Complete genome sequence of currant latent virus (genus Cheravirus, family Secoviridae)
Jazyk angličtina Země Rakousko Médium print-electronic
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
PubMed
26563315
DOI
10.1007/s00705-015-2679-5
PII: 10.1007/s00705-015-2679-5
Knihovny.cz E-zdroje
- MeSH
- fylogeneze MeSH
- genom virový * MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- Ribes virologie MeSH
- RNA virová genetika MeSH
- RNA-viry genetika izolace a purifikace MeSH
- rostlinné viry genetika izolace a purifikace MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- sekvenční homologie MeSH
- shluková analýza MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- RNA virová MeSH
The complete nucleotide sequences of RNA1 and RNA2 of the Holandský červený strain of currant latent virus (CuLV) were determined using next-generation sequencing. The RNA1 is predicted to encode a polyprotein 2124 amino acid long with RdRp motifs. The RNA2 is predicted to encode a polyprotein 957 amino acid long with homology to the capsid protein of apple latent spherical virus and cherry rasp leaf virus. Phylogenetic analysis confirms that CuLV is a new distinct member of the genus Cheravirus.
Citace poskytuje Crossref.org
GENBANK
KT692952, KT692953
