- MeSH
- biostatistika * metody MeSH
- interpretace statistických dat MeSH
- klinická studie jako téma MeSH
- kongresy jako téma MeSH
- lidé MeSH
- statistika jako téma MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- novinové články MeSH
- zprávy MeSH
- MeSH
- biostatistika metody MeSH
- interpretace statistických dat MeSH
- kardiologie * MeSH
- kardiologové MeSH
- klinická studie jako téma * klasifikace metody MeSH
- lidé MeSH
- medicína založená na důkazech MeSH
- randomizované kontrolované studie jako téma metody MeSH
- stanovení cílového parametru metody MeSH
- statistika jako téma metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- MeSH
- biomedicínský výzkum MeSH
- biostatistika * metody MeSH
- multivariační analýza MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
The aim of this paper is to overview challenges and principles of Big Data analysis in biomedicine. Recent multivariate statistical approaches to complexity reduction represent a useful (and often irreplaceable) methodology allowing performing a reliable Big Data analysis. Attention is paid to principal component analysis, partial least squares, and variable selection based on maximizing conditional entropy. Some important problems as well as ideas of complexity reduction are illustrated on examples from biomedical research tasks. These include high-dimensional data in the form of facial images or gene expression measurements from a cardiovascular genetic study.
- MeSH
- analýza dat MeSH
- analýza hlavních komponent metody MeSH
- big data * MeSH
- biostatistika * metody MeSH
- kardiovaskulární nemoci genetika prevence a kontrola MeSH
- lidé MeSH
- metoda nejmenších čtverců MeSH
- riziko MeSH
- rozpoznání obličeje MeSH
- systémy pro podporu klinického rozhodování MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Každý badatel čas od času čelí problému správného výběru statistické metody, která by měla být aplikována, aby vhodně analyzovala jeho data. Naší snahou je zjednodušit tento proces ve smyslu vytvoření webové aplikace, která nabízí pomocnou ruku výzkumníkovi, který řeší statistickou analýzu ve své práci. Aplikace je vytvořena pomocí jazyka R a jednoho z jeho balíčků, Shiny, a je volně dostupná online. R je otevřený programovací jazyk a prostředí věnované zejména statistickým výpočtům a následným grafickým náhledům. Aplikace je dostupná na R-serveru 1. lékařské fakulty Univerzity Karlovy na http://shiny.statest.cz:3838/statisticke_nastroje/ a je založena na vývojovém diagramu navigujícím k aplikovatelné statistické metodě. Integrovaný vývojový diagram umožňuje výzkumníkovi vybrat nejvhodnější statistickou metodu ve smyslu průchodu diagramem krok po kroku tak, jak výzkumník dělá rozhodnutí odpovídáním na kladené otázky. Po určení nejvhodnější metody je přímým odkazem přesměrován na záložku aplikace, která nabízí provedení dané metody nad daty, která badatel do aplikace nahrál. Poskytnutí uživatelsky přátelské aplikace a vývojového diagramu mapujícího rozhodovací proces potenciálních statistických metod a vybírající tu nejvhodnější považujeme za cestu, jak tento proces zjednodušit. Přímé spojení – pomocí odkazu – mezi návrhem metody a záložkou s její realizací může zlepšit uživatelský komfort.
- MeSH
- biostatistika metody MeSH
- interpretace statistických dat MeSH
- kardiologie * MeSH
- kardiologové MeSH
- klinická studie jako téma * klasifikace metody MeSH
- lidé MeSH
- medicína založená na důkazech MeSH
- randomizované kontrolované studie jako téma metody MeSH
- stanovení cílového parametru metody MeSH
- statistika jako téma metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
A statistical method was developed to test for equivalence of microbial communities analysed by next-generation sequencing of amplicons. The test uses Bray-Curtis distances between the microbial community structures and is based on a two-sample jackknife procedure. This approach was applied to investigate putative effects of the antifungal biocontrol strain RU47 on fungal communities in three arable soils which were analysed by high-throughput ITS amplicon sequencing. Two contrasting workflows to produce abundance tables of operational taxonomic units from sequence data were applied. For both, the developed test indicated highly significant equivalence of the fungal communities with or without previous exposure to RU47 for all soil types, with reference to fungal community differences in conjunction with field site or cropping history. However, minor effects of RU47 on fungal communities were statistically significant using highly sensitive multivariate tests. Nearly all fungal taxa responding to RU47 increased in relative abundance indicating the absence of ecotoxicological effects. Use of the developed equivalence test is not restricted to evaluate effects on soil microbial communities by inoculants for biocontrol, bioremediation or other purposes, but could also be applied for biosafety assessment of compounds like pesticides, or genetically engineered plants.
- MeSH
- biologická kontrola škůdců metody MeSH
- biostatistika metody MeSH
- DNA fungální chemie genetika MeSH
- fylogeneze MeSH
- houby klasifikace růst a vývoj izolace a purifikace MeSH
- mezerníky ribozomální DNA chemie genetika MeSH
- očkovadla agrotechnická * MeSH
- Pseudomonas růst a vývoj MeSH
- půdní mikrobiologie * MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- shluková analýza MeSH
- společenstvo * MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Gregor Mendel is generally acknowledged not only as the founder of genetics but also as the author of the first mathematical result in biology. Although his education had been questioned for a long time, he was profoundly educated in botany as well as physics and in those parts of mathematics (combinatorics, probability theory) applied in his later pea plants experiments. Nevertheless, there remain debates in statistical literature about the reasons why are Mendel’s results in such a too good accordance with expected values [22, 28]. The main aim of this paper is to propose new two-stage statistical models, which are in a better accordance with Mendel’s data than a classical model, where the latter considers a fixed sample size. If Mendel realized his experiments following such two-stage algorithm, which cannot be however proven, the results would purify Mendel’s legacy and remove the suspicions that he modified the results. Mendel’s experiments are described from a statistical point of view and his data are shown to be close to randomly generated data from the novel models. Such model is found as the most suitable, which is remarkably simpler according to the model of [28], while the new model yields only slightly weaker results. The paper also discusses Mendel’s legacy from the point of view of biostatistics.
Introduction. Research on celiac disease is based on a descriptive and inferential variety of techniques that allow summarizing data and extrapolating the target population. The aim of this study was to identify descriptive and inferential statistical methods used in International Journal of Celiac Disease. Material and method. The sample of this study was defined based on all original articles published in the journal mentioned above in 2013-2014 period. We evaluated the descriptive statistics, the number and type of inferential statistical methods used. Results. Of the eight articles analyzed, one study was a randomzat clinical trial, the remaining studies were cross-sectional studies. The articles have used both quantitative and qualitative data. The indicator of central tendency on data was mean (n = 5, 62.5 %) or the median with interquartile range (n = 1, 12.5 %) and the dispersion of data was estimatedonly by the standard deviation in 5 studies (62.5 %). Quantitative data were used in raw form, except for one study using Z scores. Qualitative data were summarized using absolute and relative frequencies (n = 7, 87.5 %). The statistical software was mentioned in all studies. All articles except one used the inferential statistical methods or statistical tests. Most articles (87.5 %) used common tests as Student’s t- test (37.5), analysis of variance/covariance (25 %), Kruskal -Wallis test (12.5 %), χ2 test (50 %), and Fisher’s exact test (12.5 %). A specified significance level was noted in 62.5 % of the articles and the significance level was estimated in 6 studies (75 %). Conclusion. Results showed that a proper understanding of standard statistical methods leads to a proper interpretation of clinical research hypothesis. If necessary, the advanced statistical analysis should be performed by a multidisciplinary collaboration with specialists in biostatistics or epidemiology.
- MeSH
- biostatistika metody MeSH
- celiakie * diagnóza epidemiologie MeSH
- dítě MeSH
- epidemiologické studie MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- průřezové studie MeSH
- randomizované kontrolované studie jako téma MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Vyšetřování kloubních vzorců je jedním z mnoha způsobů, jak odhalit patologie měkkých tkání. Jedná se o vyšetřování kloubní pohyblivosti daného kloubu. Omezení této hybnosti naznačuje poškození struktur, které ovlivňují provedení izolovaného pohybu v kloubním spojení. K identifikaci se klasicky používají pasivní a aktivní testy rozsahu pohybu prováděné fyzioterapeutem. Takzvané kloubní blokády mohou mít za následek reaktivní změny napětí kosterních svalů. Cílem této studie je vyvinout a otestovat experiment, který by nám umožnil vyhodnocovat pomocí povrchového EMG vedení flexních a extenčních řetězců při umělém vytvoření kloubních blokád za použití reflexních podpatěnek.
- MeSH
- biostatistika metody přístrojové vybavení MeSH
- dospělí MeSH
- elektrody MeSH
- elektromyografie * metody přístrojové vybavení MeSH
- kloubní pouzdro * patofyziologie MeSH
- lidé MeSH
- počítačové zpracování signálu * MeSH
- rozsah kloubních pohybů * fyziologie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
