The present study aims to evaluate the diagnostic yield of bronchoalveolar lavage (BAL) fluid in patients with hematological malignancies and describe the most common pathogens detected in BAL fluid (BALF.) An analysis of 480 BALF samples was performed in patients with hematological malignancies over a period of 7 years. The results of culture methods, PCR, and immunoenzymatic sandwich microplate assays for Aspergillus galactomannan (GM) in BALF were analyzed. Further, the diagnostic thresholds for Aspergillus GM and Pneumocystis jiroveci were also calculated. Microbiological findings were present in 87% of BALF samples. Possible infectious pathogens were detected in 55% of cases; 32% were classified as colonizing. No significant difference in diagnostic yield or pathogen spectrum was found between non-neutropenic and neutropenic patients. There was one significant difference in BALF findings among intensive care units (ICU) versus non-ICU patients for Aspergillus spp. (22% versus 9%, p = 0.03). The most common pathogens were Aspergillus spp. (n = 86, 33% of BAL with causative pathogens) and Streptococcus pneumoniae (n = 46, 18%); polymicrobial etiology was documented in 20% of cases. A quantitative PCR value of > 1860 cp/mL for Pneumocystis jirovecii was set as a diagnostic threshold for pneumocystis pneumonia. The absorbance index of GM in BALF of 0.5 was set as a diagnostic threshold for aspergillosis. The examination of BAL fluid revealed the presence of pathogen in more than 50% of cases and is, therefore, highly useful in this regard when concerning pulmonary infiltrates.

• MeSH
• Aspergillus genetika   izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• bronchoalveolární lavážní tekutina mikrobiologie   MeSH
• DNA fungální genetika   MeSH
• dospělí MeSH
• hematologické nádory komplikace   mikrobiologie   MeSH
• jednotky intenzivní péče MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mannany analýza   MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• neutropenie mikrobiologie   MeSH
• Pneumocystis carinii genetika   izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• pneumocystová pneumonie diagnóza   mikrobiologie   MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• Streptococcus pneumoniae genetika   izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

• Publikační typ
• abstrakty MeSH

• Publikační typ
• abstrakty MeSH

• MeSH
• bakteriální infekce diagnóza   mikrobiologie   mortalita   MeSH
• diagnostické techniky a postupy využití   MeSH
• gramnegativní bakterie genetika   izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• infekce spojené se zdravotní péčí diagnóza   komplikace   mortalita   MeSH
• lidé MeSH
• molekulární biologie metody   trendy   MeSH
• odběr vzorku krve metody   využití   MeSH
• sepse diagnóza   etiologie   mortalita   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Naše práce prezentuje přehled onemocnění příušnicemi ve východočeském regionu v letech 2003 až 2005, kdy došlo ke statisticky významnému zvýšení počtu onemocnění jak u nevakcinovaných, tak u vakcinovaných dětí a mladých dospělých. Klinická diagnóza byla konfirmována sérologickým vyšetřením metodou ELISA a průkazem IgM a/nebo sérokonverzí a signifikantním vzestupem IgG protilátek. Byla zavedena polymerázová řetězová reakce nested s reverzní transkripcí (RTnPCR) pro přímou detekci RNA viru příušnic z klinického materiálu (nazofaryngeálního sekretu, slin, likvoru a séra). Izolovaná RNA bude sloužit pro pokus o identifikaci cirkulujících genotypů viru příušnic v naší oblasti. V diskusi jsme se pokusili nastínit možné příčiny současného signifikantního nárůstu případů onemocnění příušnicemi u vakcinovaných jedinců v České republice.

A review of mumps outbreaks among both non-vaccinated and vaccinated children and young adults in the East Bohemian region in 2003–2005 is presented. A significant increase in mumps cases was observed over this period. The clinical diagnosis was confirmed serologically by ELISA detection of IgM antibodies and/or IgG seroconversion and increased levels of IgG antibodies. A reverse transcriptase nested PCR was introduced for direct detection of mumps virus RNA from clinical specimens (nasopharyngeal secretion, saliva, CSF and serum). The isolated RNA will be stored for further analysis and mumps virus genotyping attempts, helpful in tracing the virus circulation in the East Bohemia region. Possible causes of the recent significant increase in mumps cases among the vaccinated population in the Czech Republic are discussed.

• MeSH
• epidemiologická měření MeSH
• lidé MeSH
• parotitida diagnóza   epidemiologie   genetika   MeSH
• vakcinace metody   statistika a číselné údaje   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

• MeSH
• enterovirové infekce diagnóza   MeSH
• lidé MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• virové nemoci CNS diagnóza   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Cíl: Cílem retrospektivní studie bylo sumarizovat a zhodnotit výsledky pacientů s podezřením na infekci rodem Chlamydia vyšetřených pomocí „in house“ metody nested PCR (polymerázová řetězová reakce). Studie pracuje s daty získanými vyšetřením pacientů v letech 2001-2003 z regionu východních Čech na Oddělení molekulární biologie společného pracoviště Ústavu klinické mikrobiologie (ÚKM) a Ústavu klinické biochemie a diagnostiky (ÚKBD). Materiál a metodika: V roce 2001 bylo provedeno 291 vyšetření, v roce 2002 to bylo již 562 a v roce 2003 dokonce 760 vyšetření. Celkem bylo za toto období přijato 1 613 vzorků k vyšetření, z nichž jich bylo 1 587 vyšetřeno (26 nepoužitelných vzorků). Více jak 70 % všech vyšetření se provádělo ze tří druhů materiálu: moči (41,8 % všech vyšetřených vzorků), BALu (bronchoalveolární laváž; 15,3 % všech vyšetřených vzorků) a plné krve (14,9 % všech vyšetřených vzorků). Vyšetření bylo provedeno pomocí „in house“ metody nested PCR využívající primery z oblasti MOMP (ompA) genu Chlamydia spp. Výsledky: Celková pozitivita činila 5,67 %, 1,26 % vzorků bylo vyhodnoceno jako nejasný výsledek a 93,07 % vyšetřovaných vzorků bylo negativních. U mužů byla zachycena PCR pozitivita u 6,11 % a u žen toto číslo činilo 5,35 %. Nejvíce pozitivních vzorků pocházelo z věkových skupin 70-791etých (11,67 %), 10-191etých (6,51 %) a 40-491etých (6,45 %). Celková pozitivita u stěrů z urogenitálního systému byla 6,48 %, z moči 3,92 %, BALu 10,70 % a plné krve 5,51 %.

Purpose of the study. The study was intended to summarize and evaluate the results in patients with a suspected infection by the genus Chiamydia, investigated with an „in-house" method of nested PCR (polymerase chain reaction). The study worked with data from patients living in eastern Bohemia, who were examined in the years 2001-2003 at the Dept. of Molecular Biology a research laboratory shared by the Institute of Clinical Microbiology and the Institute of Clinical Biochemistry and Diagnostics. Material and methods: 291 explorations were done in 2001, in 2002 already 562 and in 2003 their figure reached 760. The total number of samples received for investigation during that period was I 613. 1 587 were actually investigated, 26 were unsuitable and could not be used. More than 70 % of all investigations were done with three types of material: urine (41.8 % of all the investigated samples), BAL (15.3 % of all the investigated samples) and whole blood (14.9 % of all the investigated samples). The investigations were carried out with the „in-house" nested PCR method, which uses primers from the MOMP(ompA) area of the genus Chlamydia spp. Results: Total positivity was 5.67 %, in 1.26 % of the samples the resulted was considered uncertain and 93.07 % of the investigated sampies were negative. In men PCR positivity was 6.11 %, in women 5.35 %. The major proportion of positive samples was from the age groups 70-79 years (11.67 %), 10-19 years (6.51 %) and 40-49 years (6.45 %). Overall positivity in smears from the urogenital system was 6.48 %, from urine 3.92 %, from BAL 10.70 % and from whole blood 5.51 %.

• MeSH
• diagnostické techniky molekulární metody   MeSH
• hodnocení výsledků zdravotní péče MeSH
• infekce bakteriemi čeledi Chlamydiaceae diagnóza   patologie   MeSH
• lidé MeSH
• molekulární biologie metody   MeSH
• pohlavní dimorfismus MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• populační charakteristiky MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH

• MeSH
• lidé MeSH
• novorozenec krev   MeSH
• polymerázová řetězová reakce využití   MeSH
• prenatální diagnóza využití   MeSH
• sérologické testy metody   využití   MeSH
• těhotné ženy MeSH
• Toxoplasma imunologie   izolace a purifikace   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• novorozenec krev   MeSH

• MeSH
• aspergilóza diagnóza   mikrobiologie   MeSH
• DNA fungální analýza   MeSH
• finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
• oportunní infekce diagnóza   mikrobiologie   MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH