MicroRNA
Dotaz
Zobrazit nápovědu
MicroRNA jsou malé molekuly ribonukleotidové kyseliny, které se významně podílejí na regulaci genové exprese. Působení microRNA využívá mechanismu RNA interference (RNAi), který umožňuje cílené utlumení genové exprese na post-transkripční úrovni prostřednictvím krátkých dvouřetězcových RNA molekul. V lidském genomu bylo dosud nalezeno přibližně 750 microRNA genů, přičemž tento počet zatím není konečný (počítačové analýzy lidského genomu predikují existenci asi tisíce microRNA). Předpokládá se však, že tyto microRNA regulují expresi až třetiny protein-kódujících genů, což naznačuje jejich zásadní význam pro fungování buňky a buněčného cyklu. Deregulace microRNA byla popsána u většiny nádorů včetně hematologických malignit a přibývá stále více důkazů o tom, že microRNA hrají zásadní roli v maligní transformaci buňky. U řady hematologických malignit byl popsán jejich přímý význam v patogenezi onemocnění. Příkladem je delece microRNA miR-15a a miR-16-1, regulující expresi onkogenu BCL2 u přibližně 50 % pacientů s chronickou lymfocytární leukemií.
- MeSH
- akutní myeloidní leukemie genetika patofyziologie MeSH
- chronická lymfatická leukemie genetika patofyziologie MeSH
- cyklin D1 MeSH
- financování organizované MeSH
- hematologické nádory genetika patofyziologie MeSH
- hybridizace nukleových kyselin metody MeSH
- mikro RNA fyziologie MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody MeSH
- RNA interference fyziologie MeSH
MicroRNA jsou krátké (18-24 nukleotidů) nekódující, velmi stabilní molekuly RNA, jejichž funkce zahrnuje vše od regulace klíčových signálních drah na molekulární úrovni až po rychlou buněčnou odpověď organismu na patologické stavy. microRNA jsou stabilní v tělních tekutinách a představují velmi perspektivní diagnostický cíl pro včasnou identifikaci široké škály onemocnění. V tomto souhrnném článku je uveden přehled kandidátních diagnostických miRNA vhodných pro využití v diagnostice onkologické kardiotoxicity.
MicroRNAs are very stable short (18-24) noncoding RNAs. The function of miRNA molecules includes everything from the regulation of key signalling pathways at the molecular level to the rapid cellular response to pathological conditions. miRNAs are stable in body fluids and represent a very promising diagnostic targets for the early identification of a wide range of diseases. This summary article provides an overview of candidate diagnostic miRNAs suitable for use in the diagnosis of oncological cardiotoxicity.
Since the first demonstration of microRNA (miRNA) roles in tumorigenesis, a multitude of studies have established a solid scaffold that supports the increased and accelerated progression in this field. The aim of this article is to comment on the most recent findings of miRNAs in cancer, particularly focusing on epigenetics and the potential clinical applications derived from comprehensive and exhaustive research carried out during the last years. RECENT FINDINGS: A global reduction of miRNA levels is emerging as a common hallmark of cancer. Several strands of evidence have shown that one of the mechanisms responsible for this deregulation is the epigenetic silencing of miRNA genes. In turn, recent studies have revealed that some miRNAs directly repress enzymes of the epigenetic machinery, including DNA methyltransferases, histone deacetylases and histone methyltransferases. These facts broaden the promising biomedical uses of miRNAs. Apart from epigenetic mechanisms, other causes of miRNA deregulation in cancer are also discussed in this review, as well as novel clinical applications of miRNAs in cancer treatment. SUMMARY: The ability of individual miRNAs to regulate multiple target genes, implicated in turn in several pathways, confers them an extraordinary capacity as multifunctional tools for cancer therapy. Thus, restoration of the level of a single or few pleiotropic miRNAs could eventually re-establish molecular pathways altered in cancer, providing a more effective therapeutic strategy. However, further studies will be needed to validate the preliminary successful results of miRNA-based therapy obtained in cellular and animal models. Also, it is crucial to expand our knowledge about the molecular regulation of the miRNome (global miRNA expression levels) in physiological and pathological settings.
MicroRNAs are endogenously expressed regulatory noncoding RNAs. Altered expression levels of several microRNAs have been observed in glioblastomas. Functions and direct mRNA targets for these microRNAs have been relatively well studied over the last years. According to these data, it is now evident, that impairment of microRNA regulatory network is one of the key mechanisms in glioblastoma pathogenesis. MicroRNA deregulation is involved in processes such as cell proliferation, apoptosis, cell cycle regulation, invasion, glioma stem cell behavior, and angiogenesis. In this review, we summarize the current knowledge of miRNA functions in glioblastoma with an emphasis on its significance in glioblastoma oncogenic signaling and its potential to serve as a disease biomarker and a novel therapeutic target in oncology.
- MeSH
- gliosarkom metabolismus MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA fyziologie genetika klasifikace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
MicroRNA (miRNA) jsou malé, nekódující, evolučně konzervované RNA molekuly, posttranskripčně regulující genovou expresi. Epigenetickým mechanismem RNA interference (RNAi) ovlivňují stabilitu a translační účinnost cílových mRNA. Jsou nalézány u většiny organismů, tvoří 1-2% eukaryotických genomů a řídí expresi přibližně 1/2 protein kódujících genů. Podílejí se na regulaci klíčových biologických procesů (buněčný růst, diferenciace, proliferace, apoptóza). Recentní nálezy zdůrazňují zásadní význam miRNA ve vývoji, homeostáze a funkci vrozené i adaptivní imunity. Aberantní expresní vzory jsou součástí patogeneze široké škály chorob, včetně poruch autoimunity. Článek shrnuje diferenciální microRNAexpresi u revmatoidní artritidy, systémového lupusu erythematodes, Sjögrenova syndromu, systémové sklerodermie a idiopatických zánětlivých myopatií a podává charakteristiku microRNA jako biomarkerů a potenciálních terapeutických cílů.
- Klíčová slova
- RA, SLE, IIM, epigenetika,
- MeSH
- autoimunitní nemoci diagnóza etiologie genetika MeSH
- biologické markery MeSH
- epigenomika metody trendy MeSH
- exprese genu genetika imunologie MeSH
- financování organizované MeSH
- genetické markery MeSH
- lidé MeSH
- metaanalýza jako téma MeSH
- mikro RNA genetika imunologie klasifikace MeSH
- nemoci svalů diagnóza etiologie genetika MeSH
- revmatické nemoci diagnóza etiologie genetika MeSH
- revmatoidní artritida diagnóza etiologie genetika MeSH
- Sjögrenův syndrom diagnóza etiologie genetika MeSH
- statistika jako téma MeSH
- systémová sklerodermie diagnóza etiologie genetika MeSH
- systémový lupus erythematodes diagnóza etiologie genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Methods in molecular biology, ISSN 1064-3745 822 Springer protocols
xi, 341 stran : ilustrace
Východiska a cíle: Mnohočetný myelom (MM) je druhé nejčastější hematoonkologické onemocnění. Zavedení nových léků do klinické praxe vedlo k výraznému zlepšení přežívání pacientů s MM. I přes tato opatření je přežívání pacientů negativně ovlivněno tzv. extramedulárním relapsem (EM). EM je způsoben ztrátou závislosti plazmatických buněk na mikroprostředí kostní dřeně a jejich migrací do měkkých tkání. Podstata a příčina tohoto procesu nejsou doposud objasněny. MikroRNA (miRNA) jsou krátké, nekódující molekuly RNA, které jsou zapojeny do mnoha fyziologických, ale i patologických procesů. V rámci několika studií byl prokázán význam těchto molekul i u patogeneze MM. Předpokládáme, že se miRNA podílejí rovněž na rozvoji EM. Cílem naší práce bylo analyzovat rozdílné exprese miRNA mezi skupinou MM a EM pacientů. Materiál a metody: Pomocí sekvenování nové generace bylo analyzováno 39 vzorků plazmatických buněk z kostní dřeně pacientů s MM při diagnóze a 9 vzorků plazmatických buněk z kostní dřeně nemocných s EM. Výsledky: Celkem bylo sekvenováno 2 278 miRNA, ale do analýzy bylo zahrnuto 658 miRNA, které byly exprimovány u všech vzorků a měly nejméně 20 čtení. Expresní data byla generována pomocí Chimira tool z fastq dat. Všechny sekvence byly mapovány pomocí miRBase v20. Další analýzy byly provedeny s použitím R/Bioconductor package. Pro normalizaci exprese byl použit Bayesův postup. P hodnoty byly adjustovány s použitím Benjamini-Hochberg metody. Analýza prokázala, že existuje 10 miRNA (p < 0,0005), které jsou statisticky signifikantně exprimovány u EM vs. MM pacientů – konkrétně se jedná o miR-26a-5p, miR-26b-5p, miR-30e-5p, miR-424-3p, miR-503-5p, miR-767-5p, miR-105-5p, miR-5695-5p, miR-450b-5p a miR-92b-3p. Tyto miRNA budou dále ověřeny metodou qPCR na větším souboru pacientů s MM a EM. Závěr: Naše pilotní studie ukázala, že existuje rozdíl expresních hladin některých miRNA mezi skupinou pacientů s MM a EM.
Introduction and Aims: Multiple myeloma (MM) is the second most common hematooncological disease. Patient survival has been greatly improved by the introduction of new drugs into clinical practice, but survival is negatively affected by the so-called extramedullary relapse (EM), caused by the loss of plasma cell dependence on the bone marrow microenvironment and their migration out of the bone marrow. The nature and causes of this process are currently unclear. MicroRNAs (miRNAs) are short, non-coding RNA molecules involved in many physiological and pathological processes. Their significance in the pathogenesis of MM has been demonstrated by several studies. We assume that they are also involved in the development of the EM. The aim of this study was to analyze different miRNA expression between MM and EM patients. Material and Methods: Using next generation sequencing, we analyzed 39 samples of bone marrow cells from MM patients at diagnosis and 9 bone marrow plasma samples of EM patients. Results: In total, 2,278 miRNA were sequenced, but only 658 miRNAs were analyzed as they were expressed in all samples and had at least 20 reads. Expression data were generated using the Chimira tool from fastq data. All sequences were mapped using miRBase v20. Further analyses were performed using the R/Bioconductor package. The Bayesian procedure was used for normalization of expression. P values were adjusted using the Benjamini-Hochberg method. Analysis found 10 miRNA (p < 0.0005) that are statistically significantly expressed in EM vs. MM patients – these are miR-26a-5p, miR-26b-5p, miR-30e-5p, miR-424-3p, miR-503-5p, miR-767-5p, miR-105-5p, miR-5695-5p, miR-450b-5p and miR-92b-3p. These miRNAs will be further verified by qPCR method on a larger set of MM and EM patients. Conclusion: Our pilot study has shown that there are differentially expressed miRNAs between MM and EM patients.
- Klíčová slova
- extramedulární relaps,
- MeSH
- karcinogeneze MeSH
- kostní dřeň patologie MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA * MeSH
- mnohočetný myelom * genetika MeSH
- pilotní projekty MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
BACKGROUND: MicroRNAs (miRNA) are small non-coding RNAs that negatively regulate gene expression in a sequence- specific manner. Post-transcriptional silencing of target genes by miRNA occurs either by specific cleavage of homologous mRNA or by specific inhibition of protein synthesis. MiRNAs are essential regulators of various processes such as proliferation, differentiation, development, cell death and interaction between virus and host cell. AIM: The aim of this paper is to summarize the main findings from research on miRNA biogenesis, functionality and cancer relevance. METHOD: A narrative literature review of all of the relevant papers known to the authors was conducted. RESULTS: Several human diseases including cancer are associated with aberrant regulation of miRNAs expression or deficiency in miRNA biogenesis. Analysis of miRNA expression signatures can serve as a valuable tool for cancer classification, diagnostics and prediction of tumor behavior. CONCLUSIONS: There has been demonstrated a possibility to use these microRNA signatures for a specific cancer classification with potential predictive and therapeutic value. The known data provide evidence that microRNAs may open new ways for cancer diagnosis, prognosis estimation and therapy.
mikroRNA (miRNA, miR) jsou malé nekódující molekuly RNA, které se podílejí na regulaci genové exprese a zasahují prakticky do všech myslitelných signálních, metabolických či regulačních okruhů, čímž se podílejí na udržování homeostázy. Jejich hladiny se mění vlivem vnějších stimulů či při přítomnosti nemoci, a to nejen ve tkáních, ale i v tělních tekutinách (v krvi, moči). Jedna miRNA je často zapojena do regulace více signálních drah, ať již funkčně propojených či zcela nezávislých, čímž nám umožňují nové pohledy na patofyziologii nemocí a přináší nové cíle pro terapii. Přítomnost miRNA v extracelulárním prostoru dělá z miRNA potenciální nové biomarkery různých nemocí použitelných při diagnostice, odhadu prognózy nebo rizikové stratifikaci pacientů. V rámci tohoto souhrnného článku jsou uvedeny základní informace týkající se miRNA a jejich funkce a poté u vybraných nemocí popsány konkrétní miRNA, které jsou zapojeny do jejich patofyziologie nebo které by mohly být potenciálně využitelné v klinické praxi.
MicroRNAs (miRNAs, miRs) are small, non-coding RNA molecules that are involved in the regulation and fine-tuning of gene expression. They regulate almost all thinkable signalling pathways and thus participate in the maintenance of homeostasis. The levels of individual miRNAs are affected by various external stimuli and they also change in the presence of diseases; these changes can be detected in tissues and bodily fluids (i.e. blood or urine). One miRNA commonly regulates more signalling cascades, either interconnected or independent, and this enables us to better understand the pathophysiology of cardiovascular diseases and reveal novel targets for therapy. Moreover, the presence of miRNAs in the extracellular space makes them potentially usable as diagnostic or prognostic biomarkers of various diseases that can be employed in differential diagnostics and risk stratification of individual patients. This review article summarises basic information about miRNAs and their function. Further, selected miRNAs and their roles in the pathophysiology of some cardiovascular diseases will be described, focusing on those potentially usable in clinical practice.
- MeSH
- ateroskleróza diagnóza etiologie patofyziologie MeSH
- diferenciální diagnóza MeSH
- extracelulární prostor fyziologie genetika MeSH
- fibrilace síní diagnóza patofyziologie MeSH
- hypertenze diagnóza etiologie MeSH
- kardiovaskulární nemoci MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA * biosyntéza klasifikace terapeutické užití MeSH
- nemoci srdečních chlopní diagnóza patofyziologie MeSH
- prognóza MeSH
- rizikové faktory MeSH
- srdeční selhání diagnóza etiologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- souhrny MeSH
- MeSH
- DNA nádorová genetika metabolismus MeSH
- dospělí MeSH
- karcinom genetika metabolismus MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA * genetika metabolismus MeSH
- nádorové biomarkery genetika metabolismus MeSH
- nádory vaječníků * genetika krev metabolismus MeSH
- pilotní projekty MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- studie případů a kontrol MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH