-
Something wrong with this record ?
Mapování výskytu makrolidové rezistence původce syfilis v ČR a molekulární typizace jednotlivých syfilitických kmenů
řešitel David Šmajs, Lenka Mikalová ; spoluřešitel Hana Zákoucká, Světlana Žufanová ; nositel Masarykova univerzita, Lékařská fakulta
- Published
- 2015
- Series
- Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
- Pagination
- 1 svazek : ilustrace, tabulky ; 30 cm
Language Czech Country Czech Republic
Grant support
NT11159
MZ0
CEP Register
Digital library NLK
In-house IP
Full text - Book
- MeSH
- Drug Resistance, Bacterial MeSH
- Macrolides MeSH
- Molecular Typing MeSH
- Polymerase Chain Reaction MeSH
- Syphilis epidemiology MeSH
- Bacterial Typing Techniques MeSH
- Treponema pallidum MeSH
- Geographicals
- Czech Republic MeSH
- Conspectus
- Patologie. Klinická medicína
- NML Fields
- epidemiologie
- NML Publication type
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR
Celogenomová sekvenace několika kmenů Treponema pallidum (TP, t.j. kmenů Nichols, SS14, Mexico A a DAL-1) umožnila vývoj vysoce specifické PCR diagnostiky TP. PCR detekce treponemální DNA umožňuje identifikovat kmenově specifické genomové sekvence a takégeneticky vyšetřovat citlivost na některá antibiotika. Cílem projektu je sběr klinických vzorků z ČR a to zejména anogenitálních stěrů a vzorků plné krve. Z těchto vzorků budeme izolovat treponemální DNA, kterou budeme po amplifikaci sekvenovat (ve variabilních chromosomálních lokusech). Navíc budeme molekulárně biologicky určovat rezistenci k makrolidovým antibiotikům a klindamycinu. Sekvence získané z různých izolátů TP budou srovnány a profil jednonukleotidových záměn, delecí a inzercí bude využit pro shlukovací analýzu treponemálních izolátů a pro epidemiologické účely. Dále budeme vyvíjet rychlejší a levnější diagnostické testy pro molekulární typizaci původce syfilis.; Whole genome sequencing of several strains of Treponema pallidum (TP, i.e. strains Nichols, SS14, Mexico A and DAL-1) allowed development of highly specific PCR diagnostics that enabled typing of TP by sequencing of variable genomic loci. Moreover, the obtained TP DNA from patients will be also tested on the presence of macrolide resistance-causing mutations in the TP genome. The proposal plans to collect TP samples (mainly genitoanal swabs and whole blood samples) from several regions of Czech Republic. The DNA extracted from clinical samples will be amplified and sequenced in several chromosomal loci including TP0136 and TP0548 genes and in the macrolide resistance locus. The obtained sequences will be analyzed and clustered and confronted with the epidemiological data. In addition, development of fast, reliable and cheap diagnostic tests for molecular typing of syphilis-causing treponemes is planned.
Doba řešení: 2010-2014
Bibliography, etc.Obsahuje literaturu
Owner | Details | Services | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
NLK | NLK Shelf no. G 4708 [1] | ||||||
Loading data ...
|
- 000
- 00000ntm 2200000 i 4500
- 001
- MED00187094
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20170327090018.0
- 007
- ta
- 008
- 151030s2015 xr d e 000 0|cze||
- 009
- ND
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e rda
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 072 _7
- $a 616 $x Patologie. Klinická medicína $2 Konspekt $9 14 $7 sk136316
- 086 __
- $a NT11159 $p MZ0
- 100 1_
- $a Šmajs, David, $d 1969- $7 xx0061318 $4 aut
- 245 10
- $a Mapování výskytu makrolidové rezistence původce syfilis v ČR a molekulární typizace jednotlivých syfilitických kmenů / $c řešitel David Šmajs, Lenka Mikalová ; spoluřešitel Hana Zákoucká, Světlana Žufanová ; nositel Masarykova univerzita, Lékařská fakulta
- 264 _0
- $c 2015
- 300 __
- $a 1 svazek : $b ilustrace, tabulky ; $c 30 cm
- 336 __
- $a text $b txt $2 rdacontent
- 337 __
- $a bez média $b n $2 rdamedia
- 338 __
- $a svazek $b nc $2 rdacarrier
- 490 1_
- $a Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
- 500 __
- $a Doba řešení: 2010-2014
- 504 __
- $a Obsahuje literaturu
- 520 0_
- $a Celogenomová sekvenace několika kmenů Treponema pallidum (TP, t.j. kmenů Nichols, SS14, Mexico A a DAL-1) umožnila vývoj vysoce specifické PCR diagnostiky TP. PCR detekce treponemální DNA umožňuje identifikovat kmenově specifické genomové sekvence a takégeneticky vyšetřovat citlivost na některá antibiotika. Cílem projektu je sběr klinických vzorků z ČR a to zejména anogenitálních stěrů a vzorků plné krve. Z těchto vzorků budeme izolovat treponemální DNA, kterou budeme po amplifikaci sekvenovat (ve variabilních chromosomálních lokusech). Navíc budeme molekulárně biologicky určovat rezistenci k makrolidovým antibiotikům a klindamycinu. Sekvence získané z různých izolátů TP budou srovnány a profil jednonukleotidových záměn, delecí a inzercí bude využit pro shlukovací analýzu treponemálních izolátů a pro epidemiologické účely. Dále budeme vyvíjet rychlejší a levnější diagnostické testy pro molekulární typizaci původce syfilis.
- 520 9_
- $a Whole genome sequencing of several strains of Treponema pallidum (TP, i.e. strains Nichols, SS14, Mexico A and DAL-1) allowed development of highly specific PCR diagnostics that enabled typing of TP by sequencing of variable genomic loci. Moreover, the obtained TP DNA from patients will be also tested on the presence of macrolide resistance-causing mutations in the TP genome. The proposal plans to collect TP samples (mainly genitoanal swabs and whole blood samples) from several regions of Czech Republic. The DNA extracted from clinical samples will be amplified and sequenced in several chromosomal loci including TP0136 and TP0548 genes and in the macrolide resistance locus. The obtained sequences will be analyzed and clustered and confronted with the epidemiological data. In addition, development of fast, reliable and cheap diagnostic tests for molecular typing of syphilis-causing treponemes is planned.
- 650 07
- $a epidemiologie $7 nlk20040147247 $2 mednas
- 650 07
- $a Treponema pallidum $7 D014210 $2 czmesh
- 650 07
- $a syfilis $x epidemiologie $7 D013587 $2 czmesh
- 650 07
- $a makrolidy $7 D018942 $2 czmesh
- 650 07
- $a bakteriální léková rezistence $7 D024881 $2 czmesh
- 650 07
- $a techniky typizace bakterií $7 D015373 $2 czmesh
- 650 07
- $a molekulární typizace $7 D058889 $2 czmesh
- 650 07
- $a polymerázová řetězová reakce $7 D016133 $2 czmesh
- 651 _7
- $a Česká republika $7 D018153 $2 czmesh
- 655 _4
- $a závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR $7 nlk-pt176
- 700 1_
- $a Mikalová, Lenka $7 xx0199108 $4 aut
- 700 1_
- $a Zákoucká, Hana $7 xx0074478 $4 clb
- 700 1_
- $a Žufanová, Svetlana $7 xx0142609 $4 clb
- 710 2_
- $a Masarykova univerzita. $b Lékařská fakulta $7 kn20010709277
- 810 1_
- $a Česko. $b Ministerstvo zdravotnictví. $b Interní grantová agentura. $t Závěrečná zpráva o řešení grantu
- 856 41
- $u https://kramerius.medvik.cz/search/handle/uuid:MED00187094-99870291-7ba0-467c-ba39-13d3da7a7a3c $y Digitální knihovna
- 910 __
- $a ABA008 $b G 4708 $y f
- 990 __
- $a 20151027095536 $b ABA008
- 991 __
- $a 20170327090257 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b medvik21 $g 1095409 $s 201142
- BAS __
- $a 30
- LZP __
- $b granty 1/2015