new approach methodologies Dotaz Zobrazit nápovědu
Carcinogenic chemicals, or their metabolites, can be classified as genotoxic or non-genotoxic carcinogens (NGTxCs). Genotoxic compounds induce DNA damage, which can be detected by an established in vitro and in vivo battery of genotoxicity assays. For NGTxCs, DNA is not the primary target, and the possible modes of action (MoA) of NGTxCs are much more diverse than those of genotoxic compounds, and there is no specific in vitro assay for detecting NGTxCs. Therefore, the evaluation of the carcinogenic potential is still dependent on long-term studies in rodents. This 2-year bioassay, mainly applied for testing agrochemicals and pharmaceuticals, is time-consuming, costly and requires very high numbers of animals. More importantly, its relevance for human risk assessment is questionable due to the limited predictivity for human cancer risk, especially with regard to NGTxCs. Thus, there is an urgent need for a transition to new approach methodologies (NAMs), integrating human-relevant in vitro assays and in silico tools that better exploit the current knowledge of the multiple processes involved in carcinogenesis into a modern safety assessment toolbox. Here, we describe an integrative project that aims to use a variety of novel approaches to detect the carcinogenic potential of NGTxCs based on different mechanisms and pathways involved in carcinogenesis. The aim of this project is to contribute suitable assays for the safety assessment toolbox for an efficient and improved, internationally recognized hazard assessment of NGTxCs, and ultimately to contribute to reliable mechanism-based next-generation risk assessment for chemical carcinogens.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- přehledy MeSH
V sezóně 2013/14 byly dominujícím respiračním patogenem adenoviry (hAdV). Adenoviry jsou poměrně bohatá skupina virů obsahujících dle současné klasifikace 60 sérotypů. Většina z nich je spojována s mnoha různými mírnými onemocněními od respiračních, přes gastroenteritidy až po encefalitidy. Pouze některé sérotypy vyvolávají závažné infekce s tendencí k lokálním epidemiím. Pro majoritní výskyt jsme přistoupili k charakterizaci hAdV v sentinelových materiálech. Namísto klasické sérotypizace byla použita metoda parciálního sekvenování úseku hexonového genu o velikosti cca 800 párů bazí. Na základě BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) analýzy bylo provedeno systematické zařazení u celkem 27 materiálů z celkového počtu 52 vzorků. V rámci klasifikace bylo nalezeno pouze 5 sérotypů (3B, 2C, 1C, 7B, 4E). Naprosto převažujícím sérotypem byl hAdV 3B, který byl prokázán v 63 % sekvenovaných materiálů. V souvislosti s adenovirovým onemocněním udávali téměř všichni nemocní rýmu, horečku s teplotou nad 38 °C a kašel. Zhruba polovina nemocných trpělo bolestí hlavy a malátností. Nebyly prokázány žádné sérotypy dávané do souvislosti se závažným onemocněním, což odpovídá vybrané kohortě pacientů. Nejméně u poloviny materiálů byl sérotyp určen přímo z klinického materiálu bez předchozí izolace. Lze tedy shrnout, že sérotypizace /genotypizace provedená na základě parciálního sekvenování hexonového genu s použitím „nested“ (vnořených) primerů nevyžaduje izolaci viru na tkáňové kultuře. Metoda je dostupná a efektivní při charakterizaci adenovirů.
In the season 2013/14, the predominant respiratory pathogen was adenovirus (hAdV). Adenoviruses are a relatively large family of DNA viruses consisting of 60 serotypes classified into seven groups. Most of them are associated with many various mild diseases from respiratory infections through gastroenteritis to encephalitis. Some serotypes only cause severe infection with a tendency towards local outbreaks. We have implemented the classification of hAdV in sentinel samples. Instead of conventional serotyping, partial sequencing of the approximately 800 pb segments of the hexon gene was used. Based on the BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) analysis, 27 of 52 samples were fitted into the current classification system. Only five serotypes were found (3B, 2C, 1C, 7B, 4E). The clearly prevailing hAdV serotype was 3B, detected in 63 % of the samples sequenced. Nearly all patients with adenovirus infection reported runny nose, temperature above 38°C, and cough. About half of the patients complained of headache and malaise. No severe disease-associated serotype was detected, as expected given the selected cohort of patients. In at least half of the samples, the serotype was determined without the need for virus isolation on cell culture. It can be concluded that serotyping based on partial hexon gene sequencing in combination with nested PCR does not require virus isolation on tissue culture. The method is time saving and effective in the characterization of adenoviruses.
- Klíčová slova
- genotypizace,
- MeSH
- Adenoviridae genetika MeSH
- adenovirové infekce lidí * diagnóza genetika MeSH
- DNA primery MeSH
- genotypizační techniky MeSH
- infekce dýchací soustavy * diagnóza etiologie MeSH
- lidé MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- sérotypizace * metody statistika a číselné údaje MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Rozvoj molekulárně genetických technik, provázený vývojem bioinformatických přístupů a rozšířením genealogie jako hobby, přináší nové možnosti také forenzní genetice. V přehledném článku jsou porovnány dnes již klasické metody genotypizace a určování příbuznosti, založené na analýze polymorfismů typu krátkých tandemových repetic, s možnostmi investigativní genetické genealogie, která využívá genotypizaci založenou na analýze stovek tisíců jednonukleotidových polymorfimů, bioinformatiky a sdílení profilů jednotlivců v rámci veřejných databází.
The development of molecular genetic techniques, coupled with the development of bioinformatic approaches and the expansion of genealogy as a hobby, also brings new possibilities for forensic genetics. The review article compares today's classical methods of genotyping and determination of kinship based on the analysis of polymorphisms such as short tandem repeats, with the possibilities of investigative genetic genealogy, which uses genotyping based on analysis of hundreds of thousands of single nucleotide polymorphisms, bioinformatics and sharing individual profiles within public databases. We describe the principles of these laboratory techniques and the interpretation of their results. We compare these new approaches with the current practice in forensic laboratories. We stress the importance of the introduction of whole genome sequencing into forensic genetics. Whole genome sequencing allows due its ability to work with degraded DNA samples the preparation of proper material for investigative genetic genealogy which has already proven its usefulness in successfully solving serial murder cases as well as in identifying unknown victims of violent crimes. In addition to methodological approaches and achievements, the limits and ethical aspects of this new field of forensic genetics are also mentioned.
- MeSH
- počítačové metodologie MeSH
- řeč MeSH
- software MeSH
- teoretické modely MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
BACKGROUND: Measuring implicit attitudes is difficult due to social desirability (SD). A new method, the Emotion Based Approach (EBA), can solve this by using emotions from a display of faces as response categories. We applied this on an EBA Spirituality tool (EBA-SPT) and an Actual Situation tool (EBA-AST). Our aim was to assess the structure, reliability and validity of the tools and to compare two EBA assessment approaches, i.e., an explicit one (only assessing final replies to items) and an implicit one (assessing also the selection process). METHODS: We obtained data on a sample of Czech adults (n = 522, age 30.3±12.58; 27.0% men) via an online survey; cortisol was assessed in 46 participants. We assessed the structure and psychometric properties (internal consistency and test-retest reliability; convergent, discriminant, and criterion validity) of the EBA, and examined the differences between explicit vs. implicit EBA approaches. RESULTS: We found an acceptable-good internal consistency reliability of the EBA tools, acceptable discriminant validity between them and low (neutral expression) to good (joy) test-retest reliability for concrete emotions assessed by the tools. An implicit EBA approach showed stronger correlations between emotions and weaker convergent validity, but higher criterion validity, than an explicit approach and standard questionnaires. CONCLUSION: Compared to standard questionnaires, EBA is a more reliable approach for measuring attitudes, with an implicit approach that reflects the selection process yielding the best results.
- MeSH
- dospělí MeSH
- emoce klasifikace MeSH
- fotografování metody MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- obličej MeSH
- postoj MeSH
- průzkumy a dotazníky MeSH
- psychometrie metody MeSH
- reprodukovatelnost výsledků MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- výraz obličeje * MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
In the Czech Republic there is a paradigm shift being realized in the approach to the education of students (children, pupils and students) with the need for supportive measures. The existing model where diagnosis of a pupil plays a crucial role and where support of this pupil is related to this diagnosis does not fit the educational reality any more. By contrast special educational needs of the pupil are linked to the supportive measures nowadays. Pupils need these supportive measures “to fulfi l their educational opportunities or to exercise or to apply their rights on the principle of equality” (Education law, p. 9). This change is refl ected not only in legislation, but especially in the work of teachers. Like any other change, this brings a lot of doubt and ambiguity. In this situation a team of specialist with fi eld experience (especially special education teachers who work in special educational centres) and academics involved in the project Systemic support of inclusive education a series of detailed methodological materials: Catalogue of supportive measures. This is a document that gives teachers a relatively detailed de scription of the various supportive measures. The catalogue is supposed to provide recommendations how to fulfil special educational needs of pupils in the context of newly passed supportive measures.
BACKGROUND: In order to reduce injecting drug use, low-threshold facilities in the Czech Republic have started to distribute empty gelatine capsules as an oral alternative of drug application for those injecting methamphetamine. This report reviews implementation of this intervention and its possible benefits and limitations. METHODS: Between December 2008 and January 2009, 109 low-threshold facilities were asked to complete a questionnaire about the capsule programmes. Two focus groups were conducted, one with professionals involved in distribution and one with peer outreach workers who were interviewed on their experience of using the capsules. RESULTS: A total of 50 facilities (46%) responded to the questionnaire; 16 (32%) distributed the capsules regularly and 19 (38%) were planning to introduce this practice. The main target groups were injecting users of methamphetamine whose veins had been damaged, and methamphetamine users wishing to reduce injecting. The advantages of capsules, as perceived by service staff and peer outreach workers, were their easy use and the satisfactory effect of the oral application; health risks related to the oral use of methamphetamine were considered drawbacks. CONCLUSION: Capsule distribution is a promising harm reduction approach for injectors of methamphetamine or other stimulants; nonetheless its benefits and limitations should be further analysed in an in-depth longitudinal study.
- MeSH
- aplikace orální MeSH
- chemie farmaceutická MeSH
- hodnocení programu MeSH
- injekce intravenózní MeSH
- intravenózní abúzus drog prevence a kontrola MeSH
- lidé MeSH
- methamfetamin aplikace a dávkování škodlivé účinky chemie MeSH
- pomocné látky chemie MeSH
- poruchy spojené s užíváním amfetaminu rehabilitace MeSH
- příprava léků MeSH
- průzkumy a dotazníky MeSH
- snížení rizika poškození MeSH
- stimulanty centrálního nervového systému aplikace a dávkování škodlivé účinky chemie MeSH
- tobolky MeSH
- želatina chemie MeSH
- zjišťování skupinových postojů MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Stálý nárůst rozsahu užívání omamných a psychotropních látek a s tím souvisejících psychologicko-psychiatrických a společensko-ekonomických problémů s sebou přináší stále vyšší a vyšší požadavky na kvalitní znalost terénu. Autor se v příspěvku pokouší na pozadí existujících zdrojů dat poukázat na možnosti, které pro výzkum závislostí přináší kvalitativní přístup, a zdůraznit jeho stále významnější roli zejména v oblastech, které jsou tradičním výzkumným nástrojům obtížně dostupné nebo jejichž užití je omezené. Pozornost je kromě představení základních teoretických východisek kvalitativního přístupu věnována několika obecným výzkumným situacím, kdy je zvážení možnosti jeho užití legitimní či dokonce žádoucí.
As a result of constantly increasing drug use and consequent increase of health (both nnental and sonnatic), criminal and socio-economic problems we can observe rising demand for "high-fidelity" knowledge on the terrain situation most recently. In this article we attempt to point out new possibilities brought by qualitative-oriented research as well as show its growing importance in the research areas hardly or inaccessible through conservative research tools. After introducing basic theoretical background of qualitative research we focus at several general research situations for which we consider the use of qualitative methods to be legitimate or even unavoidable.
Už niekoľko desaťročí je užívanie alkoholu a iných návykovývh látok u študentov považované za jeden z najzávažnejších sociálnych problémov v celonárodnom meradle. Na takmer všetkých základných aj stredných školách býva realizovaná prevencia a vzdelávanie zacielené na redukciu tohto fenoménu. Medzi najčastejšie metódy ktoré sa využívajú patria poskytovanie informácií, rovesnícke skupiny, zdravotná osveta. Efekt týchto metód je však len minimálny. V príspevku predstavujeme preventívny prístup nazvaný Prístup sociálnych noriem, ktorý sa od tých bežne používaných významne odlišuje. Jeho autori zistili, že študenti typicky chybne vnímajú to, či a koľko ostatní študenti návykové látky užívajú. Tento fenomén bol autormi nazvaný mispercepcia. Ako vyplýva zo zahraničných výskumov, jej korekciou a šírením správy o skutočnej norme vzťahujúcej sa k samotnému užívaniu významne redukujeme počet študentov, ktorí návykové látky konzumujú.
For a few past decades alcohol and other substances use has become one of the most critical social issues on a national level. A lot of primary and secondary schools involve into their prevention programs aimed at reduction of this phenomenon. Among the most frequently used methods we can mention providing information, peer groups and health education. Unfortunately, the effect of these methods is very limited. In the article we would like to introduce the preventive approach called Social norm approach that differs significantly from those aforementioned. Its authors found out that students typically misperceive the number of those students who are engaged in substance use. This phenomenon was named misperception. As many foreign research revealed, the correction of misperception and communicating a message related to the actual norm (number of the students involved in a risky behavior) contributes significantly to the decrease in students´ substance use.
- Klíčová slova
- přístup sociálních norem, užívání, mispercepce, korekce mispercepce,
- MeSH
- hodnotící studie jako téma MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- napodobovací chování MeSH
- pití alkoholu prevence a kontrola škodlivé účinky MeSH
- poruchy sociálního chování etiologie prevence a kontrola MeSH
- primární prevence metody MeSH
- školy MeSH
- sociální psychologie metody normy MeSH
- studenti MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
