Localization of the single copy gene Mdh2 on Xenopus tropicalis chromosomes by FISH-TSA
Jazyk angličtina Země Švýcarsko Médium print
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
PubMed
17268187
DOI
10.1159/000097427
PII: 000097427
Knihovny.cz E-zdroje
- MeSH
- genetická vazba MeSH
- hybridizace genetická MeSH
- hybridizace in situ fluorescenční * MeSH
- hybridizace nukleových kyselin * MeSH
- klonování DNA MeSH
- komplementární DNA metabolismus MeSH
- malátdehydrogenasa genetika MeSH
- mapování chromozomů metody MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- proteiny Xenopus genetika MeSH
- sekvence aminokyselin MeSH
- sekvenční homologie aminokyselin MeSH
- Xenopus laevis MeSH
- Xenopus genetika MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- komplementární DNA MeSH
- malátdehydrogenasa MeSH
- proteiny Xenopus MeSH
A single copy gene, mitochondrial malate dehydrogenase 2 (Mdh2), was localized on Xenopus tropicalis chromosomes by fluorescence in situ hybridization coupled with tyramide signal amplification (FISH-TSA). The respective cDNA was cloned and sequenced. The labeled probe hybridized with a subcentromeric region of the long arms of homologous chromosomes 3. Results of comparison of the gene localization with previously mapped X. laevis paralogs strongly suggest a common evolutionary origin of chromosomes 3 and 8 in X. laevis and chromosome 3 in X. tropicalis. This is the first time that a single copy gene has been visualized on X. tropicalis chromosomes. The FISH-TSA method gives a strong signal with a 1-kb labeled probe.
Citace poskytuje Crossref.org
Efficient high-throughput sequencing of a laser microdissected chromosome arm