protein Cas9 [CRISPR-Associated Protein 9]

tematický
10
Termíny

CRISPR-Cas9
endonukleáza Cas9
enzym Cas9

 

Cas9 Endonuclease
Cas9 Enzyme
Cas9 Protein

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/D000076987
Definice

Endodeoxyribonukleáza řízená RNA, která se spojuje se sekvencemi CRISPR u bakterie Streptococcus pyogenes a dalších bakterií. Podílí se na adaptivní imunitní funkci - štěpení cizí DNA komplementární k malým vodícím RNA (sgRNA). Strukturně se Cas9 skládá z modulu struktury alfa-helix a nukleázového modulu, které jsou spojené jednou šroubovicí. Nukleázový modul obsahuje dvě enzymové domény: RuvC, která štěpí jiné než cílové vlákno DNA, a nukleázovou doménu HNH, která štěpí cílové vlákno. Specifita pro cílovou DNA závisí na přítomnosti sekvence PAM (protospacer adjacent motif), což je sekvence DNA o délce 2-6 nukleotidů bezprostředně následující za sekvencí, na kterou Cas9 cílí.

An RNA-guided endodeoxyribonuclease that associates with CRISPR SEQUENCES in STREPTOCOCCUS PYOGENES and other bacteria where it participates in an adaptive immune function to cleave foreign DNA complimentary to small GUIDE RNA (sgRNAs). Structurally, Cas9 consists of an ALPHA-HELIX module and a nuclease module connected by a single helix. The nuclease module contains two enzymatic domains: RuvC, which cleaves non-target DNA strand, and an HNH nuclease domain, which cleaves the target strand. Specificity for the DNA target depends on the presence of a protospacer adjacent motif (PAM) sequence, a 2-6 nucleotide DNA sequence immediately following the sequence targeted by Cas9.

DUI
D000076987 MeSH Prohlížeč
CUI
M000638955
RN
EC 3.1.-
Předchozí užití
Bacterial Proteins (2015-2018); Endonucleases (2015-2018)
Historická pozn.
2019
Veřejná pozn.
2019

D Chemikálie a léčiva
D08.811 enzymy 1 547
D08.811.277 hydrolasy 475
D08.811.277.352 esterasy 207
D08.811.277.352.355 endonukleasy 87
D08.811.277.352.355.325 endodeoxyribonukleasy 17
D08.811.277.352.355.325.150 protein Cas9 10
D08.811.277.352.355.325.300 restrikční enzymy 51
D08.811.277.352.355.325.350 "flap" endonukleasy 6
D08.811.277.352.355.325.400 resolvasy Hollidayova spojení 2
D08.811.277.352.355.325.500 mikrokoková nukleasa 3
D08.811.277.352.355.325.600 homologní protein MRE11 6
D08.811.277.352.355.325.850 nukleasy s motivem zinkových prstů 1
D12.776 proteiny 2 575
D12.776.097 bakteriální proteiny 1 017
D12.776.097.025 antigeny bakteriální 323
D12.776.097.100 azurin 4
D12.776.097.151 bakteriociny 147
D12.776.097.156 botulotoxiny 251
D12.776.097.162 skelet buněčné stěny 6
D12.776.097.181 koagulasa 68
D12.776.097.200 koliciny 127
D12.776.097.219 protein Cas9 10
D12.776.097.237 DNA gyráza 22
D12.776.097.256 DNA-topoisomerasa IV 3
D12.776.097.275 proteiny z Escherichia coli 135
D12.776.097.293 exfoliatiny 22
D12.776.097.350 ferredoxiny 14
D12.776.097.380 flagelin 28
D12.776.097.400 flavodoxin 1
D12.776.097.521 lac represory 2
D12.776.097.529 luciferasy bakteriální 3
D12.776.097.533 MCP systém
D12.776.097.577 periplazmatické proteiny 1
D12.776.097.820 stafylokokový protein A 8
D12.776.097.835 streptavidin 19
D12.776.097.872 tetanový toxin 23
D12.776.097.890 TAL efektory 1
D12.776.212 Cas proteiny 3
D12.776.212.500 protein Cas9 10