-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Pilotná analýza mutácií génov asociovaných s Lynchovym syndrómom u slovenských pacientov s rakovinou prsníka
[Pilot study of gene mutations associated with Lynch syndrome in Slovak patients with breast cancer]
L. Krasničanová, R. Saade, P. Priščáková, H. Gbelcová, K. Kaľavská, M. Karaba, J. Benca, M. Mego, V. Repiská
Jazyk slovenština Země Česko
Typ dokumentu práce podpořená grantem
- MeSH
- dědičné nepolypózní kolorektální nádory diagnóza genetika patologie MeSH
- genetická predispozice k nemoci MeSH
- lidé MeSH
- mismatch repair endonukleáza PMS2 genetika MeSH
- mutace MeSH
- nádory prsu * genetika MeSH
- pilotní projekty MeSH
- zárodečné mutace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Východiská: Lynchov syndróm (LS) je autozomálne dominantné dedičné ochorenie, ktoré sa prejavuje zvýšením rizika vzniku nádorových ochorení, a to predovšetkým kolorektálneho a endometriálneho karcinómu. Nedávne štúdie preukázali aj asociáciu medzi LS a nádorovým ochorením prsníka. Cieľom tejto štúdie je poukázať na možný výskyt prítomnosti mutácií v génoch asociovaných s LS u pacientov s rakovinou prsníka a na potrebu zahrnúť vyšetrenie Lynch asociovaných génov u pacientov s familiárnym a opakovaným výskytom rakoviny prsníka ako aj s výskytom ďalších Lynch asociovaných nádorových ochorení. Materiál a metódy: Analyzovali sme vzorky nádorového tkaniva od 78 pacientov s primárnym nádorom prsníka. U pacientov sme analyzovali panel génov asociovaný s rizikom vzniku rakoviny prsníka, pričom sme sa v rámci našej štúdie sústredili primárne na výskyt mutácií v mismatch-repair génoch. DNA izolovaná z nádorového tkaniva bola sekvenovaná pomocou metódy sekvenovania novej generácie (next generation sequencing – NGS) a podrobená analýze pomocou nástroja Ingenuity Variant Analysis. Na potvrdenie zárodočnej mutácie sme vyšetrili krvnú vzorku pacientky pomocou NGS. Výsledky: V rámci našej analýzy sa nám v nádorovom tkanive prsníka podarilo identifikovať variant v géne PMS2 u jednej pacientky. Prítomnosť mutácie naznačuje, že vzniknuté nádorové ochorenie môže byť následkom LS. Z hľadiska patogenity sa jednalo o pravdepodobne patogénny variant, nakoľko sme odhalili deléciu v exónovej oblasti, ktorá viedla k frameshift mutácii. Navyše sme identifikovali aj jednonukleotidové patogénne varianty v génoch TP53 a PIK3CA. Pre definitívne stanovenie diagnózy LS u pacientky sme vyšetrili krvnú vzorku, kde sme tiež identifikovali mutáciu génu PMS2. Záver: LS je u mnohých Lynch asociovaných nádorových ochorení poddiagnostikovaný. V prípade familiárneho výskytu rakoviny prsníka a ďalších Lynch asociovaných génov je však dôležité myslieť aj na možnú diagnózu LS a v prípade, že pacient spĺňa diagnostické kritéria, uskutočniť aj genetické vyšetrenie Lynch asociovaných génov.
Background: Lynch syndrome (LS) is an autosomal dominant inherited disorder which causes an increased risk of cancer, especially colorectal and endometrial carcinomas. Recent studies have shown an association between LS and breast cancer as well. The aim of our study is to highlight the possible presence of mutations in genes associated with LS in patients with breast cancer and the need to include the examination of Lynch-associated genes in patients with a family history of breast cancer as well as in patients with recurrent breast cancer, as well as with the occurrence of other Lynch-associated cancer. Materials and methods: We analyzed tumor tissue samples from 78 patients with primary breast cancer. Our samples were tested with a gene panel associated with the risk of developing breast cancer, while in our study we focused primarily on the occurrence of mutations in mismatch-repair genes. DNA isolated from tumor tissue was sequenced using next generation sequencing (NGS) and analyzed using the Ingenuity Variant Analysis tool. To confirm the germline mutation, we examined the patient‘s blood sample using NGS sequencing. Results: As a result of our analysis, we managed to identify a mutation in the PMS2 gene in one patient‘s breast tumor tissue. The presence of this mutation indicates that the resulting cancer may be a consequence of LS. As for pathogenicity, this was probably a pathogenic variant, as we detected deletions in the exon region, which led to frameshift mutation. Moreover, we also identified single-nucleotide pathogenic variants in the TP53 and PIK3CA genes. To definitively establish the diagnosis of LS in the patient, we examined a blood sample, where we also identified a mutation of the PMS2 gene. Conclusion: LS is underdiagnosed in many Lynch-associated cancers. However, in the case of a familial occurrence of breast cancer and other Lynch-associated genes, it is important to think about a possible diagnosis of LS and, if the patient meets the diagnostic criteria, to carry out a genetic examination of Lynch-associated genes.
2 onkologická klinika Lekárska fakulta Univerzity Komenského Národný onkologický ústav Bratislava
Klinika chirurgickej onkológie Národný onkologický ústav Bratislava
Vysoká škola zdravotníctva a sociálnej práce sv Alžbety n o Bratislava
Pilot study of gene mutations associated with Lynch syndrome in Slovak patients with breast cancer
Citace poskytuje Crossref.org
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc23005376
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20230523162519.0
- 007
- ta
- 008
- 230425s2023 xr d f 000 0|slo||
- 009
- AR
- 024 7_
- $a 10.48095/ccko2023130 $2 doi
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a slo $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Krasničanová, Lucia, $u Ústav lekárskej biológie, genetiky a klinickej genetiky Lekárskej fakulty Univerzity Komenského a Univerzitnej nemocnice Bratislava $d 1992- $7 xx0301197
- 245 10
- $a Pilotná analýza mutácií génov asociovaných s Lynchovym syndrómom u slovenských pacientov s rakovinou prsníka / $c L. Krasničanová, R. Saade, P. Priščáková, H. Gbelcová, K. Kaľavská, M. Karaba, J. Benca, M. Mego, V. Repiská
- 246 31
- $a Pilot study of gene mutations associated with Lynch syndrome in Slovak patients with breast cancer
- 520 3_
- $a Východiská: Lynchov syndróm (LS) je autozomálne dominantné dedičné ochorenie, ktoré sa prejavuje zvýšením rizika vzniku nádorových ochorení, a to predovšetkým kolorektálneho a endometriálneho karcinómu. Nedávne štúdie preukázali aj asociáciu medzi LS a nádorovým ochorením prsníka. Cieľom tejto štúdie je poukázať na možný výskyt prítomnosti mutácií v génoch asociovaných s LS u pacientov s rakovinou prsníka a na potrebu zahrnúť vyšetrenie Lynch asociovaných génov u pacientov s familiárnym a opakovaným výskytom rakoviny prsníka ako aj s výskytom ďalších Lynch asociovaných nádorových ochorení. Materiál a metódy: Analyzovali sme vzorky nádorového tkaniva od 78 pacientov s primárnym nádorom prsníka. U pacientov sme analyzovali panel génov asociovaný s rizikom vzniku rakoviny prsníka, pričom sme sa v rámci našej štúdie sústredili primárne na výskyt mutácií v mismatch-repair génoch. DNA izolovaná z nádorového tkaniva bola sekvenovaná pomocou metódy sekvenovania novej generácie (next generation sequencing – NGS) a podrobená analýze pomocou nástroja Ingenuity Variant Analysis. Na potvrdenie zárodočnej mutácie sme vyšetrili krvnú vzorku pacientky pomocou NGS. Výsledky: V rámci našej analýzy sa nám v nádorovom tkanive prsníka podarilo identifikovať variant v géne PMS2 u jednej pacientky. Prítomnosť mutácie naznačuje, že vzniknuté nádorové ochorenie môže byť následkom LS. Z hľadiska patogenity sa jednalo o pravdepodobne patogénny variant, nakoľko sme odhalili deléciu v exónovej oblasti, ktorá viedla k frameshift mutácii. Navyše sme identifikovali aj jednonukleotidové patogénne varianty v génoch TP53 a PIK3CA. Pre definitívne stanovenie diagnózy LS u pacientky sme vyšetrili krvnú vzorku, kde sme tiež identifikovali mutáciu génu PMS2. Záver: LS je u mnohých Lynch asociovaných nádorových ochorení poddiagnostikovaný. V prípade familiárneho výskytu rakoviny prsníka a ďalších Lynch asociovaných génov je však dôležité myslieť aj na možnú diagnózu LS a v prípade, že pacient spĺňa diagnostické kritéria, uskutočniť aj genetické vyšetrenie Lynch asociovaných génov.
- 520 9_
- $a Background: Lynch syndrome (LS) is an autosomal dominant inherited disorder which causes an increased risk of cancer, especially colorectal and endometrial carcinomas. Recent studies have shown an association between LS and breast cancer as well. The aim of our study is to highlight the possible presence of mutations in genes associated with LS in patients with breast cancer and the need to include the examination of Lynch-associated genes in patients with a family history of breast cancer as well as in patients with recurrent breast cancer, as well as with the occurrence of other Lynch-associated cancer. Materials and methods: We analyzed tumor tissue samples from 78 patients with primary breast cancer. Our samples were tested with a gene panel associated with the risk of developing breast cancer, while in our study we focused primarily on the occurrence of mutations in mismatch-repair genes. DNA isolated from tumor tissue was sequenced using next generation sequencing (NGS) and analyzed using the Ingenuity Variant Analysis tool. To confirm the germline mutation, we examined the patient‘s blood sample using NGS sequencing. Results: As a result of our analysis, we managed to identify a mutation in the PMS2 gene in one patient‘s breast tumor tissue. The presence of this mutation indicates that the resulting cancer may be a consequence of LS. As for pathogenicity, this was probably a pathogenic variant, as we detected deletions in the exon region, which led to frameshift mutation. Moreover, we also identified single-nucleotide pathogenic variants in the TP53 and PIK3CA genes. To definitively establish the diagnosis of LS in the patient, we examined a blood sample, where we also identified a mutation of the PMS2 gene. Conclusion: LS is underdiagnosed in many Lynch-associated cancers. However, in the case of a familial occurrence of breast cancer and other Lynch-associated genes, it is important to think about a possible diagnosis of LS and, if the patient meets the diagnostic criteria, to carry out a genetic examination of Lynch-associated genes.
- 650 07
- $a pilotní projekty $7 D010865 $2 czmesh
- 650 07
- $a genetická predispozice k nemoci $7 D020022 $2 czmesh
- 650 17
- $a nádory prsu $x genetika $7 D001943 $2 czmesh
- 650 07
- $a dědičné nepolypózní kolorektální nádory $x diagnóza $x genetika $x patologie $7 D003123 $2 czmesh
- 650 07
- $a mutace $7 D009154 $2 czmesh
- 650 07
- $a zárodečné mutace $7 D018095 $2 czmesh
- 650 _7
- $a mismatch repair endonukleáza PMS2 $x genetika $7 D000070976 $2 czmesh
- 650 _7
- $a lidé $7 D006801 $2 czmesh
- 650 _7
- $a ženské pohlaví $7 D005260 $2 czmesh
- 655 _7
- $a práce podpořená grantem $7 D013485 $2 czmesh
- 700 1_
- $a Saade, Rami, $u Ústav lekárskej biológie, genetiky a klinickej genetiky Lekárskej fakulty Univerzity Komenského a Univerzitnej nemocnice Bratislava $d 1992- $7 xx0301213
- 700 1_
- $a Priščáková, Petra $u Ústav lekárskej biológie, genetiky a klinickej genetiky Lekárskej fakulty Univerzity Komenského a Univerzitnej nemocnice Bratislava $7 xx0257282
- 700 1_
- $a Gbelcová, Helena, $u Ústav lekárskej biológie, genetiky a klinickej genetiky Lekárskej fakulty Univerzity Komenského a Univerzitnej nemocnice Bratislava $d 1982- $7 xx0257254
- 700 1_
- $a Hainová, Katarína, $u Jednotka translačného výskumu, Lekárska fakulta Univerzity Komenského a Národný onkologický ústav, Bratislava $d 1987- $7 xx0301192
- 700 1_
- $a Karaba, Marián $u Klinika chirurgickej onkológie, Národný onkologický ústav, Bratislava $7 xx0301194
- 700 1_
- $a Benca, Juraj, $u Klinika chirurgickej onkológie, Národný onkologický ústav, Bratislava $u Vysoká škola zdravotníctva a sociálnej práce sv. Alžbety, n. o., Bratislava $d 1965- $7 xx0301189
- 700 1_
- $a Mego, Michal, $u Jednotka translačného výskumu, Lekárska fakulta Univerzity Komenského a Národný onkologický ústav, Bratislava $u II. onkologická klinika, Lekárska fakulta Univerzity Komenského, Národný onkologický ústav, Bratislava $d 1977- $7 xx0229636
- 700 1_
- $a Repiská, Vanda $u Ústav lekárskej biológie, genetiky a klinickej genetiky Lekárskej fakulty Univerzity Komenského a Univerzitnej nemocnice Bratislava $7 xx0257331
- 773 0_
- $w MED00011030 $t Klinická onkologie $x 0862-495X $g Roč. 36, č. 2 (2023), s. 130-134
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/klinicka-onkologie/2023-2-3/pilotna-analyza-mutacii-genov-asociovanych-s-lynchovym-syndromom-u-slovenskych-pacientov-s-rakovinou-prsnika-133974 $y plný text volně dostupný
- 910 __
- $a ABA008 $b B 1665 $c 656 $y p $z 0
- 990 __
- $a 20230425 $b ABA008
- 991 __
- $a 20230523162515 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1930294 $s 1191590
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2023 $b 36 $c 2 $d 130-134 $i 0862-495X $m Klinická onkologie $x MED00011030 $y 133974
- LZP __
- $c NLK109 $d 20230523 $b NLK111 $a Meditorial-20230425