
G02.111.570.820.709.275.750.235 domény HMG-Box 2
G02.111.570.820.709.275.750.250 imunoglobulinové domény 4
G02.111.570.820.709.275.750.375 kringl 2
G02.111.570.820.709.275.750.438 methyl CpG vazebná doména
G02.111.570.820.709.275.750.469 PH-doména 2
G02.111.570.820.709.275.750.477 PR-SET-domény
G02.111.570.820.709.275.750.485 proteinové domény bohaté na prolin 3
G02.111.570.820.709.275.750.500 interakční proteinové domény a motivy 95
G03 metabolické jevy zastaralé