Cíl práce: Cílem naší studie bylo stanovení výskytu qnr genů u ESBL-pozitivních izolátů Klebsiella pneumoniae získaných z klinického materiálu pacientů hospitalizovaných na jednotkách intenzivní péče několika klinik Fakultní nemocnice Olomouc. Materiál a metody: Do studie bylo zařazeno 100 ESBL-pozitivních izolátů Klebsiella pneumoniae získaných od pacientů hospitalizovaných v období od 1. 1. 2008 do 31. 1. 2011. Geny kódující jednotlivé typy beta-laktamáz blaTEM, blaSHV, blaCTX-M a geny qnr byly detekovány prostřednictvím PCR (polymerázové řetězové reakce). Identita, resp. podobnost izolátů byla analyzována porovnáním restrikčních profilů pomocí PFGE (pulzní gelové elektroforézy). Výsledky a závěr: Gen blaSHV byl detekován u 99 ze 100 izolátů Klebsiella pneumoniae, což odpovídá publikovaným údajům, které předpokládají umístění genu blaSHV-1 na chromozomu jmenovaného druhu. U 77 izolátů byl rovněž zachycen gen blaCTX-M. Přítomnost genu qnr byla odhalena u 56 izolátů, většina z tohoto počtu (76,8 %) nesla současně geny pro beta-laktamázy CTX-M a TEM. Ve všech případech se jednalo o variantu qnrB. Byly identifikovány plasmidy patřící do devíti různých inkompatibilních skupin, nejčastěji ze skupiny IncFII (52 izolátů). Byla prokázána vysoká míra rezistence nejen k beta-laktamovým antibiotikům, ale současně i k aminoglykosidům, tetracyklinu a kotrimoxazolu. PFGE odhalila 65 jedinečných kmenů a několik skupin izolátů se shodným restrikčním profilem. Přestože klinický význam qnr genů zatím není zcela jednoznačně definován, jejich výskyt u ESBL-pozitivních enterobakterií je významný.

Background: The study aimed at determining the presence of qnr genes in ESBL-positive strains of Klebsiella pneumoniae isolated from clinical material obtained from patients hospitalized in several intensive care units in the University Hospital Olomouc. Material and methods: The study comprised 100 ESBL-producing Klebsiella pneumoniae isolates from clinical samples obtained from patients hospitalized between 1 January 2008 and 31 January 2011. blaTEM, blaSHV, blaCTX-M and qnr genes were detected by polymerase chain reaction (PCR). To compare the similarity or identity of the isolates, pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) of DNA fragments was used. Results and Conclusion: The blaSHV gene was detected in 99 from 100 isolates of Klebsiella pneumoniae, which is in accordance with the published data that suppose the chromosomal position of the blaSHV-1 gene in this species. The blaCTX-M gene was detected in 77 isolates. The qnr genes were revealed in 56 isolates and majority (76.8 %) of these qnr-positive bacteria carried also the genes encoding the beta-lactamases CTX-M and TEM. In all cases, the qnrB variant was detected. Plasmids from nine different incompatibility groups were identified, in most cases from the IncFII group (52 isolates). Antibiotic susceptibility tests revealed high frequency of resistance not only to beta-lactams, but also to aminoglycosides, tetracycline and sulfamethoxazole/trimethoprim. PFGE detected 65 different strains and several groups of isolates with the same restriction profile. Although the clinical significance of the qnr genes is not well established, their presence in ESBL-positive Enterobacteriaceae is not negligible and it should be kept in mind.

Ústav mikrobiologie FNOL a LF UP Olomouc

Ústav molekulární a translační medicíny LF UP Olomouc

Presence of qnr genes in ESBL-positive isolates of klebsiella pneumoniae

Obsahuje 3 tabulky

Literatura