Odborné doporučení pro lékaře ohledně očkování proti COVID-19.

• MeSH
• COVID-19 prevence a kontrola   MeSH
• vakcinace MeSH
• vakcíny proti COVID-19 škodlivé účinky   terapeutické užití   MeSH
• Publikační typ
• příručky MeSH
• směrnice MeSH

• Konspekt
• Veřejné zdraví a hygiena
• NLK Obory
• preventivní medicína
• infekční lékařství

The objective of this project is to set up the molecular surveillance of invasive meningococcal disease in the Czech Republic to be able to distinguish between vaccine failure and non-coverage by vaccine and to update the vaccination strategy recommendations according to the molecular surveillance results. To achieve this objective, the following steps will be made: collection of N. meningitidis isolates from invasive meningococcal disease, molecular characterisation of all disease-associated N. meningitidis strains by classical nucleotide sequence-based typing methods and antigen gene sequencing, implementation of new sequencing methods, i.e. whole-genome sequencing, implementation of a new PCR method, i.e. RT-PCR for non-culture molecular characterisation of agents in culture-negative cases of invasive meningococcal disease, characterisation of selected disease-associated N. meningitidis strains by whole-genome sequencing, analysis of molecular characteristics of N. meningitidis isolates, update of vaccination strategy recommendations in accordance with the results obtained.

Cílem projektu je vyvinutí molekulární surveillance invazivního meningokokového onemocnění v České republice, který umožní odlišení případů selhání vakcinace od nepokrytí vakcínou a aktualizaci doporučení vakcinační strategie v souladu se zjištěnými výsledky. K dosažení cíle povedou tyto kroky: sběr izolátů N. meningitidis z invazivního meningokokového onemocnění, molekulární charakterizace všech izolátů N. meningitidis z invazivního meningokokového onemocnění klasickými sekvenačními typizačními metodami a sekvencí genů antigenů, implementace nových sekvenačních metod, tj. sekvenace celého genomu, implementace nové PCR metody, tj. RT-PCR pro bezkultivační molekulární charakterizaci kultivačně negativních případů invazivního meningokokového onemocnění, charakterizace vybraných izolátů N. meningitidis z invazivního meningokokového onemocnění metodou sekvenace celého genomu, analýza molekulárních charakteristik izolátů N. meningitidis, aktualizace doporučení vakcinační strategie podle zjištěných výsledků.

• MeSH
• meningokokové infekce epidemiologie   MeSH
• molekulární epidemiologie MeSH
• Neisseria meningitidis MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• sekvenování celého genomu MeSH
• surveillance populace MeSH
• vakcinace MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• infekční lékařství
• epidemiologie
• molekulární biologie, molekulární medicína
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

B. pertussis isolates from 1964-2015 obtained from CR will be analysed by the following molecular methods: multilocus variable-number tandem-repeat analysis, sequencing of the ptxA/C, prnA and fim genes, and multilocus sequence typing. The study set will include 190 isolates of B. pertussis. The data will be used for analysing clonal and antigenic shifts in BP following the countrywide vaccination with the whole-cell and later with acellular pertussis vaccines in the period 1964-2015. The project is expected to answer the question whether there are new lines of B. pertussis in CR, which have the ability to spread in the vaccinated population. If so, the results of the study would be served as a basis for the draft update of vaccination strategies in CR. The fifty-year span study design is significant worldwide. The providing of B. pertussis molecular characteristics to the international databases will be relevant to the development of a novel more efficient vaccine against pertussis

V navrhovaném projektu budou izoláty B. pertussis z celé ČR z období 1964-2015 studovány molekulárními metodami: multilocus variable number tandem repeat analysis (MLVA) a sekvenací genů ptxA, prnA, fim, promotoru ptxP, a vybrané izoláty metodou multilocus sequence typing (MLST). Předpokládaná velikost studovaného souboru je 190 izolátů B. pertussis. Bude sledováno, zda v ČR došlo ke genetickému a antigennímu posunu B. pertussis v průběhu plošného očkování celobuněčnou a později acelulární vakcínou v období 1964-2015. Projekt by měl zodpovědět otázku, zda se v ČR objevují nové linie B. pertussis, které mají schopnost šířit se i v proočkované populaci. V kladném případě by výsledky studie sloužily jako podklad pro návrh aktualizace vakcinační strategie v ČR. Pokrytí padesátiletého období je významné i z mezinárodního hlediska. Poskytnutí molekulárních charakteristik B. pertussis do mezinárodních databází rozšíří poznatky potřebné k vývoji nové účinnější vakcíny proti pertusi.

• MeSH
• Bordetella pertussis genetika   MeSH
• faktory virulence rodu Bordetella analýza   MeSH
• infekce bakteriemi rodu Bordetella MeSH
• molekulární biologie MeSH
• molekulární epidemiologie MeSH
• multilokusová sekvenční typizace MeSH
• pertuse MeSH
• pertusová vakcína MeSH
• vakcinace MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• infekční lékařství
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Novel meningococcal vaccines designed using reverse vaccinology methods will be analyzed for the suitability for use in the Czech Republic (CR) to prevent serogroup B invasive meningococcal disease and non-B serogroup invasive meningococcal disease and for efficacy in inducing herd immunity in the non-vaccinated population. Molecular biological methods will be used for the study of the GNA (Genome-derived Neisserial Antigens) genes GNA1870, GNA1994, GNA1030, GNA2091 and GNA2132. N. meningitidis will also be characterized by molecular methods (MLST, and PorA, FetA and PenA sequencing). The obtained molecular typing data will be submitted to the international sequence data bases. The obtained background data will be relevant to deciding whether novel vaccines are suitable for use in CR and to updating the meningococcal vaccination strategy guidelines for the Ministry of Health.

V projektu bude studováno, zda nové meningokokové vakcíny vyrobené ve světě metodami reverzní vakcinologie jsou vhodné k použití v České republice k prevenci invazivního meningokokového onemocnění způsobeného séroskupinou B, k prevenci "non-B" invazivního meningokokového onemocnění a zda budou vyvolávat kolektivní imunitu i u nevakcinované části populace. Metodami molekulární biologie budou studovány geny GNA (Genome-derived Neisserial Antigens) Neisseria meningitidis: GNA1870, GNA1994, GNA1030, GNA2091a GNA2132. Kromě studia GNA bude prováděna molekulární charakterizace N. meningitidis (MLST, sekvenace PorA, FetA a PenA). Zjištěné molekulární charakterizace meningokoků budou hlášeny do mezinárodních databází. Výsledky projektu budou podkladem k rozhodnutí o vhodnosti nových meningokokových vakcín pro Českou republiku a k aktualizaci antimeningokokové vakcinační strategie předkládané MZ ČR.

• MeSH
• databáze genetické MeSH
• meningokokové infekce prevence a kontrola   MeSH
• meningokokové vakcíny analýza   farmakokinetika   terapeutické užití   zásobování a distribuce   MeSH
• molekulární biologie metody   MeSH
• Neisseria meningitidis séroskupiny B MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• zdravotní politika MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• infekční lékařství
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• časná diagnóza MeSH
• infekce bakteriemi čeledi Neisseriaceae MeSH
• meningokoková meningitida diagnóza   epidemiologie   prevence a kontrola   terapie   MeSH
• meningokokové infekce MeSH
• mozkomíšní mok cytologie   MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• infekční lékařství

• MeSH
• dítě MeSH
• pneumokokové infekce diagnóza   epidemiologie   terapie   MeSH
• streptokokové infekce imunologie   klasifikace   MeSH
• vakcinace MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH

• Konspekt
• Pediatrie
• NLK Obory
• pediatrie
• infekční lékařství
• NLK Publikační typ
• informační publikace

Clonal analysis of N. meningitidis by the methods of molecular biology will enable definition of participation of hypervirulent complexes on actual morbidity of invasive meningococcal disease in the Czech Republic. Multilocus sequence typing (MLST) willbe the method preferably used for clonal analysis in this project. The MLST data will be sent to the world-wide central MLST database for confirmation and registration. The definition of participation of hypervirulent complexes on actual morbidity of invasive meningococcal disease in the Czech Republic will enable to precise recommendation of vaccination strategy in the Czech Republic. Submission of Czech MLST data to the world-wide central MLST database will contribute to the knowledge which is necessary for the development of universally efficient meningococcal vaccine.

Klonální studium N. meningitidis metodami molekulární biologie umožní definovat podíl hypervirulentních komplexů na současném výskytu invazivního meningokokového onemocnění v České republice a určit trend vývoje. Ke klonálnímu studiu bude použita zejménametoda multilokusové sekvenční typizace (MLST). Získaná data budou předkládána k ověření a k registraci v celosvětové MLST databázi. Zjištění podílu hypervirulentních komplexů na výskytu invazivního meningokokového onemocnění umožní zpřesnit doporučenouvakcinační strategii v České republice. Poskytování dat do celosvětové MLST databáze přispěje k rozšíření znalostí potřebných k vývoji univerzálně účinné meningokokové vakcíny.

• MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• infekce bakteriemi čeledi Neisseriaceae MeSH
• klonální delece MeSH
• meningokokové infekce MeSH
• Neisseria meningitidis MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• vakcinace MeSH
• virové vakcíny MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• infekční lékařství
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Structural and evolutional features of recently detected, closely still undefined dominant hypervirulent clonal complex of N. meningitidis, showing increased clinical and epidemiological significance for population of Central Europe, will be assessed. Scientifically original description of the novel hypervirulent complex will be affored by a precise gene sequencing classification, offering internationally standardized definition of isolate features by the means of informational network.

Genetická analýza určí celkovou strukturu a vývojové směry nově detegovaného dosud blíže nepopsaného dominantního hypervirulentního klonálního komplexu N.meningitidis o mimořádném klinickém i epidemiologickém významu pro populaci střední Evropy. Vědeckypůvodní popis povahy nového hypervirulentního komplexu provedeme vysoce přesnou metodou genové sekvenční klasifikace, umožňující celosvětově standardizovaný popis izolátů a sdílení výsledků prostřednictvím informační sítě. Výsledky projektu bezprostředněumožní účinný monitoring pokarčujícího šíření hypervirulentního komplexu v republikovém i širším rámci jako předpoklad přijetí preventivních klinicko-epidemiologických opatření. Identifikace ústředního hypervirulentního komplexu, charakteristického proúpočetnou populaci států bývalého Východního bloku, poskytne klíčové poznatky pro volbu optimálního složení vyvíjené univerzální vakciny pro eradikaci meningokokového onemocnění.

• MeSH
• genetické testování MeSH
• meningitida epidemiologie   MeSH
• meningokokové infekce klasifikace   epidemiologie   MeSH
• meningokokové vakcíny terapeutické užití   MeSH
• Neisseria meningitidis klasifikace   patogenita   MeSH
• vakcinace MeSH
• virulence MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• neurologie
• virologie
• epidemiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• dítě MeSH
• kontrola infekce MeSH
• služby preventivní péče MeSH
• vakcinace zákonodárství a právo   normy   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• Publikační typ
• příručky MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

• Konspekt
• Pediatrie
• NLK Obory
• pediatrie
• epidemiologie

Predictive factors of IMD identified and proved in our previous studies used as objective criteria for the disease severity evaluation will be prospectively proved on the group of patients with IMD from the Czech republic during period of three years. Weevelopped databasis for IMD. It has been already to several centres, other centres will get it. Databasis will enable to collect a complete data and to evaluate all parameters including predictive. Besides examinations for identification of causing strain from previous studies defined basic minimal examinations will be done. Blood samples will be taken for further examinations, which can have predictive significance + genetic examination. reliability of predictive factors of severity will be processed.Diagnostic protocol will be defined and therapeutic protocol with adequate theraputic intensity to the severity of IMD will be worked out for all components of medical servis.

V našich studiích identifikované a ověřené předpovědní faktory invazivního meningokokového onemocnění (IMO). sloužící jako objektivní podklad závažnosti choroby, budou ověřeny prospektivně na souboru nemocných s IMO ve sledovaném období v ČR. Vyvinuli jsme databázi pro IMO. Vlastní ji několik center, zbytek spolupracujících pracovišť jí bude dovybaveno. Vznikne tak unikátní databáze IMO v ČR, umožňující sledovat všechny parametry včetně prognostických faktorů a jejich vyhodnocení. Kromě vyšetření k identifikaci agens se při podezření na IMO zajistí v předchozí studii definovaná základní minimální vyšetření. Zajistíme vzorky krve na další vyšetření, která mohou mít prognostický význam + vyšetření genetické(centrální zpracování) Vyhodnotíme spolehlivostprognostických faktorů, identifikujících závažnost onemocnění. Definujeme soubor diagnostických vyšetření a vypracujeme protokol léčebných opatření pro všechny složky léčebného řetezce s intenzitou léčby úměrnou závažnosti IMO.

• MeSH
• klinické protokoly MeSH
• meningokokové infekce diagnóza   epidemiologie   terapie   MeSH
• Neisseria meningitidis MeSH
• prediktivní hodnota testů MeSH
• prognóza MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• infekční lékařství
• bakteriologie
• epidemiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR