Cíl: Vyhodnotit účinnost diskového difuzního testu pro epidemiologickou ivpizaci nemocničních kmenů komplexu Acinelobacter calcoaceticus Acinelobacter haumannii. Metodika: Antibiotika pro typizaci byla vybrána z 18 preparátů podle distribučních charakteristik a vzájemné korelace u epidemiologicky heterogenniho souboru kmenů (n = 103). Sestavy průměrů inhibičních zón (kvantitativní antibiogramy) byly porovnány pomocí shlukové analýzy s euklidovskou vzdáleností (E) jako koeficientem podobnosti. Rozlišovací účinnost kvantitativního antibiogramu a dalších epidemiologických markerů byla vypočtena pomocí diskriminačního indexu (D) pro 57 epidemiologicky nesouvisejících kmenů. Stabilita a epidemiologická konkordance byla analyzována u devíti skupin, z nichž každá zahrnovala pouze izoláty s epidemiologickou vazbou (n = 46). Výsledky: Typizační sestava zahrnovala 11 antibiotik (ampicilin+sulbaktam, piperacilin, ceftazidim, imipenem, ko-trimoxazol, ofloxacin, gentamicin, tobramycin, amikacin, netilmicin a tetracyklín). Reprodukovatelnost kvanfitativního antibiogramu byla 97 % při E < 8. Ve srovnání s ribotypizací a biotypizací dosáhla tato metoda nejvyšší rozlišovací účinnost pro multirezistentní kmeny A. haumannii (D = 0,95). Výsledkem numerické analýzy kvantitativních antibiogramu u 46 multirezistentnich izolátů A. baumannii bylo osm zřetelně odlišených shluků. Sedm shluků zahrnovalo pouze izoláty s epidemiologickou vazbou a shodným genotypem, jeden shluk obsahoval izoláty dvou biochemicky i genotypově odlišných skupin a dva izoláty zůstaly z důvodu nestability rezistence nezařazeny. Závěr: Analýza kvantitativních antibiogramu je vhodnou metodou typizace multirezistentnich kmenů A. haumannii. Má vysokou rozlišovací účinnost a umožňuje diferencovat kmeny s podobným genotypem. Meze metody vyplývají z nestability markerů rezistence a fenotypové konvergence.

Objective: To assess the efficacy of the disk diffusion lest in epidemiologital typing of hospital strains of the Acinetohacter calcoaceticus Acinelohacter haumannii complex. Methods: The antibiotics for typing were selected from 18 drugs according to the distribufion characteristics and correlation in 103 epidemiologically unrelated strains. Sets of inhibition zone diameters, i.e. quantitative antibiograms, were compared using cluster analysis with Euclidian distance as the criterion of similarity. To evaluate the discriminatory power of the quantitative anfibiogram and other phenotypic and genotypic markers, discrimination indices (D) were calculated from the data obtained with 57 epidemiologically unrelated strains. Stability and epidemiologic concordance were tested in nine groups of epidemiologically related A. baumannii isolates (n = 46). Results: Eleven antibiotics were selected for typing: ampicillin+sulbactam, piperacillin, ceftazidime, imipenem, co-trimoxazole, ofloxacinin, gentamicin, tobramycin, amikacin, netilmicin and tetracycline. The reproducibility of the quantitative antibiograms was 97 % at the Euaclidian distance lower than or equal to 8. Compared to ribotyping and biotyping, the discriminatory power of quantitative anfibiogram typing was highest for the multiresistant strains of A. haumannii (D = 0,95). Numerical analysis of the antibiograms of 46 mulfiresistant A. baumannii isolates yielded eight disfinct clusters which correlated with the epidemiological data and genotypic properfies of the isolates. Each of seven clusters grouped c only epidemiologically related isolates, while one cluster united the isolates belonging to two genetically and epidemiologically distinct grouptps, and two isolates remained unclustered due to their instability in resistance. Conclusion: The similarity analysis of quantitative anfibiograms is a suitable tool for typing multiresistant strains of A. haumannii, having a high discriminatory power and potenfial for differenfiating strains with similar genotypes. Limits to the method are given by the instability of the resistance markers and phenotypic convergence.

Státní zdravotní ústav Praha 10

Use of the disk diffusion test for epidemiological typing of multiresistant Acinetobacter baumannii strains

Využití diskového difuzního testu v epidemiologické typizaci multirezistentních kmenů Acinetobacter baumannii = Use of the disk diffusion test for epidemiological typing of multiresistant Acinetobacter baumannii strains /

Use of the disk diffusion test for epidemiological typing of multiresistant Acinetobacter baumannii strains /

Lit: 31

Souhrn: eng