The antibiotic resistance genes (ARGs) limit the susceptibility of bacteria to antimicrobials, representing a problem of high importance. Current research on the presence of ARGs in microorganisms focuses mainly on humans, livestock, hospitals, or wastewater. However, the spectrum of ARGs in the dust resistome in workplaces and households has gone relatively unexplored. This pilot study aimed to analyze resistome in indoor dust samples from participants' workplaces (a pediatric hospital, a maternity hospital, and a research center) and households and compare two different approaches to the ARGs analysis; high-throughput quantitative PCR (HT-qPCR) and whole metagenome shotgun sequencing (WMGS). In total, 143 ARGs were detected using HT-qPCR, with ARGs associated with the macrolides, lincosamides, and streptogramin B (MLSB) phenotype being the most abundant, followed by MDR (multi-drug resistance) genes, and genes conferring resistance to aminoglycosides. A higher overall relative quantity of ARGs was observed in indoor dust samples from workplaces than from households, with the pediatric hospital being associated with the highest relative quantity of ARGs. WMGS analysis revealed 36 ARGs, of which five were detected by both HT-qPCR and WMGS techniques. Accordingly, the efficacy of the WMGS approach to detect ARGs was lower than that of HT-qPCR. In summary, our pilot data revealed that indoor dust in buildings where people spend most of their time (workplaces, households) can be a significant source of antimicrobial-resistant microorganisms, which may potentially pose a health risk to both humans and animals.

• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   MeSH
• Bacteria genetika   izolace a purifikace   účinky léků   klasifikace   MeSH
• bakteriální geny genetika   MeSH
• bakteriální léková rezistence genetika   MeSH
• charakteristiky rodiny MeSH
• kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
• lidé MeSH
• metagenom MeSH
• mikrobiologie vzduchu MeSH
• pilotní projekty MeSH
• prach * analýza   MeSH
• pracoviště * MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
• znečištění vzduchu ve vnitřním prostředí MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

Východiska: Zhoubné nádory jater jsou agresivní a mají špatnou prognózu přežití. Metalothionein (MT) je nízkomolekulární intracelulární protein, jehož primární funkcí je udržení homeostázy těžkých kovů v živých organizmech. Molekulární mechanizmus exprese MT je velmi málo prostudován. Nedávné výzkumy ukazují na jeho významný vztah ke karcinogenezi, spontánní mutagenezi a účinnosti protinádorových léčiv. Již v předchozích studiích bylo dokázáno, že hladiny MT stoupají u nádorového onemocnění. Cílem naší práce bylo studium MT za účelem zvýšení efektivity diagnostiky zhoubných nádorů jater. Metody: V pilotní studii (2022–2023) byla sledována skupina 15 pacientů s hepatocelulárním karcinomem (hepatocellular carcinoma – HCC, diagnóza C220) a skupina 15 pacientů s hepatoblastomem (diagnóza C222). Kontrolní skupina byla vybrána ze zdravých probandů (n = 20). Pro analýzu byla použita námi vyvinutá modifikovaná metoda. Vzorky krevních sér probandů byly tepelně denaturovány (99 ̊C, 20 min). MT byl stanoven pomocí elektrochemie. Získaná data byla uložena a zpracována v laboratorním informačním systému QINSLAB. Výsledky: U vzorků denaturovaných krevních sér byly získány voltametrické křivky MT. Stanovením plochy pod křivkou (area under the curve – AUC) byly vypočteny koncentrace MT. Pro porovnání normální a abnormální hladiny MT byla použita kontrolní séra zdravých probandů (n = 20) se zjištěným průměrným množstvím MT 2,0 ± 1,3 μg/l a mediánem 1,9 μg/l. U skupiny pacientů s HCC bylo zjištěno průměrné množství MT 9,1 ± 6,5 μg/l a medián 9,0 μg/l. Tzv. receiver operating characteristic (ROC) analýza ukázala AUC 0,864 (95% CI 0,736–0,992), senzitivitu 0,74 a specificitu 0,75. U pacientů s hepatoblastomem bylo zjištěno průměrné množství MT 11,5 ± 7,5 μg/l a medián 10,9 μg/l. ROC analýza ukázala AUC 0,868 (95% CI 0,751–0,993), senzitivitu 0,84 a specificitu 0,86. V korelační analýze byla pozorována korelace MT ke karcinoembryonálnímu antigenu (CEA) (r = 0,99), kyselině močové (r = −0,86) a iontům draslíku (r = −0,94). Závěr: V této pilotní studii se podařilo sledovat pravděpodobnou asociaci hladiny MT u probandů se zhoubnými nádory jater. Z publikovaných prací je známo, že hladiny MT jsou dlouhodobě zvýšené a předpokládáme, že souvisí se zvýšenou metabolickou aktivitou nádorových buněk. Studie bude dále pokračovat na větším souboru pacientů.

Background: Malignant liver tumors are highly aggressive with a poor prognosis. Metalothionein (MT) is a low-molecular intracellular protein, whose primary function is to regulate the homeostasis of heavy metals in many organisms. There are only few studies focusing on the molecular mechanisms of MT expression. Recent studies show its significant relations to carcinogenesis, spontaneous mutagenesis and efficiency of antitumor medicine. In previous studies, the increase of MT levels in cancer patients was proven. The aim of this work is to study MT as well as to increase the efficiency of malignant liver tumor diagnosis. Methods: In our pilot study (2022–2023) we observed a group of 15 patients with hepatocellular carcinoma (diagnosis C220) and a group of 15 patients with hepatoblastoma (diagnosis C222). The control group included 20 healthy probands. We developed our own modified method for the analysis. Blood serum samples of the probands were denaturated (99 ̊C, 20 min). MT was determined by an electrochemical method. Obtained data were stored and processed in the laboratory information system QINSLAB. Results: In denaturated blood serum samples, we obtained voltametric curves of MT. We determined concentrations of MT by evaluating the area under the curve (AUC). To differentiate normal and abnormal concentrations of MT, blood samples of healthy probands were used (N = 20), with the average MT levels of 2.0 ± 1.3 μg/L and median 1.9 μg/L. In patients diagnosed with HCC, the average MT levels were 9.1 ± 6.5 μg/L and median 9.0 μg/L. The receiver operating characteristic (ROC) analysis showed AUC 0.864 (95% CI 0.736–0.992), sensitivity 0.74 and specificity 0.75. In patients diagnosed with hepatoblastoma, the average MT concentrations measured were 11.5 ± 7.5 μg/L and the median was 10.9 μg/L. The ROC analysis displayed AUC 0.868 (95% CI 0.751–0.993), sensitivity 0.84 and specificity 0.86. The correlation analysis showed correlation between MT and carcinoembryonic antigen (CEA) (r = 0.99), uric acid (r = −0.86) and potassium ions (r = −0.94). Conclusion: In this pilot study, we observed the association of MT levels in healthy probands and malignant liver tumor patients. Many previous studies show that MT concentrations are increasing as the illness progresses. We assume that this increase is connected to the high metabolic activity of cancer cells. This study will continue with collecting a larger number of samples.

• MeSH
• elektrochemické techniky klasifikace   metody   MeSH
• hepatoblastom krev   patologie   MeSH
• hepatocelulární karcinom krev   patologie   MeSH
• lidé MeSH
• metalothionein * analýza   krev   MeSH
• nádorové biomarkery analýza   krev   MeSH
• nádory jater * diagnóza   farmakoterapie   krev   MeSH
• pilotní projekty MeSH
• prognóza MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

Východiska: Přestože je bevacizumab prvním biologickým léčivem schváleným pro léčbu metastatického kolorektálního karcinomu (mCRC), neexistuje žádný zavedený DNA biomarker, který by zlepšil jeho účinnost a personalizoval léčbu. Materiál a metody: Sledováno bylo 30 pacientů s mCRC na terapii bevacizumabem (15 s dobrou odpovědí a 15 se špatnou odpovědí) z Fakultní nemocnice Olomouc. Pro analýzu variací v počtu kopií genů (copy number variation – CNV) byly použity vzorky FFPE a OncoScan FFPE Assay Kit, který zachycuje přibližně 900 nádorových genů. Výsledky: Ve skupině dobře reagujících pacientů bylo jako potenciálně významné pozitivní prediktivní nádorové biomarkery léčby bevacizumabem identifikováno 102 genů (klasifikovaných jako ATPázy, typ AAA, neuronální přenos signálu, regulace transkripce a domény typu PH superior). Ve špatně reagující skupině bylo identifikováno 74 potenciálně negativních prediktivních genů (klasifikovaných jako galektiny, signální dráha Jak-STAT, kaskáda MAPK, diferenciace a doména asociovaná s F-boxem). Závěr: V pilotní studii jsme našli slibné biomarkery variace počtu kopií odpovědi na bevacizumab v FFPE vzorcích nádorů pacientů s mCRC. Validační fáze by měla být zaměřena zejména na geny spojené s angiogenezí (AGRN, MAPK8, ARHGAP22, LGALS13, LGALS4, ZFP36 a MYC), tumorigenezí (DVL1) a proliferací tumoru (IFNL1, IFNL2, IFNL3, MAP3K10 a MAP4K1).

Background: Despite bevacizumab being the first biological agent approved for the treatment of metastatic colorectal cancer (mCRC), there is not any established DNA biomarker to improve its efficacy and personalize the treatment. Materials and methods: Thirty patients with mCRC on bevacizumab therapy (15 with a good response and 15 with a poor response) from the University Hospital Olomouc were followed. Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples were used for copy number variation (CNV) analysis using the OncoScan FFPE Assay Kit in order to capture approx. 900 tumor genes. Results: In the group of good responding patients, 102 genes (classified as ATPases, type AAA, neuronal signal transmission, regulation of transcription, and superior domain PH type), potentially significant positive predictive tumor biomarkers of bevacizumab treatment, were found. In the poorly responding group, 74 potentially negative predictive genes (classified as galectines, Jak-STAT signalling pathway, MAPK cascade, differentiation, and F-box associated domain) were identified. Conclusion: In the pilot study, we found promising copy number variation biomarkers of bevacizumab response in FFPE samples of mCRC patients. The validation phase should be focused especially on the genes associated with angiogenesis (AGRN, MAPK8, ARHGAP22, LGALS13, LGALS4, ZFP36, and MYC), tumorigenesis (DVL1), and tumor proliferation (IFNL1, IFNL2, IFNL3, MAP3K10, and MAP4K1).

• MeSH
• bevacizumab aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• kolorektální nádory * diagnóza   farmakoterapie   genetika   patologie   MeSH
• lidé MeSH
• metastázy nádorů farmakoterapie   MeSH
• mutační analýza DNA metody   MeSH
• nádorové biomarkery analýza   genetika   MeSH
• pilotní projekty MeSH
• protinádorové látky imunologicky aktivní aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• variabilita počtu kopií segmentů DNA MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• MeSH
• dilatace přístrojové vybavení   MeSH
• lidé MeSH
• pánevní dno * zranění   MeSH
• parita MeSH
• pilotní projekty MeSH
• randomizované kontrolované studie jako téma MeSH
• těhotenství MeSH
• vedení porodu * škodlivé účinky   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• těhotenství MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• dopisy MeSH
• komentáře MeSH

This study aimed to create a Czech questionnaire for pediatric obstructive sleep apnea (POSA) risk screening, a first of its kind in the Czech Republic, where options for child polysomnography are limited. Compiling items from established English questionnaires and supplementing them with additional items, we designed the first version of the Czech questionnaire and tested it in a pilot study with parents of 30 children. After pilot feedback, a revised version with dichotomous and 5-item Likert scale questions was tested on 71 children's parents. All children (7-12 years old) underwent a home sleep apnea test to record their apnea-hypopnea index (AHI). The second (40-item) version showed high reliability (93%), with 17 items identified as the most significant. Findings from the final 17-item SEN CZ questionnaire correlated positively with AHI (p < 0.001), demonstrating 84% sensitivity, 86% specificity, and 93% reliability. Three factors, namely breathing problems, inattention, and hyperactivity (characterized by multiple items), were identified to form a higher-order factor of POSA risk, which was further supported by the correlations of their total scores with AHI (p < 0.001). The resulting SEN CZ questionnaire can serve as a tool for POSA risk screening in the Czech Republic without the need to involve medical professionals.

• MeSH
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• obstrukční spánková apnoe * diagnóza   epidemiologie   MeSH
• pilotní projekty MeSH
• plošný screening metody   MeSH
• polysomnografie metody   MeSH
• průzkumy a dotazníky MeSH
• reprodukovatelnost výsledků MeSH
• rizikové faktory MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Haemophilus ducreyi (HD) is an important cause of cutaneous ulcers in several endemic regions, including the Western Pacific Region, especially among children. An HD sequence typing on swab samples taken from 1,081 ulcers in the Namatanai district of Papua New Guinea, during the pilot study for treatment of yaws, has been performed using the Grant typing system. Of the 363 samples that tested positive for the 16S rDNA of HD, the dsrA sequences of 270 samples were determined. Altogether they revealed 8 HD strain types circulating in Namatanai, including seven strain types of Class I (I.3, I.4, I.5, I.9, I.10, I.11, I.12) and one strain of Class II (II.3); four Class I types (I.9, I.10, I.11, I.12) were novel. The southern region of Namatanai (Matalai Rural) was identified as the region with the lowest genotype diversity and with most infections caused by HD Class II. The middle and northern subdistricts were affected mainly by HD Class I. Analysis of patient characteristics revealed that Class II HD infections were more often represented by longer-lasting ulcers than Class I HD infections. An increase in the prevalence of the I.10 strain was found after azithromycin administration compared to the untreated population at baseline likely reflecting higher infectivity of HD Class I, and more specifically strain type I.10.

• MeSH
• antibakteriální látky * terapeutické užití   farmakologie   MeSH
• azithromycin * terapeutické užití   MeSH
• dítě MeSH
• DNA bakterií genetika   MeSH
• dospělí MeSH
• frambézie mikrobiologie   epidemiologie   farmakoterapie   MeSH
• fylogeneze MeSH
• genotyp * MeSH
• Haemophilus ducreyi * genetika   izolace a purifikace   účinky léků   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• měkký vřed * mikrobiologie   epidemiologie   farmakoterapie   MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• pilotní projekty MeSH
• předškolní dítě MeSH
• RNA ribozomální 16S genetika   MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• předškolní dítě MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Papua Nová Guinea MeSH

AIM: This study aimed to analyse cross-cultural differences in the prevalence of low back pain (LBP) and other back pain of general nurses in direct inpatient care in the Czech Republic (CZ) and Great Britain (GB). METHODS: The survey was used using an extended standardized Nordic Musculoskeletal Questionnaire and self-created additional questions. The data were analysed with Stata 15 using a significance level of 0.05. RESULTS: The data analysis was based on 1043 questionnaires. We identified statistically significant differences in the LBP prevalence between the respondents (CZ 93% and GB 85%) over a period of 12 months. Nurses in both countries stated a higher prevalence of LBP compared to pain in the neck, shoulders or upper back. LBP increases in relation to age, length of work experience, body mass index (BMI) and university education (BSc). Age, length of work experience, BMI and education (nursing college and master's degree) were confirmed as significant risks contributing to the increased prevalence of other back pain as well. Respondents reported a reduction in work performance, leisure activities and the need to change profession in relation to LBP. CONCLUSION: The results of the study confirm that LBP is a frequent occupational health issue in the general nurses working in direct inpatient care in both countries.

• MeSH
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• lumbalgie * epidemiologie   MeSH
• nemoci z povolání epidemiologie   MeSH
• pilotní projekty MeSH
• prevalence MeSH
• průzkumy a dotazníky MeSH
• srovnání kultur * MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• srovnávací studie MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH
• Spojené království MeSH

Purpose: This study aims to assess whole-mount Gleason grading (GG) in prostate cancer (PCa) accurately using a multiomics machine learning (ML) model and to compare its performance with biopsy-proven GG (bxGG) assessment. Materials and Methods: A total of 146 patients with PCa recruited in a pilot study of a prospective clinical trial (NCT02659527) were retrospectively included in the side study, all of whom underwent 68Ga-PSMA-11 integrated positron emission tomography (PET) / magnetic resonance (MR) before radical prostatectomy (RP) between May 2014 and April 2020. To establish a multiomics ML model, we quantified PET radiomics features, pathway-level genomics features from whole exome sequencing, and pathomics features derived from immunohistochemical staining of 11 biomarkers. Based on the multiomics dataset, five ML models were established and validated using 100-fold Monte Carlo cross-validation. Results: Among five ML models, the random forest (RF) model performed best in terms of the area under the curve (AUC). Compared to bxGG assessment alone, the RF model was superior in terms of AUC (0.87 vs 0.75), specificity (0.72 vs 0.61), positive predictive value (0.79 vs 0.75), and accuracy (0.78 vs 0.77) and showed slightly decreased sensitivity (0.83 vs 0.89) and negative predictive value (0.80 vs 0.81). Among the feature categories, bxGG was identified as the most important feature, followed by pathomics, clinical, radiomics and genomics features. The three important individual features were bxGG, PSA staining and one intensity-related radiomics feature. Conclusion: The findings demonstrate a superior assessment of the developed multiomics-based ML model in whole-mount GG compared to the current clinical baseline of bxGG. This enables personalized patient management by identifying high-risk PCa patients for RP.

• MeSH
• genomika metody   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• magnetická rezonanční tomografie metody   MeSH
• multiomika MeSH
• nádory prostaty * chirurgie   patologie   genetika   diagnostické zobrazování   MeSH
• pilotní projekty MeSH
• pozitronová emisní tomografie metody   MeSH
• prospektivní studie MeSH
• prostatektomie * metody   MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• senioři MeSH
• strojové učení * MeSH
• stupeň nádoru * MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

BACKGROUND: Specific toxic compounds, such as polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) and their metabolites, may affect the inhalation injury (INHI) grade, patients' status, and prognosis for recovery. This pilot prospective study aimed to: i) evaluate the suitability of bronchoalveolar lavage (BAL) for determination of PAHs in the LRT and of urine for determination of hydroxylated metabolites (OH-PAHs) in patients with INHI, ii) describe the dynamic changes in the levels of these toxic compounds, and iii) correlate these findings with clinical variables of the patients with INHI. METHODS: The BAL and urine samples from 10 patients with INHI were obtained on Days 1, 3, 5, 7, and 14 of hospitalization, if possible, and PAHs (BAL) and OH-PAHs (urine) were analyzed using chromatographic methods (GC-MS and HPLC). RESULTS: Concentrations of analyzed PAHs were in most cases and time points below the limit of quantification in BAL samples. Nine OH-PAHs were detected in the urine samples; however, their concentrations sharply decreased within the first three days of the hospitalization. On Day 14, the total amount of OH-PAHs in urine was higher in surviving patients with High-grade INHI (≥3) than in those with Low-grade INHI (<3, p = 0.032). Finally, a significant correlation between certain OH-PAHs and clinical variables (AST/ALT, TBSA, ABSI) from Day 1 of the hospitalization was observed (p<0.05). CONCLUSIONS: BAL samples are not suitable for the analysis of PAHs. However, the OH-PAHs levels in urine can be measured reliably and were correlated with several clinical variables. Moreover, High-grade INHI was associated with higher total concentrations of OH-PAHs in urine.

• MeSH
• bronchoalveolární lavážní tekutina * chemie   MeSH
• dospělí MeSH
• hospitalizace * MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• pilotní projekty MeSH
• polycyklické aromatické uhlovodíky * moč   analýza   MeSH
• prospektivní studie MeSH
• senioři MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

Neoadjuvant chemotherapy (NAC) is the preferred treatment option in locally advanced breast cancer (BC). The administration of NAC is associated with a wide range of adverse effects. This pilot observational prospective study examined the effect of NAC using anthracycline + cyclophosphamide (AC) followed by paclitaxel (PTx) on a portfolio of 22 plasma and urinary amino acids, plasma proteins (albumin, prealbumin, transferrin), and products of nitrogen metabolism (urea, creatinine, uric acid) in plasma and urine. Plasma and 24-h urine samples were obtained from ten patients with early breast cancer (N1-3 N0-2 M0), at the following time points: before the start of NAC and during the AC/PTx treatment period (a total of 8 measurements at three-weekly intervals). Amino acids were analyzed using ion exchange chromatography. There were no significant differences in the measured parameters in plasma and urine between pre-NAC and during AC- and PTx-treatment. No trend was detected. A significant difference in the portfolio of plasma and urinary amino acids was found only in the pre-treatment period compared to the control group. Levels of eight plasma amino acids (8/22) were significantly reduced and those of nine urine amino acids were increased (9/22). Nitrogenous catabolites in plasma and urine were not indicative of increased protein catabolism during the anthracycline and taxane treatment periods. A slightly positive nitrogen balance was accompanied by an average weight gain of 3.3 kg (range 0-6 kg). The AC/PTx treatment regimen did not cause significant changes in the monitored laboratory parameters.

• MeSH
• aminokyseliny * moč   krev   MeSH
• antracykliny terapeutické užití   aplikace a dávkování   MeSH
• cyklofosfamid * terapeutické užití   MeSH
• dospělí MeSH
• dusík * moč   MeSH
• kreatinin moč   krev   MeSH
• krevní proteiny * metabolismus   analýza   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• nádory prsu * farmakoterapie   krev   moč   MeSH
• neoadjuvantní terapie * MeSH
• paclitaxel * terapeutické užití   aplikace a dávkování   MeSH
• pilotní projekty MeSH
• prospektivní studie MeSH
• protokoly antitumorózní kombinované chemoterapie terapeutické užití   MeSH
• senioři MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• pozorovací studie MeSH