Projekt se zaměřuje na molekulární diagnostiku vzácných nefropatií, konkrétně atypického hemolyticko-uremického syndromu (aHUS) a steroidrezistentního nefrotického syndromu (SRNS). Vzhledem k výrazně zvětšenému spektru genů (více jak 24 u SRNS a 7 u aHUS) navrhuje časově náročné a nákladné sekvenování Sangerovo, které udržitelně nepokrývá veškeré známé geny a nezachytí unikátní nové geny, nahradit zaměřeným a exomovým sekvenováním. Prokázání genetické formy SRNS umožňuje individualizace terapie a redukuje zátěž pacientů se SRNS imunosupresivy, které na rozdíl od imunologických variant nejsou indikovány, a umožňuje omezit provedení invazivních vyšetření (biopsie ledviny). Projekt má též za cíl funkčně charakterizovat nalezené genotypy a vyhledat potencionální negenetické biomarkery onemocnění (klinickým fenotypováním a pomocí nových technik využívajících obrazové cytometrie a přímé analýzy podocytů), Finálním cílem je vytvoření racionálního diagnostického schématu pro SRNS a aHUS.; The project continues and significantly broadens the already established long term effort of the team to provide the most accurate genotype analysis for the patients with steroid resistant nephrotic syndrome (SRNS) and atypical hemolytic uremic syndrome (aHUS). The already established methods of diagnosis using Sanger sequencing cannot sustainably cover the whole spectrum and provide only partial information on the genotype after the recent emergent increase of the number of genes causing SRNS and aHUS. The only possibility to continue the effective diagnostic process and provide accurate up-to-date diagnosis is through adopting the novel massive parallel next-gene sequencing methods (NGS) and analyze the unknown variants on protein function level. The knowledge of genetic background is also clinically relevant for the patient. It allows to stop immunosuppressive treatment in genetic SRNS and has a predictive value after kidney transplantation (no recurrence in graft in certain types).

Individualization of therapy of rare nephropathies in children based on new molecular pathophysiology diagnostic

Doba řešení: 2015-2018

Obsahuje literaturu