Genetics
viii, 224 stran : 16 grafických znázornění, ilustrace, 12 tabulek
- Konspekt
- Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
- NLK Obory
- cytologie, klinická cytologie
- genetika, lékařská genetika
- NLK Publikační typ
- kolektivní monografie
Východiska: Meningeomy jsou častými primární nádory mozku s roční incidencí 3–8 případů na 100 000 obyvatel. Přestože se většinou jedná o benigní onemocnění, zhoršuje často svým charakterem a lokalizací svému nositeli kvalitu života. Základními léčebnými metodami jsou neurochirurgická exstirpace nebo stereotaktické ozáření. Obě metody dosahují velmi dobrých léčebných výsledků, přesto část pacientů trpí recidivou onemocnění vyžadující další intervenci s rizikem vzniku nebo zhoršení neurologického deficitu. Nevelké meningeomy bez růstové tendence a s absencí symptomatologie bývají často sledovány. Na druhou stranu se nelze spokojit s dlouhodobými výsledky léčby meningeomů s agresivnějším biologickým chováním. Známým rizikem recidivy meningeomů je vyšší grade, často je však obtížné identifikovat podskupiny, které vykazují prospěch z kombinované neurochirurgické operace a radioterapie, resp. u kterých je vhodné hledat cesty k další eskalaci léčby, a to i za cenu jistých vedlejších účinků. Pro rozvoj personalizované medicíny se perspektivně jeví analýza hormonální, cytogenetické i epigenetické výbavy nádorů. Cíl: Cílem práce je shrnout poznatky o epidemiologii, léčebných algoritmech a prognóze meningeomů mozku a navrhnout perspektivní prognostické a prediktivní faktory pro maximálně individualizovanou terapii.
Background: Common primary brain tumors are meningiomas with year incidence 3–8 cases per 100 000 people. Even though we mainly speak about benign disease, with its character and localization, it worsens the life quality to its bearer. The main therapeutic methods are neurosurgery extirpation and stereotactic radiosurgery. Despite reaching very good therapeutic results with both methods, some of the patients suffer with recurrence of the disease requiring other interventions with the risk of creating or worsening a neurological deficit. Small meningiomas without growing tendency and with the absence of symptomatology are observed. On the other hand, we cannot be satisfied with long-term results of the therapy of meningiomas with more aggressive biological behavior. A higher grade is a known risk of meningioma recurrence; however, it is often difficult to identify subgroups that show advantage of a combination of neurosurgery and radiosurgery, respectfully at which it is appropriate to look for ways to treatment escalation, and that is with the risk of side effects. The analysis of hormonal, cytogenetics and epigenetics tumor equipment seems to be the most promising for the development of personalized treatment. Purpose: The aim of this work is to sum up the facts about epidemiology, treatment algorithms and the prognosis of brain meningiomas and to suggest perspective prognostic and predictive factors for maximally individualized therapy.
- MeSH
- cytogenetika MeSH
- lidé MeSH
- meningeom * chirurgie genetika radioterapie MeSH
- prognóza MeSH
- radiochirurgie metody MeSH
- stereotaktické techniky MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- Klíčová slova
- syndrom krátkého QT,
- MeSH
- Brugadův syndrom etiologie genetika MeSH
- chromozomální aberace klasifikace MeSH
- cytogenetika MeSH
- fibrilace komor etiologie genetika MeSH
- genetické testování * klasifikace metody MeSH
- geny MeSH
- kardiomyopatie etiologie genetika klasifikace MeSH
- karyotyp MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- nemoci srdce * etiologie genetika klasifikace MeSH
- srdeční arytmie etiologie genetika klasifikace MeSH
- syndrom dlouhého QT etiologie genetika MeSH
- terminologie jako téma MeSH
- typy dědičnosti MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Our novel Python-based tool EVANGELIST allows the visualization of GC and repeats percentages along chromosomes in sequenced genomes and has enabled us to perform quantitative large-scale analyses on the chromosome level in fish and other vertebrates. This is a different approach from the prevailing analyses, i.e., analyses of GC% in the coding sequences that make up not more than 2% in human. We identified GC content (GC%) elevations in microchromosomes in ancient fish lineages similar to avian microchromosomes and a large variability in the relationship between the chromosome size and their GC% across fish lineages. This raises the question as to what extent does the chromosome size drive GC% as posited by the currently accepted explanation based on the recombination rate. We ascribe the differences found across fishes to varying GC% of repetitive sequences. Generally, our results suggest that the GC% of repeats and proportion of repeats are independent of the chromosome size. This leaves an open space for another mechanism driving the GC evolution in vertebrates.
- MeSH
- chromozomy genetika MeSH
- cytogenetika * MeSH
- genom genetika MeSH
- molekulární evoluce * MeSH
- obratlovci klasifikace genetika MeSH
- ptáci klasifikace genetika MeSH
- rekombinace genetická genetika MeSH
- repetitivní sekvence nukleových kyselin MeSH
- ryby klasifikace genetika MeSH
- zastoupení bazí genetika MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Turtles, a speciose group consisting of more than 300 species, demonstrate karyotypes with diploid chromosome numbers ranging from 2n = 26 to 2n = 68. However, cytogenetic analyses have been conducted only to 1/3rd of the turtle species, often limited to conventional staining methods. In order to expand our knowledge of the karyotype evolution in turtles, we examined the topology of the (TTAGGG)n telomeric repeats and the rDNA loci by fluorescence in situ hybridization (FISH) on the karyotypes of two emydids: the Sicilian pond turtle, Emys trinacris, and the yellow-bellied slider, Trachemys scripta scripta (family Emydidae). Furthermore, AT-rich and GC-rich chromosome regions were detected by DAPI and CMA3 stains, respectively. The cytogenetic analysis revealed that telomeric sequences are restricted to the terminal ends of all chromosomes and the rDNA loci are localized in one pair of microchromosomes in both species. The karyotype of the Sicilian endemic E. trinacris with diploid number 2n = 50, consisting of 13 pairs of macrochromosomes and 12 pairs of microchromosomes, is presented here for first time. Our comparative examination revealed similar cytogenetic features in Emys trinacris and the closely related E. orbicularis, as well as to other previously studied emydid species, demonstrating a low rate of karyotype evolution, as chromosomal rearrangements are rather infrequent in this group of turtles.
- MeSH
- cytogenetika metody MeSH
- hybridizace in situ fluorescenční metody MeSH
- karyotyp * MeSH
- molekulární evoluce * MeSH
- ribozomální DNA genetika MeSH
- telomery genetika MeSH
- želvy genetika MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- ženské pohlaví MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Chromozomové aberace hrají významnou roli v patogenezi a vývoji chronické lymfocytární leukemie (CLL), charakterizují průběh onemocnění a mají vliv na volbu léčebné strategie. Mezi změny se známým prognostickým významem patří delece oblastí 11q, 13q, 17p a trizomie chromozomu 12. V poslední době je velmi diskutován význam dalších rekurentních cytogenetických aberací, jako jsou např. zmnožení 2p, delece 6q21, duplikace 8q24, přestavby 14q32 a komplexní karyotyp. Chromozomové aberace detekujeme metodami klasického G-pruhování, fluorescenční in situ hybridizací (FISH) a v některých případech doplňující metodou array komparativní genomické hybridizace (arrayCGH). Zavedení metody sekvenování nové generace (NGS) vedlo v posledních letech k identifikaci genových mutací (zejména TP53, NOTCH1, SF3B1 a BIRC3), které zpřesnily stratifikaci pacientů a ovlivňují volbu léčebné strategie. Prognostické a prediktivní modely vzniklé kombinací všech uvedených metod by do budoucna měly lépe vypovídat o dynamice průběhu onemocnění a klonálním vývoji a měly by vést ke zpřesnění stanovení odpovědi na léčbu a přežití nemocných.
Chromosomal aberrations play an important role in the pathogenesis and development of chronic lymphocytic leukaemia (CLL). They characterize the course of the disease and influence decisions regarding treatment. Aberrations with well-known prognostic significance include deletions of regions 11q, 13q, 17p and trisomy of chromosome 12. The importance of other recurrent cytogenetic abnormalities, such as duplications of 2p or 8q24, deletion of 6q21, translocations of 14q32 and complex karyotype have recently come under closer scrutiny. Chromosome aberrations are detected by classical G-banding, fluorescent in situ hybridization (FISH) and in some cases by contemporary array comparative genomic hybridization (arrayCGH). The implementation of next generation sequencing (NGS) has helped identify new gene mutations (particularly TP53, NOTCH1, SF3B1 and BIRC3), which refine patient stratification and influence the choice of treatment strategy. In future, prognostic and predictive models resulting from the combination of all mentioned methods will better reflect disease dynamics and clonal evolution and lead to a more accurate assessment of treatment response and survival.
