Crystallization and diffraction analysis of β-N-acetylhexosaminidase from Aspergillus oryzae
Jazyk angličtina Země Velká Británie, Anglie Médium print-electronic
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem, Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.
PubMed
21505251
PubMed Central
PMC3080160
DOI
10.1107/s1744309111004945
PII: S1744309111004945
Knihovny.cz E-zdroje
- MeSH
- Aspergillus oryzae enzymologie MeSH
- beta-N-acetylhexosaminidasy chemie metabolismus MeSH
- glykosylace MeSH
- katalytická doména MeSH
- krystalizace MeSH
- krystalografie rentgenová MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S. MeSH
- Názvy látek
- beta-N-acetylhexosaminidasy MeSH
Fungal β-N-acetylhexosaminidases are enzymes that are used in the chemoenzymatic synthesis of biologically interesting oligosaccharides. The enzyme from Aspergillus oryzae was produced and purified from its natural source and crystallized using the hanging-drop vapour-diffusion method. Diffraction data from two crystal forms (primitive monoclinic and primitive tetragonal) were collected to resolutions of 3.2 and 2.4 Å, respectively. Electrophoretic and quantitative N-terminal protein-sequencing analyses confirmed that the crystals are formed by a complete biologically active enzyme consisting of a glycosylated catalytic unit and a noncovalently attached propeptide.
Zobrazit více v PubMed
Berman, H. M., Westbrook, J., Feng, Z., Gilliland, G., Bhat, T. N., Weissig, H., Shindyalov, I. N. & Bourne, P. E. (2000). Nucleic Acids Res. 28, 235–242. PubMed PMC
Brune, D. C., Hampton, B., Kobayashi, R., Leone, J. W., Linse, K. D., Pohl, J., Thoma, R. S. & Denslow, N. D. (2007). J. Biomol. Tech. 18, 306–320. PubMed PMC
Bulawa, C. E. (1993). Annu. Rev. Microbiol. 47, 505–534. PubMed
Cheng, Q., Li, H., Merdek, K. & Park, J. T. (2000). J. Bacteriol. 182, 4836–4840. PubMed PMC
Cohen, E. (2001). Pest Manag. Sci. 57, 946–950. PubMed
Collaborative Computational Project, Number 4 (1994). Acta Cryst. D50, 760–763. PubMed
Ettrich, R., Kopecký, V., Hofbauerová, K., Baumruk, V., Novák, P., Pompach, P., Man, P., Plíhal, O., Kutý, M., Kulik, N., Sklenář, J., Ryšlavá, H., Křen, V. & Bezouška, K. (2007). BMC Struct. Biol. 7, 32. PubMed PMC
Evans, P. (2006). Acta Cryst. D62, 72–82. PubMed
Gooday, G. W., Zhu, W.-Y. & O’Donnell, R. W. (1992). FEMS Microbiol. Lett. 100, 387–391.
Huňková, Z., Křen, V., Ščigelová, M., Weignerova, L., Scheel, O. & Thiem, J. (1996). Biotechnol. Lett. 18, 725–730.
Křen, V., Ščigelová, M., Přikrylova, V., Havliček, V. & Sedmera, P. (1994). Biocatalysis, 10, 181–193.
Krist, P., Herkommerová-Rajnochová, E., Rauvolfová, J., Semeňuk, T., Vavrusková, P., Pavlíček, J., Bezouška, K., Petrus, L. & Křen, V. (2001). Biochem. Biophys. Res. Commun. 287, 11–20. PubMed
Leslie, A. G. W. (1999). Acta Cryst. D55, 1696–1702. PubMed
Mahuran, D. J. (1999). Biochim. Biophys. Acta, 1455, 105–138. PubMed
Mark, B. L., Mahuran, D. J., Cherney, M. M., Zhao, D., Knapp, S. & James, M. N. (2003). J. Mol. Biol. 327, 1093–1109. PubMed PMC
Mark, B. L., Vocadlo, D. J., Zhao, D., Knapp, S., Withers, S. G. & James, M. N. (2001). J. Biol. Chem. 276, 42131–42137. PubMed
Matthews, B. W. (1968). J. Mol. Biol. 33, 491–497. PubMed
Minor, W., Cymborowski, M., Otwinowski, Z. & Chruszcz, M. (2006). Acta Cryst. D62, 859–866. PubMed
Plíhal, O., Sklenář, J., Hofbauerová, K., Novák, P., Man, P., Pompach, P., Kavan, D., Ryšlavá, H., Weignerová, L., Charvátová-Pišvejcová, A., Křen, V. & Bezouška, K. (2007). Biochemistry, 46, 2719–2734. PubMed
Pompach, P., Man, P., Kavan, D., Hofbauerová, K., Kumar, V., Bezouška, K., Havlíček, V. & Novák, P. (2009). J. Mass Spectrom. 44, 1571–1578. PubMed
Prag, G., Papanikolau, Y., Tavlas, G., Vorgias, C. E., Petratos, K. & Oppenheim, A. B. (2000). J. Mol. Biol. 300, 611–617. PubMed
Rajnochová, E., Dvořakova, J., Huňková, Z. & Křen, V. (1997). Biotechnol. Lett. 19, 869–872.
Slámová, K., Bojarová, P., Petrásková, L. & Křen, V. (2010). Biotechnol. Adv. 28, 682–693. PubMed
Weignerová, L., Vavrušková, P., Pišvejcová, A., Thiem, J. & Křen, V. (2003). Carbohydr. Res. 338, 1003–1008. PubMed
Weiss, M. S. (2001). J. Appl. Cryst. 34, 130–135.