GLIF model Dotaz Zobrazit nápovědu
Model reprezentace znalostí obsažených v lékařských doporučeních GLIKREM (GuideLInes Knowledge REpresentation Model) vychází z GLIF modelu, který byl publikován ve specifikaci GLIF3.5. GLIKREM obsahuje některé změny a rozšíření definice a implementace původního GLIF modelu. Cílem tohoto příspěvku je popis znalostního modelu GLIKREM, jeho konstrukce, implementace v XML, realizace datového rozhraní a použití výsledného modelu.
The guideline knowledge representation system (GLIKREM) is based on a GLIF model which was published in a GLIF3.5 specification. GLIKREM contains some changes and extensions of the definition and implementation of the original GLIF model. The aim of this article is to give a description of GLIKREM, its construction, its implementation in XML, a realization of the data interface and use of the result model.
- Klíčová slova
- GLIF model,
- MeSH
- databáze faktografické MeSH
- financování organizované MeSH
- informační systémy normy MeSH
- navrhování softwaru MeSH
- rozhodování pomocí počítače MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi jako téma normy MeSH
- systémová integrace MeSH
- systémy pro podporu klinického rozhodování MeSH
- teoretické modely MeSH
- ukládání a vyhledávání informací normy MeSH
- znalostní báze MeSH
- zpracování přirozeného jazyka MeSH
Knowledge acquired in medicine is possible to represent by medical guidelines. The most important and nowadays mostly used for formalisation of guidelines is the GLIF (Guideline Interchange Format) model. Final model can be coded in XML (eXtensible Markup Language). Some situations can be modelled only very hard or no ways in a practice use. This paper describes a method of GLIF model construction and implementation in XML. The method specializes in risks of whole process and tries to find a solution to problematical model situations. The GLIF model universality is kept for any medical guidelines.
- MeSH
- jazyk (prostředek komunikace) * MeSH
- lidé MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi jako téma * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
This article is on obstacles we faced when developing an executable representation of guidelines formalized the Guideline Interchange Format (GLIF). The GLIF does not fully specify the representation of guidelines at the implementation level as it is focused mainly on the description of guideline's logical structure. Our effort was to develop an executable representation of guidelines formalized in GLIF and to implement a pilot engine, which will be able to process such guidelines. The engine has been designed as a component of the MUltimedia Distributed Record system version 2 (MUDR(2)). When developing executable representation of guidelines we paid special attention to utilisation of existing technologies to achieve the highest reusability.Main implementation areas, which are not fully covered by GLIF, are a data model and an execution language. Concerning the data model we have decided to use MUDR(2)'s native data model for this moment and to keep watching the standardisation of a virtual medical record to implement it in execution engine in the near future. When developing the execution language, first of all we have specified necessities, which the execution language ought to meet. Then we have considered some of the most suitable candidates: Guideline Execution Language (GEL), GELLO, Java and Python. Finally we have chosen GELLO although it does not completely cover all required areas. The main GELLO's advantage is that it is a proposed HL7 standard. In this paper we show some of the most important disadvantages of GELLO as an executable language and how we have solved them.
- MeSH
- chorobopisy MeSH
- jazyk (prostředek komunikace) * MeSH
- lidé MeSH
- multimédia * MeSH
- rozhodování pomocí počítače MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi jako téma MeSH
- systémy pro podporu klinického rozhodování MeSH
- technologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Snaha o zlepšení lékarské péce a usnadnení její standardizace vedla ke vzniku celé rady klinických doporucení. Klinická doporucení jsou nejdríve napsána v bežném jazyce a teprve potom jsou prevedena do formálního modelu, který muže být implementován na pocítaci. Pokud jsou všechna relevantní data o lécení pacienta uložena v jeho Elektronickém Zdravotním Záznamu (EZZ), formální model doporucení, alespon v principu, muže být porovnán s daty pacienta a muže být zjišteno, zda byl pacient lécen ve shode s doporucenou klinickou praxí. V tomto clánku predkládáme algoritmus, který umožnuje porovnat pacientuv zdravotní záznam s modelem EGLIF (rozšíreným modelem GLIF). EGLIF vznikl rozšírením standardního GLIF modelu a byl navržen proto, aby toto porovnávání bylo pohodlnejší a transparentnejší.
Many clinical guidelines were elaborated to improve quality of medical care and to achieve standardization of patient's treatment. Originally clinical guidelines are written in everyday language and then they are converted into formal model that can be implemented and processed by computer. If all relevant patient's treatment data are stored in patient's Electronic Health Record, the guidelines formal model may be, in principle, compared with patient's data to determine, if the patient was treated according to the recommended clinical practice. In this article we present an algorithm that enables to compare patient's data record with EGLIF (Enhanced GLIF) model. EGLIF is a simple enhancement of the standard GLIF model and it was devised to render the comparison more transparent and more convenient. Comparing algorithm is proposed for GLIF models with unambiguous decision steps and for patient's data records containing all relevant patient's treatment information. Its modification for arbitrary decision steps can be easily done. However, comparing GLIF or EGLIF model with incomplete patient's data record is more difficult issue. Some suggestions how to tackle this problem are discussed in the conclusion.
- Klíčová slova
- GLIF model, elektronický zdravotní záznam, systém varování, algoritmus průchodu doporučeními,
- MeSH
- algoritmy MeSH
- chorobopisy - počítačové systémy MeSH
- databáze faktografické MeSH
- financování organizované MeSH
- informační systémy normy MeSH
- metody pro podporu rozhodování MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi jako téma MeSH
- systémová integrace MeSH
- systémy pro podporu klinického rozhodování normy MeSH
- teoretické modely MeSH
- ukládání a vyhledávání informací normy MeSH
Formalizace lékařských doporučení pomocí obecného grafického GLIF modelu je prezentována na formalizovaných Evropských doporučeních pro prevenci kardiovaskulárních chorob v klinické praxi z roku 2003 a Evropských (ESH/ESC) hypertenzních doporučeních z roku 2003 (HLD). Model vede uživatele rozhodovacími algoritmy pro diagnostiku několika chorob, stanovení celkového kardiovaskulárního rizika a výběr příslušné léčby. Navíc může ukázat jak základní informaci, tak příslušnou část kompletního textu lékařských doporučení (LD), která se týká vybraného elementu GLIF modelu. Formalizace LD lze použít jako zpětné vazby pro autory k odstranění nejasností a informačních nekonzistencí LD. Stanovení celkového kardiovaskulárního rizika a výběr lékové třídy je snažší ve srovnání s časově náročnou manipulací s tabulkami papírových LD. Lékářům nabízí systém pro podporu rozhodování a kontroluje jejich rozhodovací algoritmy ve srovnání s algoritmy LD. V budoucnosti by mohl sloužit jako nástroj pro audit práce lékařů jejich odbornou společností především jako automatický systém s přímou extrakcí dat ze strukturovaného zdravotního záznamu. Počítačová prezentace LD má potenciál pro snažší implementaci znalostí LD než klasická papírová forma LD, a může tak zlepšit primární péči u kardiovaskulárních chorob.
Formalization of medical guidelines by means of a general GLIF graphic model is demonstrated in the formalized 2003 European Guidelines on Cardiovascular Disease Prevention and 2003 ESH/ESC Hypertension Guidelines. It leads a user through the decision algorithm in diagnostics of several diseases, total cardiovascular risk estimation and appropriate treatment. Moreover, it can show both the basic information and the appropriate part of guidelines (GL) complete text concerning the selected GLIF model element. The formalization of GL can function as a feedback for authors to remove uncertainties and information inconsistencies in GL. Estimation of the total cardiovascular risk and selection of a drug class is easier compared to a time consuming manipulation with tables of paper guidelines. It offers to physicians a system for a decision support and it checks their decision algorithms in comparison with those of GL. It could serve as a tool for an audit of physicians work by their professional society using the automatic system, preferably with a direct data access from a structured electronic health record in future. Computer GL presentation has the potential for an easier GL knowledge implementation than the classical paper GL form and thus to improve the primary care of cardiovascular diseases.
- Klíčová slova
- GLIF model, formalizace lékařských doporučení, prevence kardiovaskulárních chorob,
- MeSH
- algoritmy MeSH
- hodnocení rizik metody normy MeSH
- kardiovaskulární nemoci etiologie farmakoterapie prevence a kontrola MeSH
- lidé MeSH
- navrhování softwaru MeSH
- rozhodování pomocí počítače MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi jako téma MeSH
- systémová integrace MeSH
- systémy pro podporu klinického rozhodování normy organizace a řízení MeSH
- teoretické modely MeSH
- ukládání a vyhledávání informací normy MeSH
- umělá inteligence MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
In the paper we present an algorithm for comparing the patient's data record with clinical guidelines formalized in the EGLIF model. EGLIF is a simple enhancement of the standard GLIF model. We use the EGLIF model to make the design of the comparison algorithm more clear and con- venient. If the patient's record completely describes the carried out treatment, then the comparing algorithm is able to recognize if the patient's treatment complies with the guidelines or not.
Fisherových dat . 184OBSAH -- 5 -- 3.5 Faktorová analýza 190 -- 3.5.1 Vývoj faktorové analýzy 190 -- 3.5.2 Model d-separace 321 -- 5.3.3 Shachterova metoda postupných modifikací 324 -- 5.3.4 Transformace na rozložitelný model -- 5.3.5 Výpočty ve stromech spojení .334 -- 6 Neuronové sítě 341 -- 6.1 Neuron a jeho matematický model zdroje lékařských doporučení . 407 -- 7.2 Formalizace a reprezentace lékařských doporučení 409 -- 7.2.1 GLIF a GLIKREM 409 -- 7.2.2 Model GLIF v UML 412OBSAH -- 7 -- 7.2.3 Model GLIF v systému Protégé 413 --
Biomedicínská informatika ; 3
1. vyd. 507 s. : il. ; 21 cm
- MeSH
- lékařská informatika MeSH
- medicína založená na důkazech metody organizace a řízení MeSH
- metody pro podporu rozhodování MeSH
- neuronové sítě MeSH
- rozhodovací podpůrné systémy pro řízení MeSH
- rozhodování pomocí počítače MeSH
- využití lékařské informatiky MeSH
- Publikační typ
- příručky MeSH
- Konspekt
- Umělá inteligence
- NLK Obory
- lékařská informatika
- biomedicínské inženýrství
Clinical practice guidelines are textual recommendations based on the consensus of medical experts with the aim to solve diagnostic and therapeutic problems. For more advanced use in real medical applications it is necessary to find out mathematical models of physicians' decision-making processes. The acquisition of a formal model from text-based guidelines is a crucial point for development of decision support systems. We introduce a system for formalization and presentation of medical knowledge contained in clinical practice guidelines where knowledge formalization is based on the GLIF model.
- MeSH
- algoritmy MeSH
- expertní systémy MeSH
- financování organizované MeSH
- hodnocení rizik MeSH
- internet MeSH
- kardiovaskulární nemoci etiologie prevence a kontrola MeSH
- lidé MeSH
- navrhování softwaru MeSH
- řízený slovník MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi jako téma MeSH
- systémová integrace MeSH
- systémy pro podporu klinického rozhodování organizace a řízení MeSH
- teoretické modely MeSH
- znalostní báze MeSH
- zpracování přirozeného jazyka MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Electronic Health Record (EHR) systems are now being developed in many places. More advanced systems provide also reminder facilities, usually based on if-then rules. In this paper we propose a method how to build the reminder facility directly upon the guideline interchange format (GLIF) model of medical guidelines. The method compares data items on the input of EHR system with medical guidelines GLIF model and is able to reveal if the input data item, that represents patient diagnosis or proposed patient treatment, contradicts with medical guidelines or not. The reminder facility can be part of EHR system itself or it can be realized by a stand-alone reminder system (SRS). The possible architecture of stand-alone reminder system is described in this paper and the advantages of stand-alone solution are discussed. The part of the EHR system could be also a browser that would present graphical GLIF model in easy to understand manner on the user screen. This browser can be data driven and focus attention of user to the relevant part of medical guidelines GLIF model.
- MeSH
- chorobopisy - počítačové systémy normy MeSH
- chorobopisy - spojování normy MeSH
- financování organizované MeSH
- metody pro podporu rozhodování MeSH
- registrace MeSH
- rozhodovací podpůrné systémy pro řízení normy MeSH
- šíření informací metody MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi jako téma normy MeSH
- systémy řízení databází normy MeSH
- telemedicína normy MeSH
- ukládání a vyhledávání informací normy MeSH
- uživatelské rozhraní počítače MeSH
- Publikační typ
- srovnávací studie MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Deciding on things is a knowledge-based activity. In the context of clinical decision support systems (DSS) this means that representation and management of the related knowledge about underlying concepts and processes is foundational for the decision-making process. A basic challenge to be mastered is the language problem. For expressing and sharing knowledge, we have to agree on terminologies specific for each of the considered domains. For guaranteeing semantic consistency, the concepts, their relation and underlying rules must be defined, deploying domain-specific as well as high-level ontologies. Ontology representation types range from glossaries and data dictionaries through thesauri and taxonomies, meta-data and data models up to formal ontologies, the latter represented by frames, formal languages and different types of logics. Based on the aforementioned principles, special knowledge representation and sharing languages relevant for health have been introduced. Examples are PROforma, Asbru, EON, Arden Syntax, GELLO, GLIF, Archetypes, HL7 Clinical Statements, and the recently developed FHIR approach. With increasing complexity and flexibility of decision challenges, DSS design has to follow a defined methodology, offered by the Generic Component Model Framework meanwhile internationally standardized. This paper deals in detail with the basics and instances for knowledge representation and management for DSS design and implementation, thereby referencing related work of the author.