• MeSH
• Bacteria, Anaerobic pathogenicity   MeSH
• Molecular Diagnostic Techniques methods   utilization   MeSH
• Research Support as Topic MeSH
• In Situ Hybridization methods   MeSH
• Humans MeSH
• Microbiology MeSH
• Periodontal Diseases etiology   microbiology   MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH

• MeSH
• Diagnostic Tests, Routine MeSH
• Immunologic Techniques MeSH
• Culture Media MeSH
• Humans MeSH
• Microbiological Techniques MeSH
• Molecular Biology MeSH
• Mycobacterium Infections diagnosis   microbiology   MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Publication type
• Comparative Study MeSH

• MeSH
• Early Detection of Cancer MeSH
• Comorbidity MeSH
• Quality of Health Care MeSH
• International Cooperation MeSH
• Neoplasms diagnosis   MeSH
• Publication type
• Collected Work MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• onkologie
• NML Publication type
• brožury

• MeSH
• DNA Ligases MeSH
• Humans MeSH
• Microbiological Techniques MeSH
• Mycobacterium tuberculosis physiology   isolation & purification   MeSH
• Polymerase Chain Reaction MeSH
• Predictive Value of Tests MeSH
• Sensitivity and Specificity MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Publication type
• Comparative Study MeSH

Zavedli jsme metodu detekce chromozomální DNA Treponema pallidum subsp. pallidum dvoukrokovou (nested) PCR reakcí, která amplifikuje část genu TP0319, kódujícího hypotetický membránový lipoprotein (gen tmpC). Vyšetřili jsme 138 sér od 111 dospělých pacientů v primárním, sekundárním, časně latentním a pozdně latentním stadiu a také pacientů s podezřením na syfilis. Chromozomální DNA T. p. pallidum se v séru dospělých pacientů nepodařilo detegovat. Při vyšetření 11 kožních a slizničních stěrů (7 genitálních, 4 faryngeálních) jsme nalezli 6 pozitivních od 3 pacientů ve stadiu primární a sekundární syfilis. Pozitivní byl rovněž jeden stěr pacienta s časnou kongenitální syfilis. Sekvenování DNA genů TP0136 a TP0548 z pozitivních vzorků prokázalo výskyt dvou kmenů sekvenčně identických s kmenem T. p. pallidum SS14 a dvou unikátních syfilitických kmenů, doposud u T. p. pallidum nepopsaných. U jednoho vyšetřovaného novorozence s pozitivním výsledkem vyšetření kožního vzorku jsme prokázali treponemální DNA také v séru a v cerebrospinálním moku. Pokroky v molekulární typizaci T. p. pallidum v klinickém materiálu přispějí k rozvoji epidemiologie syfilis a přinesou možnosti rozlišení mezi reinfekcí a reaktivací syfilitického procesu.

An in-house two-step nested PCR amplification targeting the tmpC gene (TP0319, encoding putative membrane lipoprotein) was used for detection of chromosomal DNA of Treponema pallidum subsp. pallidum in clinical specimens.We tested 138 blood serum samples from 111 adult patients with suspected, primary, secondary, early or late latent syphilis. T. p. pallidum DNA was not detected in any of the analyzed specimens. Out of 11 mucocutaneous swabs (7 genital and 4 pharyngeal), 6 collected from 3 patients with primary or secondary syphilis tested positive. One skin swab from a patient with early congenital syphilis was also positive as were his serum and cerebrospinal fluid samples. DNA sequencing of the genes TP0136 and TP0548 from the positive samples revealed two strains with DNA sequences identical to that of T. p. pallidum strain SS14 and two unique previously undescribed T. p. pallidum strains. The advances in molecular typing of T. p. pallidum in clinical specimens will be of relevance to the epidemiology of syphilis and will allow for clinical discrimination between reinfection and syphilitic reactivation.

• MeSH
• Molecular Diagnostic Techniques methods   statistics & numerical data   utilization   MeSH
• Research Support as Topic MeSH
• Humans MeSH
• Specimen Handling classification   methods   statistics & numerical data   MeSH
• Polymerase Chain Reaction classification   methods   statistics & numerical data   MeSH
• Base Sequence drug effects   MeSH
• Bacterial Typing Techniques methods   statistics & numerical data   utilization   MeSH
• Treponema pallidum genetics   isolation & purification   classification   MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Male MeSH
• Female MeSH
• Publication type
• Comparative Study MeSH

• MeSH
• Molecular Diagnostic Techniques MeSH
• Cross Infection diagnosis   MeSH
• Communicable Diseases diagnosis   MeSH
• Microbiological Techniques MeSH
• Flow Cytometry MeSH
• Virus Diseases diagnosis   MeSH

• Conspectus
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NML Fields
• biologie
• infekční lékařství
• mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
• NML Publication type
• www dokumenty

• MeSH
• Arthroplasty, Replacement MeSH
• Research Support as Topic MeSH
• Cohort Studies MeSH
• Humans MeSH
• Microbiological Techniques utilization   MeSH
• Polymerase Chain Reaction utilization   MeSH
• Synovial Fluid microbiology   MeSH
• Inflammation diagnosis   MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH

Východisko. Diagnostika non-Hodgkinských lymfomů vyžaduje v současnosti kombinaci různých metodických přístupů. Morfologické metody zůstávají základem diagnostiky, v řadě případů je však nezbytná aplikace molekulárně- genetickýchmetod. Molekulární přístupy v diagnostice lymfomů řady B umožňují detekci klonálních přestaveb imunoglobulinových genů a mohou určit chromozomální translokace specifické pro určitý typ lymfomu. Metody a výsledky. Metodou PCR jsme vyšetřili 113 nemocných s maligními lymfomy B řady různého typu (folikulární – FL, z buněk pláště –MCL,malobuněčný typu CLL/SLL, difuzní velkobuněčný – DLBCL) a stanovovali klonalitu pomocí detekce přestavby genu pro těžké řetězce imunoglobulinů (IGH), u 72 z nich také genu pro lehké řetězce imunoglobulinů kappa (IGK). Při detekci přestavby genu IGH jsme zjistili klonalitu v 85%případů (96/113), při detekci přestavby IGK v 58,3 % (42/72). Kombinací obou přístupů jsme zvýšili záchyt klonality lymfomů na 90,3 % (102/113). Nejvyšší výtěžnost jsme zjistili u lymfomů typu CLL/SLL a u MCL (100 %). U DLBCL a FL byla výtěžnost nižší, 86 a 87 %. Závěry. Stanovení klonality u lymfomů pomáhá v některých případech odlišit benigní hyperplastické procesy B lymfoidních buněk (polyklonální proliferace). Záchyt klonální přestavby v lokusech genů IGH a IGK je vhodným nástrojem pro dlouhodobé monitorování aktivity onemocnění v případech, u kterých nejsou přítomny jiné markery, zejména nádorově specifické translokace. PCR průkaz translokací v detekci onemocnění je relativně specifický, ale jeho využití je omezeno nižším záchytem při variabilním místě zlomu.

Background. Diagnostic approach to non-Hodgkin's lymphomas requires a combination of laboratory methods. Methods used in morphology constitute the basis of the diagnostics; in many instances it is necessary to combine them with methods of molecular genetics. The latter method plays a key role in the detection of B cell clonality using identification of the rearrangement of IGHand/or IGKgenes and in detection of the chromosomal translocations specific for some lymphomas. Methods and Results. Using PCR we investigated 113 patients with malignant B cell lymphomas of different types (follicular – FL, mantle cell – MCL, small cell – CLL/SLL, diffuse large cell – DLBCL). We established the IGH gene clonal rearrangement in 85 % of the cases (96/113), and the clonal rearrangement of the IGK gene in 58,3 % patients (42/72). Combination of both approaches (IGH and IGK) revealed a positive result in 90,3 % (102/113). The highest yield was rendered in patients with CLL/SLL and with MCL (100 %), and it was 86 and 87 % in cases with FL and DLBCL. Conclusions. The detection of clonality in lymphomas helps to distinguish a malignant disease from polyclonal hyperplastic and lymphoproliferative disorders of B cells. The recognition of clonal rearrangements of the IGH and IGK genes serves for a long term monitoring of the disease activity in cases in which there are no other molecular markers available. The demonstration of lymphoma characteristic translocations is relatively specific and useful but at present its usefulness is reduced in cases with variable breakpoint regions.

• MeSH
• Lymphoma, B-Cell diagnosis   pathology   MeSH
• Molecular Diagnostic Techniques methods   MeSH
• Research Support as Topic MeSH
• Gene Rearrangement MeSH
• Genes, Immunoglobulin MeSH
• Humans MeSH
• Molecular Biology methods   MeSH
• Lymphoma, Non-Hodgkin diagnosis   pathology   MeSH
• Polymerase Chain Reaction MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH

• MeSH
• Cell Biology MeSH
• Cells MeSH
• Molecular Biology MeSH
• Publication type
• Handbook MeSH

• Conspectus
• Buněčná biologie. Cytologie
• NML Fields
• cytologie, klinická cytologie

• MeSH
• Antitubercular Agents pharmacology   MeSH
• Tuberculosis, Multidrug-Resistant MeSH
• Tuberculosis, Pulmonary diagnosis   drug therapy   MeSH
• Publication type
• Handbook MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• pneumologie a ftizeologie
• NML Publication type
• publikace WHO