Classification of strain CCM 4446T as Rhodococcus degradans sp. nov
Jazyk angličtina Země Anglie, Velká Británie Médium print-electronic
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
PubMed
26385412
DOI
10.1099/ijsem.0.000584
Knihovny.cz E-zdroje
- MeSH
- bakteriální geny MeSH
- DNA bakterií genetika MeSH
- fosfolipidy chemie MeSH
- fylogeneze * MeSH
- hybridizace nukleových kyselin MeSH
- kyselina diaminopimelová chemie MeSH
- kyseliny mykolové chemie MeSH
- mastné kyseliny chemie MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- peptidoglykan chemie MeSH
- polyaminy chemie MeSH
- půdní mikrobiologie * MeSH
- Rhodococcus klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- ribotypizace MeSH
- RNA ribozomální 16S genetika MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- techniky typizace bakterií MeSH
- vitamin K 2 chemie MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Švýcarsko MeSH
- Názvy látek
- DNA bakterií MeSH
- fosfolipidy MeSH
- kyselina diaminopimelová MeSH
- kyseliny mykolové MeSH
- mastné kyseliny MeSH
- peptidoglykan MeSH
- polyaminy MeSH
- RNA ribozomální 16S MeSH
- vitamin K 2 MeSH
Strain CCM 4446T, with notable biodegradation capabilities, was investigated in this study in order to elucidate its taxonomic position. Chemotaxonomic analyses of quinones, polar lipids, mycolic acids, polyamines and the diamino acid of the cell-wall peptidoglycan corresponded with characteristics of the genus Rhodococcus. Phylogenetic analysis, based on the 16S rRNA gene sequence, assigned strain CCM 4446T to the genus Rhodococcus and placed it in the Rhodococcus erythropolis 16S rRNA gene clade. Further analysis of catA and gyrB gene sequences, automated ribotyping with EcoRI restriction endonuclease, whole-cell protein profiling, DNA-DNA hybridization and extensive biotyping enabled differentiation of strain CCM 4446T from all phylogenetically closely related species, i.e., Rhodococcus baikonurensis, Rhodococcus qingshengii, Rhodococcus erythropolis and Rhodococcus globerulus. The results obtained show that the strain investigated represents a novel species within the genus Rhodococcus, for which the name Rhodococcus degradans sp. nov., is proposed. The type strain is CCM 4446T ( = LMG 28633T).
Citace poskytuje Crossref.org
