zinkové prsty [Zinc Fingers]

tematický
28
Termíny

DNA vazebné domény s motivem zinkových prstů
DNA vazebné domény se zinkovými prsty
DNA vazebné domény zinkových prstů
domény zinkových prstů vázající DNA
motiv zinkových prstů
motivy zinkových prstů
zinkový prst

 

Zinc Finger DNA-Binding Domains
Zinc Finger Motifs

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/D016335
Definice

Strukturní motivy běžně nacházené u celé řady bílkovin. Umožňují především vazbu daných bílkovin na DNA (a RNA) a jsou proto součástí celé řady tzv. transkripčních faktorů. Jsou tvořeny zhruba třiceti aminokyselinami, které ion zinku drží v prostorové „prstové“ konfiguraci. Klasický zinkový prst se skládá z jednoho alfa-helixu a jednoho beta-skládaného listu, které jsou uspořádány paralelně vedle sebe a vytváří mezi sebou vazebné místo pro zinek koordinačně navázaný na cysteinový a histidinový zbytek. (upraveno podle Wikipedie 2022 http://www.cs.wikipedia.org/)

Motifs in DNA- and RNA-binding proteins whose amino acids are folded into a single structural unit around a zinc atom. In the classic zinc finger, one zinc atom is bound to two cysteines and two histidines. In between the cysteines and histidines are 12 residues which form a DNA binding fingertip. By variations in the composition of the sequences in the fingertip and the number and spacing of tandem repeats of the motif, zinc fingers can form a large number of different sequence specific binding sites.

DUI
D016335 MeSH Prohlížeč
CUI
M0024968
Předchozí užití
DNA-Binding Proteins (1987-1990); Amino Acid Sequence (1987-1990); Molecular Sequence Data (1988-1990)
Historická pozn.
91
Veřejná pozn.
91

G Jevy a procesy
G02.111.570 molekulární struktura 1 314
G02.111.570.820 molekulární konformace 228
G02.111.570.820.709 konformace proteinů 556
G02.111.570.820.709.275 strukturní prvky proteinů 1
G02.111.570.820.709.275.500 aminokyselinové motivy 101
G02.111.570.820.709.275.500.030 ankyrinová repetice 9
G02.111.570.820.709.275.500.050 AT-hook motivy 1
G02.111.570.820.709.275.500.127 motivy cysteinového uzlu
G02.111.570.820.709.275.500.205 F-box motivy
G02.111.570.820.709.275.500.360 motiv helix-loop-helix
G02.111.570.820.709.275.500.440 ITAM motiv
G02.111.570.820.709.275.500.480 ITIM motiv
G02.111.570.820.709.275.500.490 Kazalovy motivy
G02.111.570.820.709.275.500.500 motiv kelch 1
G02.111.570.820.709.275.500.520 leucinové zipy 4
G02.111.570.820.709.275.500.695 vazebný motiv pro poly-ADP-ribosu
G02.111.570.820.709.275.500.869 RNA vazebné motivy
G02.111.570.820.709.275.500.898 sterilní alfa motiv
G02.111.570.820.709.275.500.913 AAA doména 1
G02.111.570.820.709.275.500.920 tetratrikopeptidová repetice
G02.111.570.820.709.275.500.927 WD40 repetice
G02.111.570.820.709.275.500.985 zinkové prsty 28
G02.111.570.820.709.275.500.985.250 zinkové prsty C2H2
G02.111.570.820.709.275.500.985.375 MYND doména
G02.111.570.820.709.275.500.985.438 zinkové prsty PHD
G02.111.570.820.709.275.500.985.500 domény RING-prstů 1
G03 metabolické jevy zastaralé
G03 metabolismus 1 197

Grt1 protein, S pombe Chemical MeSH Prohlížeč

Zfand6 protein, mouse Chemical MeSH Prohlížeč