Kolorektální karcinom (CRC) je druhou nejčastější rakovinou v České republice a jednou z hlavních příčin úmrtí. Navzdory nedávným pokrokům zůstává časná identifikace pacientů s rizikovými typy nádorů a účinného léčebného režimu i nadále náročná. Klíčovým limitujícím faktorem identifikace přesných prognostických a prediktivních biomarkerů je heterogenita v rámci nádoru / intratumorální heterogenita (ITH). Proto je nutné odhalit, do jaké míry jsou naše současné molekulární testy ovlivněny ITH a zda by cílený odběr určité části tumoru vedl k přesnějším prognostickým a prediktivním biomarkerům. Předložený projekt je zaměřen na studium klinického dopadu ITH prostřednictvím vzorkování nádorů z více oblastí. DNA a RNA budou izolovány z morfologicky odlišných oblastí nádoru (např. serrated / papilární oblast, invazivní fronta atd.) a využity k identifikaci klinicky relevantních biomarkerů. Předložený projekt má dvě hlavní oblasti zkoumání. První je zaměřena na mutační heterogenitu primárních nádorů u pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem léčených v první linii antiEGFR léčbou a to na analýzu pacientů s krátkým vs. dlouhodobým přežitím bez progrese. Druhý směr se zabývá otázkou vlivu ITH na prognózu doby do relapsu u pacientů stádia II, kteří nebyli léčeni adjuvantní chemoterapií. Využití více uniformních oblastí (z pohledu zastoupení buněk) může umožnit odhalení nových biomarkerů, které by jinak byly zastíněny dominantní buněčnou populací v celém objemu nádoru. Standardizace vzorkování kolorektálního karcinomu na jasně identifikovatelnou morfologickou oblast zmožní reprodukovatelnost těchto biomarkerů napříč studiemi a umožní jejich využití v klinické praxi.; Colorectal cancer (CRC) is the second most common cancer in Czech Republic and one of the leading causes of death. Despite recent advances, the recognition of high risk cases in early stages and the identification of the effective drug regimen remain challenging. A key factor limiting our ability to identify accurate prognostic and predictive biomarkers is the intra-tumour heterogeneity (ITH). Hence, there is an immediate need to understand to what extent our current molecular tests are influenced by ITH and whether a targeted tumour sampling would lead to more accurate prognostic and predictive biomarkers. The current proposal aims at studying the clinical implications of ITH by using multi-region tumour sampling. DNA and RNA will be extracted from morphologically distinct tumour regions (e.g. serrated/papillary, invasion front, etc.) and used for the identification of clinically actionable biomarkers. The project has two major directions of investigation. A first one studies the mutation heterogeneity of primaries for tumours with short vs longer progression-free survival in metastatic setting under anti-EGFR first line treatment. The second direction addresses the question of ITH impact on predicting the time-to-relapse for stage II patients not undergoing adjuvant chemotherapy. The use of more uniform regions (from a cell composition perspective) may allow unveiling novel biomarkers that otherwise would be obscured by the dominant cell population from bulk tumour sampling. Also, by anchoring the tumour sampling to clearly identifiable morphological region, these biomarkers would be reproducible across studies, bringing them closer to a clinical application.

Clinical implications of intra-tumour heterogeneity in colon cancer

Doba řešení: 2019-2023

Obsahuje literaturu