Growing incidence of Gram-negative bacteria resistant to drugs of last resort, carbapenems and colistin, represents one of the major issues of current medicine. Until recently, these bacteria were associated mainly with hospitalized patients, however, their spreading among animals and in the environment is being increasingly reported over last years. The project is focused on the evaluation of sources and transmission pathways of Enterobacteriace carrying plasmid-mediated genes for resistance to colistin and carbapenems in humans, food-producing animals, food, the environment and wildlife in the Czech Republic. Selective cultivation of resistant isolates will be followed by complex molecular-epidemiological typing, whole-genome sequencing and comparative plasmid analysis. The role of food chain and the environment as secondary reservoirs of clinically relevant resistance mechanisms and risks for public health will be determined. Factors favouring their selection and maintenance in human and non-human sources will be evaluated, and interventions to limit their spread will be proposed.

Rostoucí incidence gramnegativních bakterií rezistentních k antibiotikům poslední volby, karbapenemům a kolistinu, představuje jeden z nejzávažnějších problémů současné medicíny. Do nedávna byly tyto rezistentní bakterie nacházeny zejména u hospitalizovaných pacientů, v posledních letech je však pozorováno jejich šíření mezi zvířaty a v prostředí. Projekt je zaměřen na sledování zdrojů a cest šíření plazmidově kódované rezistence ke karbapenemům a kolistinu u Enterobacteriaceae z člověka, potravinových zvířat, potravin, prostředí a volně žijících živočichů v České republice. Selektivní kultivace rezistentních izolátů bude doplněna komplexní molekulárně-epidemiologickou typizací, celogenomovým sekvenováním a komparativní analýzou plazmidů. Bude zhodnocen význam potravinového řetězce a prostředí jako sekundárních zdrojů bakterií s klinicky významnými mechanizmy rezistence a rizika pro veřejné zdraví. Budou studovány faktory přispívající k jejich selekci a udržování v humánních i nehumánních zdrojích a navržena opatření k omezení jejich šíření.

Enterobacteriaceae resistant to carbapenems and colistin: One-Health approach in addressing human and non-human sources of emerging antimicrobial resistance mechanisms

Doba řešení: 2018-2021

Obsahuje literaturu