x

x

• MeSH
• leukocidiny * izolace a purifikace   MeSH
• lidé MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• stafylokokové infekce diagnóza   patologie   MeSH
• Staphylococcus * izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

The virulence factors, antibiotic resistance patterns, and the associated genetic elements have been investigated in Staphylococcus species. A total of 100 strains has been isolated from clinical samples in the Microbiology Laboratory of Hesperia Hospital, Modena, Italy, and identified as Staphylococcus aureus (65), Staphylococcus epidermidis (24), Staphylococcus hominis (3), Staphylococcus saprophyticus (3), and Staphylococcus warneri (5). All the strains were analyzed to determine phenotypic and genotypic characters, notably the virulence factors, the antibiotics susceptibility, and the genetic determinants. The highest percentage of resistance in Staphylococcus spp. was found for erythromycin and benzylpenicillin (87% and 85%, respectively). All S. aureus, two S. epidermidis (8.3%), and one S. saprophyticus (33.3%) strains were resistant to oxacillin. The methicillin resistance gene (mecA) was detected by polymerase chain reaction (PCR) amplification in 65 S. aureus strains and in 3 coagulase-negative staphylococci (CoNS) (8.6%). With regard to the virulence characteristics, all the S. aureus were positive to all virulence tests, except for slime test. Among the CoNS isolates, 19 (79.1%) S. epidermidis and one (33.3%) S. saprophyticus strains resulted positive for the slime test only. The results obtained are useful for a more in-depth understanding of the function and contribution of S. aureus and CoNS antibiotic resistance and virulence factors to staphylococcal infections. In particular, the production of slime is very important for CoNS, a virulence factor frequently found in infections caused by these strains. Further investigations on the genetic relatedness among strains of different sources will be useful for epidemiological and monitoring purposes and will enable us to develop new strategies to counteract the diffusion of methicillin-resistant S. aureus (MRSA) and CoNS strains not only in clinical field, but also in other related environments.

• MeSH
• antibakteriální látky * farmakologie   MeSH
• bakteriální léková rezistence * MeSH
• bakteriální proteiny genetika   MeSH
• faktory virulence * genetika   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti * MeSH
• stafylokokové infekce * mikrobiologie   MeSH
• Staphylococcus * genetika   účinky léků   izolace a purifikace   patogenita   klasifikace   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Itálie MeSH

Národní referenční laboratoř pro stafylokoky CEM SZÚ se i v roce 2021, v rámci zajištění surveillance stafylokokových infekcí, věnovala podrobnému vyšetřování kmenů stafylokoků z humánního klinického materiálu. Celkem to bylo 659 kmenů, převážně druhu Staphylococcus aureus, které byly zaslány asi z 90 bakteriologických pracovišť z celé České republiky. Metodou PCR byla zjišťována přítomnost genů kódujících především Pantonův - Valentinův leukocidin, toxin Syndromu toxického šoku, exfoliatiny A, B, D a enterotoxiny A–D. Informace o produkci faktorů virulence jsou důležité pro ošetřující lékaře ke správnému stanovení klinické diagnózy a tedy i vhodné terapie. V roce 2021 jsme zaregistrovali 13 případů závažného onemocnění - syndrom toxického šoku, kdy jsme mohli potvrdit původce – toxinogenní kmen S. aureus. Pomohli jsme řešit i hromadný výskyt puchýřnatého onemocnění novorozenců v jedné porodnici, kdy byl příčinou kmen S. aureus s produkcí exfoliatinu A. V celém souboru bylo i 45 (5,9 %) kmenů koaguláza negativních stafylokoků. U těchto podmíněných patogenů jsme fenotypizací a metodou hmotnostní spektrometrie kmeny identifikovali, resp. konfirmovali identifikaci zjištěnou již v terénních laboratořích.

The main focus of the National Reference Laboratory for Staphylococci (NRL) in 2020 was again on the investigation of staphylococcal strains from human clinical specimens within the surveillance of staphylococcal infections. In total, 659 strains mostly of the species Staphylococcus aureus referred to the NRL by 90 bacteriological laboratories from all over the Czech Republic were analysed. The strains were screened by PCR for the genes encoding Panton-Valentine leukocidin, toxic shock syndrome toxin, exfoliative toxins A, B, and D, and enterotoxins A–D. Data on the production of virulence factors are helpful for attending physicians in determining the right diagnosis and effective treatment. In 2021, 13 cases of severe toxic shock syndrome were reported, with toxigenic strain of S. aureus being confirmed as the causative agent. The NRL also participated in the investigation of an outbreak of blistering skin condition in newborns in one maternity hospital where the cause of infection was an exfoliative toxin A producing strain of S. aureus. Fifty-eight strains (5.9%) referred to the NRL were coagulase-negative staphylococci. These opportunistic pathogens were identified or confirmed, after previous identification by field laboratories, by phenotyping and mass spectrometry.

• MeSH
• enterotoxiny izolace a purifikace   škodlivé účinky   MeSH
• exfoliatiny izolace a purifikace   škodlivé účinky   MeSH
• koagulasa izolace a purifikace   MeSH
• leukocidiny izolace a purifikace   škodlivé účinky   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiologické techniky MeSH
• septický šok epidemiologie   etiologie   klasifikace   MeSH
• stafylokokové infekce * epidemiologie   mortalita   patologie   prevence a kontrola   MeSH
• Staphylococcus aureus izolace a purifikace   klasifikace   patogenita   MeSH
• Staphylococcus izolace a purifikace   klasifikace   patogenita   MeSH
• statistika jako téma MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Národní referenční laboratoř pro stafylokoky CEM–SZÚ se i v roce 2019 v rámci zajištění surveillance stafylokokových infekcí věnovala podrobnému vyšetřování kmenů stafylokoků z humánního klinického materiálu. Celkem to bylo 1405 kmenů, převážně druhu Staphylococcus aureus, které byly zaslány asi z 80 bakteriologických pracovišť z celé České republiky. Metodou PCR byla zjišťována přítomnost genů kódujících především Pantonův-Valentinův leukocidin, toxin Syndromu toxického šoku, exfoliatiny a enterotoxiny. Informace o produkci faktorů virulence jsou důležité pro ošetřujících lékaře ke správnému stanovení diagnózy a tedy i vhodné terapie. V celém souboru bylo i 79 (5,6 %) kmenů koaguláza negativních stafylokoků. U těchto podmíněných patogenů jsme fenotypizací a metodou hmotnostní spektrometrie kmeny identifikovali, resp. konfirmovali identifikaci zjištěnou již v terénních laboratořích.

The main focus of the National Reference Laboratory for Staphylococci (NRL) in 2019 was again on the investigation of staphylococcal strains from human clinical specimens within the surveillance of staphylococcal infections. In total, 1405 strains mostly of the species Staphylococcus aureus referred to the NRL by 80 bacteriological laboratories from all over the Czech Republic were analysed. The strains were screened by PCR for the genes encoding Panton- -Valentine leucocidin, toxic shock syndrome toxin, exfoliatins, and enterotoxins. Data on the production of virulence factors are helpful for attending physicians in determining the right diagnosis and effective treatment. Seventy-nine strains (5.6%) referred to the NRL were coagulase negative staphylococci. These opportunistic pathogens were identified or confirmed, after previous identification by field laboratories, by phenotyping and mass spectrometry.

• MeSH
• enterotoxiny izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• exotoxiny izolace a purifikace   MeSH
• koagulasa genetika   izolace a purifikace   MeSH
• leukocidiny izolace a purifikace   MeSH
• lidé MeSH
• polymerázová řetězová reakce metody   statistika a číselné údaje   MeSH
• septický šok epidemiologie   klasifikace   mikrobiologie   MeSH
• spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice metody   přístrojové vybavení   MeSH
• stafylokokové infekce * epidemiologie   genetika   klasifikace   MeSH
• Staphylococcus genetika   izolace a purifikace   klasifikace   patogenita   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Exfoliatin je stafylokokový proteolytický exoprotein, který je vlastní příčinou epidermolytických infekcí, zejména u novorozenců a malých dětí, ale i u dospělých jedinců se sníženou imunitou. Nejčastějšími původci lidských epidermolýz jsou v naší republice kmeny S. aureus s produkcí exfoliatinu A a/nebo B. Sledovali jsme produkci exfoliatinu u téměř 14 000 kmenů zaslaných ke zjištění toxigenity do NRL pro stafylokoky v letech 1998–2019. Dále jsou stručně popsány vybrané hromadné výskyty puchýřnatého onemocnění novorozenců, u nichž bylo etio-logické agens potvrzeno. Z celku 43 hromadných výskytů za uvedené období vyvolaly v 35 případech epidemii kmeny s produkcí exfoliatinu A, v jednom případě kmeny s produkcí exfoliatinu B. Ve zbývajících 7 výskytech byly původcem kmeny s produkcí obou těchto exfoliatinů.

Exfoliatin, a staphylococcal proteolytic exoprotein, is the cause of epidermolytic infections mainly in newborn and small children but also in immunocompromised adults. In the Czech Republic, the most common agents of human epidermolysis are exfoliatin A and/or B producing strains of S. aureus. The article deals with exfoliatin production in ca 14 000 strains referred to the National Reference Laboratory for Staphylococci for toxigenicity testing in 1998–2019. Selected outbreaks of neonatal blistering disease where the etiological agent was confirmed are briefly described. Of 43 outbreaks recorded in the study period, 35 were caused by exfoliatin A producing strains, one by exfoliatin B producing strain, and seven by strains producing both A and B exfoliatins.

• Klíčová slova
• puchýřkaté onemocnění novorozenců,
• MeSH
• exfoliatiny * analýza   biosyntéza   MeSH
• infekce spojené se zdravotní péčí epidemiologie   etiologie   mikrobiologie   MeSH
• lidé MeSH
• nemoci novorozenců epidemiologie   etiologie   mikrobiologie   MeSH
• novorozenec MeSH
• pemfigus epidemiologie   etiologie   mikrobiologie   MeSH
• stafylokoková toxická epidermální nekrolýza epidemiologie   etiologie   mikrobiologie   MeSH
• stafylokokové infekce kůže epidemiologie   etiologie   mikrobiologie   MeSH
• Staphylococcus aureus * genetika   izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• Staphylococcus izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• novorozenec MeSH

Staphylococcus petrasii is recently described coagulase negative staphylococcal species and an opportunistic human pathogen, still often misidentified in clinical specimens. Four subspecies are distinguished in S. petrasii by polyphasic taxonomical analyses, however a comparative study has still not been done on the majority of isolates and their genome properties have not yet been thoroughly analysed. Here, we describe the phenotypic and genotypic characteristics of 65 isolates and the results of de novo sequencing, whole genome assembly and annotation of draft genomes of five strains. The strains were identified by MALDI-TOF mass spectrometry to the species level and the majority of the strains were identified to the subspecies level by fingerprinting methods, (GTG)5 repetitive PCR and ribotyping. Macrorestriction profiling by pulsed-field gel electrophoresis was confirmed to be a suitable strain typing method. Comparative genomics revealed the presence of new mobile genetic elements carrying antimicrobial resistance factors such as staphylococcal cassette chromosome (SCC) mec, transposones, phage-inducible genomic islands, and plasmids. Their mosaic structure and similarity across coagulase-negative staphylococci and Staphylococcus aureus suggest the possible exchange of these elements. Numerous putative virulence factors such as adhesins, autolysins, exoenzymes, capsule formation genes, immunomodulators, the phage-associated sasX gene, and SCC-associated spermidine N-acetyltransferase gene, pseudouridine and sorbitol utilization operons might explain clinical manifestations of S. petrasii isolates. The increasing recovery of S. petrasii isolates from human clinical material, the multi-drug resistance including methicillin resistance of S. petrasii subsp. jettensis strains, and virulence factors homologous to other pathogenic staphylococci demonstrate the importance of the species in human disease.

• MeSH
• faktory virulence genetika   MeSH
• fenotyp MeSH
• genom bakteriální * MeSH
• genomika MeSH
• genotyp MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• pulzní gelová elektroforéza MeSH
• ribotypizace MeSH
• rozptýlené repetitivní sekvence * MeSH
• Staphylococcus klasifikace   genetika   patogenita   MeSH
• techniky typizace bakterií MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• srovnávací studie MeSH

• Klíčová slova
• Staphylococcus pseudintermedius, MLSB rezistence,
• MeSH
• bakteriální léková rezistence * MeSH
• faktory virulence * genetika   klasifikace   MeSH
• genotyp MeSH
• methicilin MeSH
• mikrobiální testy citlivosti metody   MeSH
• mnohočetná bakteriální léková rezistence MeSH
• multiplexová polymerázová řetězová reakce metody   MeSH
• psi MeSH
• stafylokokové infekce kůže * mikrobiologie   MeSH
• stafylokokové infekce mikrobiologie   MeSH
• Staphylococcus * genetika   klasifikace   patogenita   MeSH
• virulence genetika   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• psi MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Lidstvo se v současnosti potýká s důsledky neuváženého užívání antibiotik – stále rozšířenější rezistence patogenních bakteriálních druhů nutí vědce poohlížet se po jiných metodách zamezení infekcí či kolonizací povrchů těmito nevítanými hosty. Objevení mezibuněčné komunikace mikroorganismů a souvislosti quorum sensing s expresí virulentních faktorů daných mikroorganismů bylo v tomto směru rozhodně vítanou událostí. Pro správné využití quorum sensing systému ke koncepčnímu boji proti mikroorganismům je ale nejdříve potřeba mechanismy těchto systémů ovlivňujících expresi genů i mechanismy jejich ovlivňování podrobněji popsat a pochopit. Při neuvážené aplikaci by zde totiž potenciálně také mohly vzniknout problémy s rezistencí (obzvláště u intracelulárně působících quorum sensing inhibitorů).

Humanity is currently battling the consequences of its own careless behaviour regarding antibiotics – growing resistance of pathogenic bacterial species is pushing scientists to search for novel methods to fight infections and to repress colonisation of surfaces by these unwanted guests. The discovery of bacterial intercellular communication (quorum sensing) and its connection to expression of virulence factors has definitely been a great leap forward in this regard. However there has to be great caution before we use these findings to battle the microorganisms – we have to study these processes of altering gene expression to understand them. With uninformed application, new problems with resistance could arise (especially with intracellular quorum quenching molecules).

• MeSH
• Bacillus subtilis genetika   MeSH
• Bacteria klasifikace   patogenita   MeSH
• bakteriální léková rezistence MeSH
• grampozitivní bakterie * MeSH
• quorum sensing * MeSH
• Staphylococcus genetika   patogenita   MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

Plagiodera versicolora (Laicharting, 1781) (Coleoptera: Chrysomelidae) is an important forest pest which damages many trees such as willow, poplar, and hazelnut. In order to find new microbes that can be utilized as a possible microbial control agent against this pest, we investigated the culturable bacterial flora of it and tested the isolated bacteria against P. versicolora larvae and adults. We were able to isolate nine bacteria from larvae and adults. The isolates were characterized using a combination of morphological, biochemical, and physiological methods. Additionally, we sequenced the partial sequence of the 16S rRNA gene to verify conventional identification results. Based on characterization studies, the isolates were identified as Staphylococcus sp. Pv1, Rahnella sp. Pv2, Rahnella sp. Pv3, Rahnella sp. Pv4, Rahnella sp. Pv5, Pantoea agglomerans Pv6, Staphylococcus sp. Pv7, Micrococcus luteus Pv8, and Rahnella sp. Pv9. The highest insecticidal activity against larvae and adults was obtained from M. luteus Pv8 with 50 and 40 % mortalities within 10 days after treatment, respectively. Extracellular enzyme activity of the bacterial isolates such as amylase, proteinase, lipase, cellulose, and chitinase was also determined. Consequently, our results show that M. luteus Pv8 might be a good candidate as a possible microbial control agent against P. versicolora and were discussed with respect to biocontrol potential of the bacterial isolates.

• MeSH
• amylasy metabolismus   MeSH
• biologická ochrana MeSH
• brouci mikrobiologie   MeSH
• celulosa metabolismus   MeSH
• chitinasy metabolismus   MeSH
• fenotyp MeSH
• larva mikrobiologie   MeSH
• lipasa metabolismus   MeSH
• Micrococcus luteus enzymologie   izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• mikrobiota * MeSH
• Pantoea enzymologie   izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• proteasy metabolismus   MeSH
• Rahnella enzymologie   izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• RNA ribozomální 16S genetika   MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• Staphylococcus enzymologie   izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• virulence MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

V letošním roce byl popsán nový druh stafylokoka, Staphylococcus petrasii. Kmeny tohoto druhu se vyskytují v humánním klinickém materiálu a hrají zřejmě roli podmíněného patogena podobně jako řada dalších koagulázanegativních stafylokoků. Dosud byly nejspíše identifikovány jako atypické Staphylococcus warneri, s kterými jsou fenotypově nejbližší. Fylogeneticky jsou nejblíže k druhům Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus hominis, Staphylococccus devriesei a Staphylococccus lugdunensis.

A novel staphylococcal species, Staphylococcus petrasii, has recently been described. Strains of this species were isolated from human clinical specimens and are likely to be opportunistic pathogens, similarly to other coagulase- negative staphylococci. Previously, they may have been identified as atypical Staphylococcus werneri, to which they are phenotypically closest. Phylogenetically, they are closest to the species Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus hominis, Staphylococccus devriesei, and Staphylococccus lugdunensis.

• Klíčová slova
• koagulázanegativní stafylokoky, S. petrasii, taxonomie rodu Staphylococcus,
• MeSH
• fenotyp MeSH
• fylogeneze MeSH
• genotyp MeSH
• lidé MeSH
• Staphylococcus * izolace a purifikace   klasifikace   patogenita   růst a vývoj   účinky léků   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH