Detail
Výzkumná zpráva
FT
Medvik - Katalogy
  • Je něco špatně v tomto záznamu ?

Mapování výskytu makrolidové rezistence původce syfilis v ČR a molekulární typizace jednotlivých syfilitických kmenů

řešitel David Šmajs, Lenka Mikalová ; spoluřešitel Hana Zákoucká, Světlana Žufanová ; nositel Masarykova univerzita, Lékařská fakulta

Publikováno
2015
Edice
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
Stránkování
1 svazek : ilustrace, tabulky ; 30 cm

Jazyk čeština Země Česko

Typ dokumentu závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/MED00187094

Grantová podpora
NT11159 MZ0 CEP - Centrální evidence projektů

Digitální knihovna NLK
Neveřejné AZ-IP
Plný text - Kniha

Odkazy

Digitální knihovna

Celogenomová sekvenace několika kmenů Treponema pallidum (TP, t.j. kmenů Nichols, SS14, Mexico A a DAL-1) umožnila vývoj vysoce specifické PCR diagnostiky TP. PCR detekce treponemální DNA umožňuje identifikovat kmenově specifické genomové sekvence a takégeneticky vyšetřovat citlivost na některá antibiotika. Cílem projektu je sběr klinických vzorků z ČR a to zejména anogenitálních stěrů a vzorků plné krve. Z těchto vzorků budeme izolovat treponemální DNA, kterou budeme po amplifikaci sekvenovat (ve variabilních chromosomálních lokusech). Navíc budeme molekulárně biologicky určovat rezistenci k makrolidovým antibiotikům a klindamycinu. Sekvence získané z různých izolátů TP budou srovnány a profil jednonukleotidových záměn, delecí a inzercí bude využit pro shlukovací analýzu treponemálních izolátů a pro epidemiologické účely. Dále budeme vyvíjet rychlejší a levnější diagnostické testy pro molekulární typizaci původce syfilis.; Whole genome sequencing of several strains of Treponema pallidum (TP, i.e. strains Nichols, SS14, Mexico A and DAL-1) allowed development of highly specific PCR diagnostics that enabled typing of TP by sequencing of variable genomic loci. Moreover, the obtained TP DNA from patients will be also tested on the presence of macrolide resistance-causing mutations in the TP genome. The proposal plans to collect TP samples (mainly genitoanal swabs and whole blood samples) from several regions of Czech Republic. The DNA extracted from clinical samples will be amplified and sequenced in several chromosomal loci including TP0136 and TP0548 genes and in the macrolide resistance locus. The obtained sequences will be analyzed and clustered and confronted with the epidemiological data. In addition, development of fast, reliable and cheap diagnostic tests for molecular typing of syphilis-causing treponemes is planned.

Doba řešení: 2010-2014

Bibliografie atd.

Obsahuje literaturu

Vlastník Detaily Služby
NLK NLK Signatura G 4708 [1]
Ročník/svazek Lokace Signatura Stav Objednat
000      
00000ntm 2200000 i 4500
001      
MED00187094
003      
CZ-PrNML
005      
20170327090018.0
007      
ta
008      
151030s2015 xr d e 000 0|cze||
009      
ND
040    __
$a ABA008 $b cze $d ABA008 $e rda
041    0_
$a cze $b eng
044    __
$a xr
072    _7
$a 616 $x Patologie. Klinická medicína $2 Konspekt $9 14 $7 sk136316
086    __
$a NT11159 $p MZ0
100    1_
$a Šmajs, David, $d 1969- $7 xx0061318 $4 aut
245    10
$a Mapování výskytu makrolidové rezistence původce syfilis v ČR a molekulární typizace jednotlivých syfilitických kmenů / $c řešitel David Šmajs, Lenka Mikalová ; spoluřešitel Hana Zákoucká, Světlana Žufanová ; nositel Masarykova univerzita, Lékařská fakulta
264    _0
$c 2015
300    __
$a 1 svazek : $b ilustrace, tabulky ; $c 30 cm
336    __
$a text $b txt $2 rdacontent
337    __
$a bez média $b n $2 rdamedia
338    __
$a svazek $b nc $2 rdacarrier
490    1_
$a Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
500    __
$a Doba řešení: 2010-2014
504    __
$a Obsahuje literaturu
520    0_
$a Celogenomová sekvenace několika kmenů Treponema pallidum (TP, t.j. kmenů Nichols, SS14, Mexico A a DAL-1) umožnila vývoj vysoce specifické PCR diagnostiky TP. PCR detekce treponemální DNA umožňuje identifikovat kmenově specifické genomové sekvence a takégeneticky vyšetřovat citlivost na některá antibiotika. Cílem projektu je sběr klinických vzorků z ČR a to zejména anogenitálních stěrů a vzorků plné krve. Z těchto vzorků budeme izolovat treponemální DNA, kterou budeme po amplifikaci sekvenovat (ve variabilních chromosomálních lokusech). Navíc budeme molekulárně biologicky určovat rezistenci k makrolidovým antibiotikům a klindamycinu. Sekvence získané z různých izolátů TP budou srovnány a profil jednonukleotidových záměn, delecí a inzercí bude využit pro shlukovací analýzu treponemálních izolátů a pro epidemiologické účely. Dále budeme vyvíjet rychlejší a levnější diagnostické testy pro molekulární typizaci původce syfilis.
520    9_
$a Whole genome sequencing of several strains of Treponema pallidum (TP, i.e. strains Nichols, SS14, Mexico A and DAL-1) allowed development of highly specific PCR diagnostics that enabled typing of TP by sequencing of variable genomic loci. Moreover, the obtained TP DNA from patients will be also tested on the presence of macrolide resistance-causing mutations in the TP genome. The proposal plans to collect TP samples (mainly genitoanal swabs and whole blood samples) from several regions of Czech Republic. The DNA extracted from clinical samples will be amplified and sequenced in several chromosomal loci including TP0136 and TP0548 genes and in the macrolide resistance locus. The obtained sequences will be analyzed and clustered and confronted with the epidemiological data. In addition, development of fast, reliable and cheap diagnostic tests for molecular typing of syphilis-causing treponemes is planned.
650    07
$a epidemiologie $7 nlk20040147247 $2 mednas
650    07
$a Treponema pallidum $7 D014210 $2 czmesh
650    07
$a syfilis $x epidemiologie $7 D013587 $2 czmesh
650    07
$a makrolidy $7 D018942 $2 czmesh
650    07
$a bakteriální léková rezistence $7 D024881 $2 czmesh
650    07
$a techniky typizace bakterií $7 D015373 $2 czmesh
650    07
$a molekulární typizace $7 D058889 $2 czmesh
650    07
$a polymerázová řetězová reakce $7 D016133 $2 czmesh
651    _7
$a Česká republika $7 D018153 $2 czmesh
655    _4
$a závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR $7 nlk-pt176
700    1_
$a Mikalová, Lenka $7 xx0199108 $4 aut
700    1_
$a Zákoucká, Hana $7 xx0074478 $4 clb
700    1_
$a Žufanová, Svetlana $7 xx0142609 $4 clb
710    2_
$a Masarykova univerzita. $b Lékařská fakulta $7 kn20010709277
810    1_
$a Česko. $b Ministerstvo zdravotnictví. $b Interní grantová agentura. $t Závěrečná zpráva o řešení grantu
856    41
$u https://kramerius.medvik.cz/search/handle/uuid:MED00187094-99870291-7ba0-467c-ba39-13d3da7a7a3c $y Digitální knihovna
910    __
$a ABA008 $b G 4708 $y f
990    __
$a 20151027095536 $b ABA008
991    __
$a 20170327090257 $b ABA008
999    __
$a ok $b medvik21 $g 1095409 $s 201142
BAS    __
$a 30
LZP    __
$b granty 1/2015