DNABIND: an interactive microcomputer program searching for nucleotide sequences that may code for conserved DNA-binding protein motifs
Computer applications in the biosciences.
1992 Aug ;
8 (4) :
401-4.
Jazyk angličtina Země Anglie, Velká Británie Médium print
Typ dokumentu časopisecké články
Perzistentní odkaz
https://www.medvik.cz/link/pmid01386773
- MeSH
- algoritmy MeSH
- bakteriofág lambda MeSH
- DNA vazebné proteiny genetika MeSH
- fungální proteiny genetika MeSH
- genom MeSH
- konformace proteinů MeSH
- leucinové zipy MeSH
- mikropočítače MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- rozpoznávání automatizované * MeSH
- Saccharomyces cerevisiae MeSH
- sekvence aminokyselin MeSH
- software * MeSH
- uživatelské rozhraní počítače MeSH
- virové proteiny genetika MeSH
- zinkové prsty MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Názvy látek
- DNA vazebné proteiny MeSH
- fungální proteiny MeSH
- virové proteiny MeSH
This paper presents a simple program for interactive searching for nucleotide sequences that may code for the helix-turn-helix, zinc finger or leucine zipper motifs in proteins. The helix-turn-helix motifs are predicted using the recently published method of Dodd and Egan, while zinc fingers and leucine zippers are searched for by our original methods. DNABIND is shown to detect all four known helix-turn-helix motifs in bacteriophage lambda genes and both zinc fingers of the adr1 gene of yeast.
Citace poskytuje Crossref.org
