Využití čipových technologií a metod molekulární genetiky pro studium genových změn v nádorovém genomu nemocných s CLL s cílem určit genetické změny prognostického významu a tyto poznatky využít ke studiu role a významu genetických změn v patogenezi onemocnění a cílené léčbě "šité na míru". Projekt bude: A) metodou arrayCGH s oligonukleotidovými, SNPs a chromosomově specifickými čipy analyzovat genom nemocných s CLL v době diagnózy a průběhu onemocnění B) pomocí metod molekulární cytogenetiky mapovat zlomová místa na chromosomech 6, 11 a 13 C) pomocí molekulárně genetických metod (např. RT-PCR, Q-RT-PCR, HRMC) sledovat expresi vybraných genů včetně miRNA D) pomocí analýzy proteinů sledovat signální dráhy odpovědi na poškozenou DNA E) pomocí analýzy klinických dat chceme co nejpřesněji prognosticky charakterizovat nepříznivé podskupiny nemocných a najít pro ně optimální léčebný přístup využívající cílenou léčbou šitou na míru; To use chip technologies and molecular genetic methods in the study of gene changes in the tumor genome of patients with CLL to determine genetic changes of a prognostic significance and to acquire knowledge applied in studying the role and impact of genetic changes in the pathogenesis of CLL. Based on the knowledge: A) the arrayCGH method with oligonucleotide, SNPs and chromosome-specific chips will be used to analyze the genome of CLL patients at diagnosis and in the course of the disease B) arrayCGH and FISH with specific probes will be used for mapping the breakpoints in patients with changes on chromosomes 6, 11 and 13 C) molecular genetic methods (e.g. RT-PCR, Q-RT-PCR, sequencing) will be used to study expression of selected genes and other potential candidate genes D) the protein analysis will be used to follow signaling pathways of DNA damage response (DDR) E) clinical data will be analyzed to obtain detailed clinically prognostic characteristics of the analyzed subgroups of patients

Doba řešení: 2012-2015