-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
YbxF, a protein associated with exponential-phase ribosomes in Bacillus subtilis
L Sojka, V Fucik, L Krasny, I Barvik, J Jonak
Jazyk angličtina Země Spojené státy americké
NLK
Free Medical Journals
od 1916 do Před 6 měsíci
Freely Accessible Science Journals
od 1916 do Před 6 měsíci
PubMed Central
od 1916 do Před 1 rokem
Europe PubMed Central
od 1916 do Před 6 měsíci
Open Access Digital Library
od 1916-01-01
Open Access Digital Library
od 1916-01-01
- MeSH
- Bacillus subtilis genetika metabolismus růst a vývoj MeSH
- bakteriální geny MeSH
- bakteriální proteiny genetika chemie metabolismus MeSH
- delece genu MeSH
- financování organizované MeSH
- fluorescenční mikroskopie MeSH
- molekulární modely MeSH
- mutace MeSH
- mutageneze cílená MeSH
- počítačová simulace MeSH
- rekombinantní fúzní proteiny genetika chemie metabolismus MeSH
- ribozomy metabolismus MeSH
- sekundární struktura proteinů MeSH
- vazba proteinů MeSH
- zelené fluorescenční proteiny genetika metabolismus MeSH
The ybxF gene is a member of the streptomycin operon in a wide range of gram-positive bacteria. In Bacillus subtilis, it codes for a small basic protein (82 amino acids, pI 9.51) of unknown function. We demonstrate that, in B. subtilis, YbxF localizes to the ribosome, primarily to the 50S subunit, with dependence on growth phase. Based on three-dimensional structures of YbxF generated by homology modeling, we identified helix 2 as important for the interaction with the ribosome. Subsequent mutational analysis of helix 2 revealed Lys24 as crucial for the interaction. Neither the B. subtilis ybxF gene nor its paralogue, the ymxC gene, is essential, as shown by probing DeltaybxF, DeltaymxC, or DeltaybxF DeltaymxC double deletion strains in several functional assays.
- 000
- 02715naa 2200505 a 4500
- 001
- bmc10012661
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20121112121143.0
- 008
- 100526s2007 xxu e eng||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $c ABA008 $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a eng
- 044 __
- $a xxu
- 100 1_
- $a Sojka, Luděk $7 xx0140415
- 245 10
- $a YbxF, a protein associated with exponential-phase ribosomes in Bacillus subtilis / $c L Sojka, V Fucik, L Krasny, I Barvik, J Jonak
- 314 __
- $a Institute of Molecular Genetics ASCR, Videnska 1083, 142 20 Prague 4, Czech Republic
- 520 9_
- $a The ybxF gene is a member of the streptomycin operon in a wide range of gram-positive bacteria. In Bacillus subtilis, it codes for a small basic protein (82 amino acids, pI 9.51) of unknown function. We demonstrate that, in B. subtilis, YbxF localizes to the ribosome, primarily to the 50S subunit, with dependence on growth phase. Based on three-dimensional structures of YbxF generated by homology modeling, we identified helix 2 as important for the interaction with the ribosome. Subsequent mutational analysis of helix 2 revealed Lys24 as crucial for the interaction. Neither the B. subtilis ybxF gene nor its paralogue, the ymxC gene, is essential, as shown by probing DeltaybxF, DeltaymxC, or DeltaybxF DeltaymxC double deletion strains in several functional assays.
- 650 _2
- $a Bacillus subtilis $x genetika $x metabolismus $x růst a vývoj $7 D001412
- 650 _2
- $a bakteriální proteiny $x genetika $x chemie $x metabolismus $7 D001426
- 650 _2
- $a počítačová simulace $7 D003198
- 650 _2
- $a delece genu $7 D017353
- 650 _2
- $a bakteriální geny $7 D005798
- 650 _2
- $a zelené fluorescenční proteiny $x genetika $x metabolismus $7 D049452
- 650 _2
- $a fluorescenční mikroskopie $7 D008856
- 650 _2
- $a molekulární modely $7 D008958
- 650 _2
- $a mutageneze cílená $7 D016297
- 650 _2
- $a mutace $7 D009154
- 650 _2
- $a vazba proteinů $7 D011485
- 650 _2
- $a sekundární struktura proteinů $7 D017433
- 650 _2
- $a rekombinantní fúzní proteiny $x genetika $x chemie $7 D011993
- 650 _2
- $a rekombinantní fúzní proteiny $x metabolismus $7 D011993
- 650 _2
- $a ribozomy $x metabolismus $7 D012270
- 650 _2
- $a financování organizované $7 D005381
- 700 1_
- $a Fučík, Vladimír. $7 _AN044670
- 700 1_
- $a Krásný, Libor $7 xx0142527
- 700 1_
- $a Barvík, Ivan $7 xx0086087
- 700 1_
- $a Jonák, Jiří, $d 1941- $7 jk01052065
- 773 0_
- $t Journal of Bacteriology $w MED00002537 $g Roč. 189, č. 13 Jul (2007), s. 4809-4814 $x 0021-9193
- 910 __
- $a ABA008 $b x $y 8
- 990 __
- $a 20100531071920 $b ABA008
- 991 __
- $a 20121112121157 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 726516 $s 589672
- BAS __
- $a 3
- BMC __
- $a 2007 $b 189 $c 13 Jul $d 4809-4814 $i 0021-9193 $m Journal of bacteriology $n J Bacteriol $x MED00002537
- LZP __
- $a 2010-B2/vtme
