Sonic hedgehog medulloblastoma encompasses a clinically and molecularly diverse group of cancers of the developing central nervous system. Here, we use unbiased sequencing of the transcriptome across a large cohort of 250 tumors to reveal differences among molecular subtypes of the disease, and demonstrate the previously unappreciated importance of non-coding RNA transcripts. We identify alterations within the cAMP dependent pathway (GNAS, PRKAR1A) which converge on GLI2 activity and show that 18% of tumors have a genetic event that directly targets the abundance and/or stability of MYCN. Furthermore, we discover an extensive network of fusions in focally amplified regions encompassing GLI2, and several loss-of-function fusions in tumor suppressor genes PTCH1, SUFU and NCOR1. Molecular convergence on a subset of genes by nucleotide variants, copy number aberrations, and gene fusions highlight the key roles of specific pathways in the pathogenesis of Sonic hedgehog medulloblastoma and open up opportunities for therapeutic intervention.
- MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- genetická variace MeSH
- genové regulační sítě MeSH
- kojenec MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- meduloblastom genetika MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- nádory mozečku genetika MeSH
- předškolní dítě MeSH
- proteiny hedgehog genetika MeSH
- regulace genové exprese u nádorů * MeSH
- signální transdukce genetika MeSH
- transkriptom * MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- kojenec MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Research Support, N.I.H., Extramural MeSH
