• MeSH
• epidemiologické faktory MeSH
• epidemiologické metody MeSH
• klinické lékařství MeSH
• medicína založená na důkazech MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• epidemiologie

Metodou analýzy polymorfie restrikčních fragmentů DNA (RFLP) s použitím sondy IS6110 byl vyšetřen soubor 22 polyrezistentních kmenů M. tuberculosis vylučovaných nemocnými se suspektními vzájemnými kontakty. V souboru byly 4 nemocní s anamnézou společného pobytu ve vězení, 4 byli bezdomovci, další udávali trvalé bydliště ve 4 různých krajích České republiky a 4 zemřeli. Touto metodou byl prokázán v podskupině A u 14 nemocných identický profil RFLP tvořený čtyřmi kopiemi 1S6110. U zbývajících 7 nemocných podskupiny B byl nalezen stejný základní typ fingerprintu jako u nemocných skupiny A, který vsak vykazoval další dvě kopie IS6110 navíc. U jednoho nemocného byly prokázány v odstupu dvou let typy RFLP profilů. Autoři považují oba subklony za geneticky příbuzné a nálezy přídatných kopií 1S6110 v subklonu B vysvětlují transpozicí ť tohoto elementu související pravděpodobně s nestabilitou původního genotypu DNA. Tuto domněnku podporuje časový odstup výskytu prvních kmenů s profilem B, které byly zaznamenány teprve po 4 letech od rozpoznání klonu nesoucího profil A. Jeden nemocný vykazoval zcela odlišný profil RFLP tvořený 9 kopiemi IS6110 a jeho spoluúčast v řetězu popsané mikroepidemie byla proto vyloučena.

A group of 22 multidrug resistant strains of Mycobacterium tuberculosis excreted by patients with suspicion of man-to-man contact, using the method of DNA restrictive fragment polymorphy (RFLP) with 1S6110 probe were examined. Among these patients 4 had a history of commonstay in a prison, 4 were homeless persons, the further had 4 various lodgings in the Czech republic and 4 died. With this method in the subgroup A in 14 patients an remaining 7 patients of subgroup B the same basic fingerprint was found as in the group A, but these had further two copies of IS6110. In one of these patients after two years both type of RFLP profiles were found. Authors suppose, that both subtypes are genetically related. They explain the finding of additional copies of IS6110 in the subgroup B as a transposition of this element, probably connecting with the instability of the primary DNA genotype. This assumption is supported by the time distance of appearance of the first smears with the profile B, found 4 years after the discovery of the clone with the profile A. One patient had a different profile RFLP consisting from 9 copies IS6110 and his participation in the chain of described microepidemy was therefore excluded.

• MeSH
• antibiotická rezistence MeSH
• molekulární epidemiologie metody   MeSH
• multirezistentní tuberkulóza epidemiologie   farmakoterapie   MeSH
• Mycobacterium tuberculosis genetika   izolace a purifikace   MeSH

• MeSH
• epidemiologické metody MeSH
• epidemiologie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• epidemiologie
• NLK Publikační typ
• kolektivní monografie

Předmětemstudie je soubor 27 kmenů Mycobacteria tuberculosis izolovaných od vězňů s diagnózoutuberkulózy v roce 2000, 19 Čechů a 8 cizinců (věkový průměr 41, resp. 35 let). Molekulárně-epidemiologickévyšetření těchto kmenů bylo provedeno technikou RFLP fingerprintingu (RestrictionFragment Length Polymorphism) s průkazem insertivní sekvence IS6110 a technikou spoligotypizace,založené na detekci hybridizace spacerových oligonukleotidů. DNA fingerprinting ukázalvysokou polymorfii v počtu i molekulární hmotnosti sekvence IS6110, která je obvyklá u českýchi jiných evropských kmenů M. tuberculosis. Všechny kmeny s výjimkou jedné dvojice se vyznačovalyvzájemně odlišnými profily fingerprintů. U dvojice s identickými fingerprinty šlo pravděpodobněo duplicitní vyšetření stejného materiálu, k jehož záměně došlo běhemtransportu nebo v laboratoři.Metodou fingerprintingu nebyl tedy prokázán interhumánní přenos tuberkulózy mezi vyšetřenýmivězni. Technika spoligotypizace prokázala nález genotypu Beijing M. tuberculosis u dvou nemocnýchvězňů, jednoho Alžířana a jednoho Albánce a dále u jednoho českého vězně. Tento genotypnacházený u vysokého procenta nemocných v jihovýchodní Asii a u migrantů z této oblasti, je jehoprvním nálezem v České republice.Nálezy dokumentují dobrou úroveň programu kontroly tuberkulózy v českém vězeňském systémua současně poukazují na potenciální možnost šíření tuberkulózy od migrantů přicházejících z oblastívysoké prevalence.

The subject of the investigation is a group of 27 strains of Mycobacterium tuberculosis isolated in2000 fromprisoners with the diagnosis of tuberculosis, 19 Czechs and 8 foreigners (mean age 41 and35 years resp.). The molecular-epidemiological examination of these strains was made using theRFLP fingerprint technique (Restriction Fragment Length Polymorphism) with evidence of theinsertive sequence IS6110 and the technique of spoligotyping, based on detection of hybridizationof spacer oligonucleotides. DNA fingerprinting revealed a high polymorphism in the number andmolecular weight of sequence IS6110 which is common in Czech and other European strains of M.tuberculosis. All strains with the exception of two had mutually different fingerprint profiles. In thetwo with identical fingerprints probably a duplicit examination of the same material was involvedwhich occurred by mistake during transport or in the laboratory. The fingerprint method thus didnot prove interhuman transmission of tuberculosis between the examined prisoners. The techniqueof spoligotyping revealed the finding of genotype Beijing M. tuberculosis in two sick prisoners, oneAlgerian and one Albanese, and in one Czech prisoner. This genotype found in a high percentage ofpatients in southeastern Asia and in migrants from this area was detected for the first time in theCzech Republic.The findings are evidence of a satisfactory standard of the programme of tuberculosis control in theCzech prison system and at the same time draw attention to the potential possibility of the spreadof tuberculosis from migrants coming from areas with a high prevalence.

• MeSH
• DNA fingerprinting metody   využití   MeSH
• finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
• lidé MeSH
• Mycobacterium tuberculosis genetika   MeSH
• tuberkulóza epidemiologie   mikrobiologie   terapie   MeSH
• věznice MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

• MeSH
• epidemiologická měření MeSH
• infekční nemoci MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• infekční lékařství
• epidemiologie

Chronická hepatitida C je globální zdravotnický problém. Od objevu viru hepatitidy C (HCV) uplynulo již 15 let. V posledních letech se podle výsledků Centra pro kontrolu nemocí v Atlantě zřetelně změnila epidemiologie infekce HCV. Významně přibylo infikovaných i. v. narkomanů (z 35 % na 60 %) a vzrostl počet nákaz vzniklých při sexuálním styku (ze 7 % na 20 %), přičemž ubylo pacientů, u nichž nelze zjistit zřejmý rizikový faktor infekce HCV (ze 40 % na 10 %). V Itálii, Číně a Japonsku byla zjištěna místa s výrazně zvýšenou lokalní prevalencí anti-HCV, která významně převyšuje prevalenci u dárců krve. Jako nejpravděpodobnější zdroj nákazy se ukázaly V těchto místech nedokonale sterilované injekční stříkačky a jehly, které se přibližně do roku 1975 používaly. Reaktivita anti-HCV stoupá od dospělosti téměř lineárně s věkem nemocných a ve skupině 60-69letých může dosahovat 30-40 %, což se vysvětluje v minulosti prováděnou i. V. léčbou a odběry krve ze žíly nedokonale sterilizovanými skleněnými injekčními stříkačkami a jehlami, hospitalizací delší než sedm dnů a chirurgickými výkony. Zbylých 10 % dosud neobjasněných rizikových faktorů přenosu infekce HCV je zřejmě způsobeno nízkou socioekonomickou úrovní.

Chronic hepatitis C is a global health problem. The virus of hepatitis C (HCV) was discovered 15 years ago. According to the Centre Antlanta the epidemiology of HCV infections has changed in recent years. Simultaneously with a substantial increase in the number of infected i.v. drug addicts (from 35 % to 60 %) and in the number of sexually transmitted infections (from 7 % to 20 %), there has been a drop in the number of patients without a patent risk factor of an HCV infection (from 40 % to 10 %). Localities with a marked increase in local anti-HCV prevalence, significantly higher than the prevalence in blood donors, were identified in Italy, China and Japan. The most probable source of infection in these localities seem to be inadequately sterilized glass injection syringes and needles, which were in use until about 1975. Since adulthood anti-HCV reactivity rises almost linearly with the patients' age: in the group of patients aged 60-69 years it can be as high as 30-40 %. This is usually explained by the use, in previous times, of inadequately sterilized glass syringes and injection needles in i.v. treatment and i.v. blood sampling, by hospital stays exceeding seven days and surgery. The remaining 10 % of as yet unexplained risk factors of HCV infections are most probably the consequence of low socio-economic standards.

• MeSH
• chronická hepatitida C epidemiologie   patologie   MeSH
• infekce přenášené vektorem MeSH
• lidé MeSH
• přehledová literatura jako téma MeSH
• přenašečství MeSH
• přenos infekční nemoci MeSH
• rizikové faktory MeSH
• virové nemoci epidemiologie   MeSH
• zdroje nemoci MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

The distribution of time that people spend in physical activity of various intensities has important health implications. Physical activity (commonly categorised by the intensity into light, moderate and vigorous physical activity), sedentary behaviour and sleep, should not be analysed separately, because they are parts of a time-use composition with a natural constraint of 24 h/day. To find out how are relative reallocations of time between physical activity of various intensities associated with health, herewith we describe compositional scalar-on-function regression and a newly developed compositional functional isotemporal substitution analysis. Physical activity intensity data can be considered as probability density functions, which better reflects the continuous character of their measurement using accelerometers. These probability density functions are characterised by specific properties, such as scale invariance and relative scale, and they are geometrically represented using Bayes spaces with the Hilbert space structure. This makes possible to process them using standard methods of functional data analysis in the L2 space, via centred logratio (clr) transformation. The scalar-on-function regression with clr transformation of the explanatory probability density functions and compositional functional isotemporal substitution analysis were applied to a dataset from a cross-sectional study on adiposity conducted among school-aged children in the Czech Republic. Theoretical reallocations of time to physical activity of higher intensities were found to be associated with larger and more progressive expected decreases in adiposity. We obtained a detailed insight into the dose-response relationship between physical activity intensity and adiposity, which was enabled by using the compositional functional approach.

• MeSH
• adipozita * MeSH
• Bayesova věta MeSH
• časové faktory MeSH
• cvičení * fyziologie   MeSH
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• obezita * MeSH
• průřezové studie MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

• MeSH
• epidemiologie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• epidemiologie

In recent years, the focus of activity behavior research has shifted away from univariate paradigms (e.g., physical activity, sedentary behavior and sleep) to a 24-h time-use paradigm that integrates all daily activity behaviors. Behaviors are analyzed relative to each other, rather than as individual entities. Compositional data analysis (CoDA) is increasingly used for the analysis of time-use data because it is intended for data that convey relative information. While CoDA has brought new understanding of how time use is associated with health, it has also raised challenges in how this methodology is applied, and how the findings are interpreted. In this paper we provide a brief overview of CoDA for time-use data, summarize current CoDA research in time-use epidemiology and discuss challenges and future directions. We use 24-h time-use diary data from Wave 6 of the Longitudinal Study of Australian Children (birth cohort, n = 3228, aged 10.9 ± 0.3 years) to demonstrate descriptive analyses of time-use compositions and how to explore the relationship between daily time use (sleep, sedentary behavior and physical activity) and a health outcome (in this example, adiposity). We illustrate how to comprehensively interpret the CoDA findings in a meaningful way.

• MeSH
• adipozita MeSH
• analýza dat * MeSH
• činnosti denního života MeSH
• cvičení * MeSH
• dítě MeSH
• kohortové studie MeSH
• lidé MeSH
• longitudinální studie MeSH
• sedavý životní styl * MeSH
• spánek MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Austrálie MeSH

Consumption of alcohol and new psychoactive substances (NPS) in a population or during special events (music festivals) is usually monitored through individual questionnaires, forensic and toxicological data, and drug seizures. However, consumption estimates have some biases due mostly to the unknown composition of drug pills for NPS and stockpiling for alcohol. The aim of this study was to evaluate for the first time the real use of alcohol and the occurrence of NPS in Slovakia by wastewater-based epidemiology (WBE). Urban wastewater samples were collected from nine Slovak cities over two years (2017-2018) and during three music festivals. The study included about 20% of the Slovak population and 50 000 festival attendees. The urinary alcohol biomarker ethyl sulfate (EtS) and thirty NPS were analyzed by liquid chromatography tandem mass spectrometry (LC - MS/MS). EtS concentrations were used for estimating the per capita alcohol consumption in each city. The average alcohol consumption in the selected cities and festivals in 2017-2018 ranged between 7 and 126 L/day/1000 inhabitants and increased during the weekends and music festivals. Five NPS belonging to the classes of synthetic cathinones (mephedrone, methcathinone, buphedrone and pentedrone) and phenethylamines (25-iP-NBoMe) were found in the low ng/L range. Methcathinone was the most frequently detected NPS, while the highest normalized mass load corresponded to mephedrone (3.1 mg/day/1000 inhabitants). Wastewater-based epidemiology can provide timely information on alcohol consumption and NPS occurrence at the community level that is complementary to epidemiology-based monitoring techniques (e.g. population surveys, police seizures, sales statistics).

• MeSH
• chromatografie kapalinová metody   MeSH
• dovolená MeSH
• epidemiologie odpadních vod * MeSH
• estery kyseliny sírové analýza   moč   MeSH
• ethanol analýza   MeSH
• lidé MeSH
• odpadní voda chemie   MeSH
• pití alkoholu epidemiologie   MeSH
• psychotropní léky analýza   moč   MeSH
• tandemová hmotnostní spektrometrie metody   MeSH
• velkoměsta MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Slovenská republika MeSH
• velkoměsta MeSH