-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Chromatografická charakterizace aminokyselinových profilů vzorků moči pacientů s karcinomem prostaty
[Chromatographic characterization of amino acid profiles in urinary samples of patients suffering from prostate carcinoma]
Cernei N., Heger Z., Veselý Š., Zítka O., Adam V., Kizek R.
Jazyk čeština Země Česko
Typ dokumentu práce podpořená grantem
- MeSH
- časná diagnóza * MeSH
- chromatografie iontoměničová * metody přístrojové vybavení využití MeSH
- lidé MeSH
- nádorové biomarkery analýza MeSH
- nádory prostaty * diagnóza MeSH
- oxidační stres MeSH
- plošný screening ekonomika využití MeSH
- prostatický specifický antigen * analýza MeSH
- sarkosin * analýza moč MeSH
- spektrofotometrie ultrafialová metody přístrojové vybavení využití MeSH
- taurin * analýza moč MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Cíle studie: Cílem studie bylo vytvořit protokol pro zpracování vzorků moči pro získání aminokyselinových profilů pomocí iontově výměnné chromotografie s detekcí ve viditelném spektru (IEC/Vis) na základě tvorby komplexů aminokyselin s ninhydrinem a následné zkrácení času analýzy pro klinicky zajímavé molekuly (sarkosin či taurin), které mohou byt využity jako potenciální nádorové biomarkery. Typ studie: Metodická Materiál a metody: Vzorky moči, odebrané pacientům s diagnostikovaným karcinomem prostaty (n = 500) byly shromažďovány po dobu 1 roku a uskladňovány při teplotě -80°C. Pro vlastní analýzu aminokyselinových profilů byly vzorky připraveny kyselou hydrolýzou v mikrovlnném reaktoru. Za optimalizovaných podmínek (80 W, 120°C, 25 bar, 105 min) bylo 500 μl vzorku, smíchaného s 500 μl 35% kyseliny chlorovodíkové zhydrolyzováno na výsledný produkt, který byl následně ředěn pufrem sodíkového cyklu (0,2 mol/l NaCl, 60 mmol/l C6H807, 1,5 mmol/l N3Na a 0,4 % S(CH2CH2OH)2). Po centrifugaci (25 000 g při 4°C, 20 min) byly vzorky neutralizovány (0,6 mol/l NaOH) a analyzovány iontově-výměnnou kapalinovou chromatografií s postkolonovou derivatizací ninhydrinem využívající optickou detekci při vlnových délkách λ = 440 a 570 nm. Pro detekci sarkosinu a taurinu byly vzorky připraveny odpařením 250 μl vzorku na dusíkové odparce (40 min, teplota dusíku 60°C, tlak 1 bar) a následně resuspendovány pufrem sodíkového cyklu (250 μl). Výsledky a závěr: Analýzou aminokyselinových profilů (n = 500) bylo zjištěno, že lze docílit získání důležitých informací z neinvazivně odebraných vzorků moči. Použití dusíkové odparky redukuje manipulaci se vzorkem a zlepšuje opakovatelnost analýzy. Zkrácená analýza sarkosinu a taurinu ze vzorků odpařených na dusíkové odparce může sloužit jako metoda pro citlivou a nízkonákladovou analýzu klinických vzorků.
Objective: The aim of our study was to prepare a protocol for pre-treatment of clinical urinary samples, subsequently employed for acquirement of amino acid profiles via ion exchange chromatography with detection in visible spectrum (IEC/ Vis). Further for clinically interesting biomolecules as sarcosine and taurine the optimization was carried out to shorten the analysis time. Design: Methodological Material and methods: Urine specimens from patients diagnosed with prostate cancer (n = 500) were collected within 1 year and stored in -80°C. Samples were processed for analysis of amino acid profiles through acidic hydrolysis in a microwave reactor. Using optimized conditions (80 W, 120°C, 25 bar, 105 min), 500 μL sample, mixed with 500 μL of 35% hydrochloric acid hydrolyzed. That resulted in product, which was subsequently diluted in buffer of sodium cycle (0.2 mol/L NaCl, 60 C6H807 mmol/L, 1.5 mmol/L and 0.4% N3Na S(CH2CH2OH)2). After centrifugation (25000 g at 4°C, 20 min), the samples were neutralized (0.6 mol/l NaOH) and analyzed using ion-exchange liquid chromatography with post-column derivatization with ninhydrin, using the detection wavelength λ = 440 and 570 nm (IEC/Vis). For analysis of sarcosine and taurine, the samples were prepared by evaporation of 250 μL of sample employing a nitrogen evaporator (40 min, temperature 60°C. Nitrogen pressure of 1 bar) and resuspended with buffer of sodium cycle (250 μL). Results and conclusion: The analyses of amino acid profiles offer interesting clinical information not only in non-invasively collected urinary samples, but also in other organic matrices. Employment of nitrogen evaporator for sample pre-treatment leads to reduction of manipulation with sample and its combination with shortened analyses times of sarcosine and taurine may serve as a sensitive and low-cost method for analysis of clinical specimens.
Středoevropský technologický institut VUT v Brně Technická 3058 10 CZ 616 00 Brno Česká republika
Ústav chemie a biochemie Mendelova univerzita v Brně Zemědělská 1 CZ 613 00 Brno Česká republika
Chromatographic characterization of amino acid profiles in urinary samples of patients suffering from prostate carcinoma
Literatura
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc15004651
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20150316103406.0
- 007
- ta
- 008
- 150203s2014 xr ad f 000 0cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $d ABA008 $e AACR2 $b cze
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Cernei, Natalia $7 _AN063287 $u Ústav chemie a biochemie, Mendelova univerzita v Brně, Zemědělská 1, CZ-613 00 Brno, Česká republika; Středoevropský technologický institut, VUT v Brně, Technická 3058/10, CZ-616 00 Brno, Česká republika
- 245 10
- $a Chromatografická charakterizace aminokyselinových profilů vzorků moči pacientů s karcinomem prostaty / $c Cernei N., Heger Z., Veselý Š., Zítka O., Adam V., Kizek R.
- 246 31
- $a Chromatographic characterization of amino acid profiles in urinary samples of patients suffering from prostate carcinoma
- 504 __
- $a Literatura
- 520 3_
- $a Cíle studie: Cílem studie bylo vytvořit protokol pro zpracování vzorků moči pro získání aminokyselinových profilů pomocí iontově výměnné chromotografie s detekcí ve viditelném spektru (IEC/Vis) na základě tvorby komplexů aminokyselin s ninhydrinem a následné zkrácení času analýzy pro klinicky zajímavé molekuly (sarkosin či taurin), které mohou byt využity jako potenciální nádorové biomarkery. Typ studie: Metodická Materiál a metody: Vzorky moči, odebrané pacientům s diagnostikovaným karcinomem prostaty (n = 500) byly shromažďovány po dobu 1 roku a uskladňovány při teplotě -80°C. Pro vlastní analýzu aminokyselinových profilů byly vzorky připraveny kyselou hydrolýzou v mikrovlnném reaktoru. Za optimalizovaných podmínek (80 W, 120°C, 25 bar, 105 min) bylo 500 μl vzorku, smíchaného s 500 μl 35% kyseliny chlorovodíkové zhydrolyzováno na výsledný produkt, který byl následně ředěn pufrem sodíkového cyklu (0,2 mol/l NaCl, 60 mmol/l C6H807, 1,5 mmol/l N3Na a 0,4 % S(CH2CH2OH)2). Po centrifugaci (25 000 g při 4°C, 20 min) byly vzorky neutralizovány (0,6 mol/l NaOH) a analyzovány iontově-výměnnou kapalinovou chromatografií s postkolonovou derivatizací ninhydrinem využívající optickou detekci při vlnových délkách λ = 440 a 570 nm. Pro detekci sarkosinu a taurinu byly vzorky připraveny odpařením 250 μl vzorku na dusíkové odparce (40 min, teplota dusíku 60°C, tlak 1 bar) a následně resuspendovány pufrem sodíkového cyklu (250 μl). Výsledky a závěr: Analýzou aminokyselinových profilů (n = 500) bylo zjištěno, že lze docílit získání důležitých informací z neinvazivně odebraných vzorků moči. Použití dusíkové odparky redukuje manipulaci se vzorkem a zlepšuje opakovatelnost analýzy. Zkrácená analýza sarkosinu a taurinu ze vzorků odpařených na dusíkové odparce může sloužit jako metoda pro citlivou a nízkonákladovou analýzu klinických vzorků.
- 520 9_
- $a Objective: The aim of our study was to prepare a protocol for pre-treatment of clinical urinary samples, subsequently employed for acquirement of amino acid profiles via ion exchange chromatography with detection in visible spectrum (IEC/ Vis). Further for clinically interesting biomolecules as sarcosine and taurine the optimization was carried out to shorten the analysis time. Design: Methodological Material and methods: Urine specimens from patients diagnosed with prostate cancer (n = 500) were collected within 1 year and stored in -80°C. Samples were processed for analysis of amino acid profiles through acidic hydrolysis in a microwave reactor. Using optimized conditions (80 W, 120°C, 25 bar, 105 min), 500 μL sample, mixed with 500 μL of 35% hydrochloric acid hydrolyzed. That resulted in product, which was subsequently diluted in buffer of sodium cycle (0.2 mol/L NaCl, 60 C6H807 mmol/L, 1.5 mmol/L and 0.4% N3Na S(CH2CH2OH)2). After centrifugation (25000 g at 4°C, 20 min), the samples were neutralized (0.6 mol/l NaOH) and analyzed using ion-exchange liquid chromatography with post-column derivatization with ninhydrin, using the detection wavelength λ = 440 and 570 nm (IEC/Vis). For analysis of sarcosine and taurine, the samples were prepared by evaporation of 250 μL of sample employing a nitrogen evaporator (40 min, temperature 60°C. Nitrogen pressure of 1 bar) and resuspended with buffer of sodium cycle (250 μL). Results and conclusion: The analyses of amino acid profiles offer interesting clinical information not only in non-invasively collected urinary samples, but also in other organic matrices. Employment of nitrogen evaporator for sample pre-treatment leads to reduction of manipulation with sample and its combination with shortened analyses times of sarcosine and taurine may serve as a sensitive and low-cost method for analysis of clinical specimens.
- 650 12
- $a nádory prostaty $x diagnóza $7 D011471
- 650 12
- $a časná diagnóza $7 D042241
- 650 12
- $a prostatický specifický antigen $x analýza $7 D017430
- 650 12
- $a sarkosin $x analýza $x moč $7 D012521
- 650 12
- $a taurin $x analýza $x moč $7 D013654
- 650 12
- $a chromatografie iontoměničová $x metody $x přístrojové vybavení $x využití $7 D002852
- 650 _2
- $a spektrofotometrie ultrafialová $x metody $x přístrojové vybavení $x využití $7 D013056
- 650 _2
- $a nádorové biomarkery $x analýza $7 D014408
- 650 _2
- $a oxidační stres $7 D018384
- 650 _2
- $a plošný screening $x ekonomika $x využití $7 D008403
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 655 _2
- $a práce podpořená grantem $7 D013485
- 700 1_
- $a Heger, Zbyněk. $7 xx0276759 $u Ústav chemie a biochemie, Mendelova univerzita v Brně, Zemědělská 1, CZ-613 00 Brno, Česká republika; Středoevropský technologický institut, VUT v Brně, Technická 3058/10, CZ-616 00 Brno, Česká republika
- 700 1_
- $a Veselý, Štěpán $7 xx0208977 $u Urologická klinika, 2. Lékařská fakulta Univerzity Karlovy a FN V Motole, V Úvalu 84, CZ-150 06 Praha 5, Česká republika
- 700 1_
- $a Zítka, Ondřej $7 xx0116134 $u Ústav chemie a biochemie, Mendelova univerzita v Brně, Zemědělská 1, CZ-613 00 Brno, Česká republika; Středoevropský technologický institut, VUT v Brně, Technická 3058/10, CZ-616 00 Brno, Česká republika
- 700 1_
- $a Adam, Vojtěch, $d 1982- $7 xx0064599 $u Ústav chemie a biochemie, Mendelova univerzita v Brně, Zemědělská 1, CZ-613 00 Brno, Česká republika; Středoevropský technologický institut, VUT v Brně, Technická 3058/10, CZ-616 00 Brno, Česká republika
- 700 1_
- $a Kizek, René, $d 1972- $7 jn20001005291 $u Ústav chemie a biochemie, Mendelova univerzita v Brně, Zemědělská 1, CZ-613 00 Brno, Česká republika; Středoevropský technologický institut, VUT v Brně, Technická 3058/10, CZ-616 00 Brno, Česká republika
- 773 0_
- $t Klinická biochemie a metabolismus $x 1210-7921 $g Roč. 22, č. 4 (2014), s. 196-202 $w MED00011026
- 856 41
- $u http://www.cskb.cz/res/file/KBM-pdf/2014/2014-4/KBM-4-2014-Kizek-196.pdf $y plný text volně přístupný
- 910 __
- $a ABA008 $b B 1822 $c 374 a $y 4 $z 0
- 990 __
- $a 20150203081205 $b ABA008
- 991 __
- $a 20150316103648 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1061756 $s 887417
- BAS __
- $a 3
- BMC __
- $a 2014 $b 22 $c 4 $d 196-202 $i 1210-7921 $m Klinická biochemie a metabolismus $n Klin. biochem. metab. $x MED00011026
- LZP __
- $c NLK137 $d 20150316 $a NLK 2015-06/vt