Bakterie komplexu Burkholderia cepacia vyvolávají závažné plicní infekce především u pacientů s cystickou fibrózou (CF). Nebezpečí epidemického šíření infekce v komunitě nemocných s touto diagnózou si vyžádalo zavést přísná izolační opatření a správně a včas mikrobiálního původce identifikovat. Tento souborný referát přibližuje taxonomii komplexu B. cepacia, možnosti laboratorní diagnostiky všech jeho zástupců a popisuje epidemiologickou situaci v komunitách nemocných CF u nás i ve světě.
Bacteria of the Burkholderia cepacia complex are the cause of severe lung infections primarily in patients with cystic fibrosis (CF). The risk of epidemic spread of the pathogen in the community of CF patients was the reason for implementing strict isolation measures and identifying the bacterium as early as possible. This review article features the taxonomy of the Burkholderia cepacia complex, possibilities for the laboratory diagnosis of all representatives of this complex, and epidemiological situation in the communities of CF patients in the Czech Republic and in the world.
- Klíčová slova
- epidemický kmen,
- MeSH
- Burkholderia cepacia komplex * genetika izolace a purifikace patogenita MeSH
- cystická fibróza * komplikace mikrobiologie MeSH
- DNA bakterií MeSH
- epidemický výskyt choroby prevence a kontrola MeSH
- infekce bakteriemi rodu Burkholderia * diagnóza epidemiologie prevence a kontrola přenos MeSH
- infekce dýchací soustavy komplikace mikrobiologie prevence a kontrola MeSH
- izolace pacientů MeSH
- kontrola infekce metody MeSH
- lidé MeSH
- multilokusová sekvenční typizace MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- pulzní gelová elektroforéza MeSH
- RecA-rekombinasy genetika MeSH
- sputum mikrobiologie MeSH
- technika náhodné amplifikace polymorfní DNA MeSH
- techniky typizace bakterií MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
Cíl práce: Cílem práce bylo zhodnotit epidemiologickou situaci kmenů komplexu Burkholderia cepacia izolovaných na Ústavu mikrobiologie Lékařské fakulty Univerzity Palackého a Fakultní nemocnice Olomouc, zjistit nejčastější zástupce a prokázat, nebo vyvrátit možnost klonálního šíření těchto kmenů. Metodika: V průběhu osmi měsíců byly sbírány veškeré kmeny určené jako Burkholderia cepacia komplex. Byla stanovena citlivost na vybrané antimikrobiální přípravky a pomocí vhodných molekulárně genetických metod se zjišťovala jejich genetická příbuznost. Výsledky: Celkem bylo testováno 52 izolátů, nejčastěji (88,5 %) se jednalo o genomovar II (Burkholderia multivorans). Více než 46 % z nich bylo geneticky příbuzných a 58,3 % bylo zachyceno na jednotkách intenzivní péče. Všechny izoláty vykazovaly značnou rezistenci k antimikrobiálním přípravkům a úmrtí spojené s infekcí Burkholderia multivorans bylo popsáno ve čtyřech případech. Závěr: Lze předpokládat šíření geneticky příbuzných kmenů Burkholderia multivorans z nemocničního prostředí. Zdroj infekce zatím nebyl zjištěn a je třeba dalšího šetření.
Background: The aim was to assess the epidemiology of Burkholderia cepacia complex strains isolated at the Department of Microbiology, Faculty of Medicine and Dentistry, Palacký University and University Hospital Olomouc, determine the most frequent strains and confirm or rule out potential clonal spread of the strains. Material and methods: Over a period of eight months, all strains classified as Burkholderia cepacia complex were collected. Susceptibility to selected antimicrobial agents was determined and adequate molecular genetic methods were used to assess their genetic relationship. Results: A total of 52 isolates were tested, with the most frequent (88.5 %) being genomovar II (Burkholderia multivorans). More than 46 % of them were genetically related; 58.3 % of them were detected in intensive care units. All isolates were highly resistant to antimicrobial agents. In four cases, deaths associated with Burkholderia multivorans infection were reported. Conclusion: It may be assumed that genetically related strains of Burkholderia multivorans spread from the hospital setting. As yet, the source of infection has not been determined and further investigations are needed.
- Klíčová slova
- Burkholderia multivorans, klonalita, rezistence,
- MeSH
- bakteriální léková rezistence genetika MeSH
- Burkholderia cepacia komplex genetika izolace a purifikace patogenita MeSH
- financování organizované MeSH
- genom bakteriální genetika MeSH
- hospitalizovaní pacienti MeSH
- infekce bakteriemi rodu Burkholderia epidemiologie mikrobiologie MeSH
- infekce spojené se zdravotní péčí mikrobiologie MeSH
- jednotky intenzivní péče MeSH
- kohortové studie MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiální testy citlivosti statistika a číselné údaje MeSH
- molekulární epidemiologie metody MeSH
- polymerázová řetězová reakce statistika a číselné údaje MeSH
- technika náhodné amplifikace polymorfní DNA statistika a číselné údaje MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Úvod: Transplantace plic (LuTx) je zavedenou metodou léčby pokročilých stadií plicních onemocnění včetně cystické fibrózy (CF). Literární data svědčí o horších výsledcích v případě kolonizace dýchacích cest komplexem Burkholderia cepacia (BCC). Metodika: Zhodnocení výsledků LuTx u nemocných CF s ohledem na kolonizaci BCC v Transplantačním centru FN Motol v období 1998-2011. Výsledky: Ve sledovaném období byla provedena LuTx u 29 nemocných s CF, z nich bylo BCC kolonizováno 7 pacientů. K datu 31. 12. 2011 v tomto souboru přežívalo 15 nemocných, mezi nimi dva s kolonizací BCC. Medián přežití nemocných CF po LuTx byl v případě kolonizace BCC 0,66 roku, kdežto u pacientů bez kolonizace BCC 6,82 roku (p = 0,013). Jedno a pětileté přežití činilo 58 % a 29 % u kolonizovaných BCC oproti 87 % a 60 % u pacientů bez kolonizace BCC. Závěr: Uvedené výsledky potvrzují horší prognózu nemocných CF po LuTx v případě kolonizace BCC.
Introduction: Lung transplantation (LuTx) is an estabilished treatment method in advanced lung diseases ineluding cystic fibrosis (CF). Worse results were published in patients with airway colonization with Burkholderia cepacia complex (BCC). Methods: Evaluation of LuTx results in CF patients with regard to BCC colonization in the Transplant Center of University Hospital Motol during the 1998-2011 period. Results: During the reported period, LuTx was performed in 29 CF patients, of which 7 patients were colonized With BCC. As of 31 December 2011, 15 patients were alive, including 2 with BCC colonization. The median survival was 0.66 years in BCC-colonized patients as compared to 6.82 years (p = 0.013) in those without BCC colonization. The 1- and 5-year survival rates were 58 % and 29 %, respectively, in BCC colonized patients versus 87 % and 60 %, respectively, in those without BCC colonization. Conclusions: Our results confirm worse prognosis of LuTx in CF patients with BCC colonization.
- MeSH
- analýza přežití * MeSH
- Burkholderia cepacia komplex * izolace a purifikace patogenita účinky léků MeSH
- cystická fibróza * komplikace terapie MeSH
- infekce bakteriemi rodu Burkholderia komplikace MeSH
- infekce dýchací soustavy * epidemiologie mikrobiologie MeSH
- lidé MeSH
- pooperační komplikace etiologie mortalita MeSH
- prognóza MeSH
- transplantace plic kontraindikace využití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Burkholderia cepacia complex (Bcc) bacteria have gained notoriety as pathogens in cystic fibrosis (CF) because they are difficult to identify and treat, and also have the ability to spread between CF individuals. Of the 17 formally named species within the complex, Burkholderia multivorans and Burkholderia cenocepacia dominate in CF. Multilocus sequence typing has proven to be a very useful tool for tracing the global epidemiology of Bcc bacteria and has shown that B. cenocepacia strains with high transmissibility, such as the ET-12 strain (ST-28) and the Czech strain (ST-32), have spread epidemically within CF populations in Canada and Europe. The majority of research on the molecular pathogenesis of Bcc bacteria has focused on the B. cenocepacia ET-12 epidemic lineage, with gene mutation, genome sequence analysis and, most recently, global gene expression studies shedding considerable light on the virulence and antimicrobial resistance of this pathogen. These studies demonstrate that the ability of B. cenocepacia to acquire foreign DNA (genomic islands, insertion sequences and other mobile elements), regulate gene expression via quorum sensing, compete for iron during infection, and mediate antimicrobial resistance and inflammation via its membrane and surface polysaccharides are key features that underpin the virulence of different strains. With the wealth of molecular knowledge acquired in the last decade on B. cenocepacia strains, we are now in a much better position to develop strategies for the treatment of pathogenic colonization with Bcc and to answer key questions on pathogenesis concerning, for example, the factors that trigger the rapid clinical decline in CF patients.
- MeSH
- bakteriální léková rezistence MeSH
- bakteriální polysacharidy fyziologie MeSH
- Burkholderia cenocepacia klasifikace genetika izolace a purifikace patogenita MeSH
- Burkholderia cepacia komplex klasifikace genetika izolace a purifikace patogenita MeSH
- cystická fibróza genetika mikrobiologie MeSH
- exprese genu MeSH
- infekce bakteriemi rodu Burkholderia komplikace epidemiologie mikrobiologie MeSH
- infekce dýchací soustavy komplikace epidemiologie mikrobiologie MeSH
- lidé MeSH
- molekulární epidemiologie MeSH
- multilokusová sekvenční typizace metody MeSH
- mutace MeSH
- quorum sensing MeSH
- rozptýlené repetitivní sekvence MeSH
- virulence genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
- Geografické názvy
- Evropa MeSH
- Kanada MeSH