Suitable procedures for studying early pathology of Alzheimer's disease (AD) are currently being sought. The main aim of the project is to create a model of cell cultures suitable for monitoring changes in the biology of nerve cells (neurons and astrocytes) in patients with AD. Using the induced pluripotent cell method (iPSC), the role of nerve cells in the formation of sporadic form of AD will be studied. IPSCs are the ideal model, because they can be derived from any individual; they are genetically identical to the donor; and they have the capacity to form any cell type. Differentiation of fibroblast-derived human iPSCs into mature nerve cells affects the expression of ion channels and receptors that could play a crucial role in the formation of AD. The main aim of the project is to identify changes in glutamatergic pathways in human astrocytes induced from cells of patients with sporadic AD. Our results will help reveal the mechanisms responsible for astrocytic impairment in AD patients, and suggest an effective strategy for its treatment and prevention.

V současné době jsou naléhavě hledány vhodné postupy pro studium časné patologie Alzheimerovi choroby (AD). Hlavním cílem projektu je vytvořit model buněčných kultur vhodných pro sledování časných změn v biologii nervových buněk (neuronů a astrocytů) u pacientů s AD. Za použití metody indukovaných pluripotentních buněk (iPSC) bude studována úloha nervových buněk v průběhu vzniku sporadické formy AD. IPSC jsou ideálním modelem, jelikož a) je možné je odvodit od jakéhokoli jednotlivce; b) jsou geneticky shodné s dárcem a c) mají schopnost vytvořit jakýkoliv buněčný typ. Diferenciace lidských iPSC odvozených z fibroblastů na zralé nervové buňky ovlivňuje expresi iontových kanálů a receptorů, které by mohly hrát zásadní roli při vzniku AD. Cílem projektu proto bude identifikovat změny glutamátergních drah u lidských astrocytů indukovaných z buněk pacientů se sporadickou formou AD. Z hlediska klinického významu naše výsledky pomohou odhalit mechanizmy odpovědné za zhoršení funkce astrocytů u pacientů s AD a umožní navrhnout účinnou strategii její léčby a prevence.

• Klíčová slova
• Alzheimerova demence, genetic analysis, glutamát, glutamate, neural cells, genetická analýza, Alzheimer's dementia, iPSC, nervové buňky, membránové vlastnosti, léčba a prevence, iPSC, therapy and prevention, membrane properties,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

A short-term mortality of patients with acute myocardial infarction (AMI) without cardiogenic shock (CS) and treated with PCI is 5%, mortality of those with CS is 10 times higher. Rapid and effective antiplatelet therapy (acetylsalicylic acid and P2Y12 inhibitor) is of essential importance for an early coronary flow renewal and perfusion of microcirculation, and is as such highly important for patient’s prognosis. Patients with CS are the population with the highest thrombotic risk. CS is an exclusion criterion for participation in randomized studies. Relevant evidence resulting from comparison of antiplatelets in these patients is entirely missing. The project is a randomized study, comparing efficacy of cangrelor and ticagrelor. It is based on an assumption that cangrelor, parenteral and direct-acting P2Y12 inhibitor, has a potential to be an optimal drug for patients with AMI complicated with CS. With regards to hypoperfusion of the splanchnic area, the preferred drug application is the parenteral route while in case of drugs, those not requiring metabolisation, are being preferred.

Krátkodobá mortalita pacientů s akutním infarktem myokardu (AIM), kteří jsou léčeni perkutánní koronární intervencí bez kardiogenního šoku (KŠ) je 5%, mortalita těch s komplikujícím KŠ je desetinásobně vyšší. Rychlá a efektivní kombinovaná protidestičková léčba (kyselina acetylsalicylová a inhibitor P2Y12) má zásadní význam pro časné obnovení průtoku v koronární tepně a perfuzi mikrocirkulace, a tím pro prognózu nemocných. Pacienti s KŠ jsou populací s nejvyšším trombotickým rizikem. Přesto je KŠ vyřazovacím kritériem pro účast v randomizovaných studiích. Relevantní evidence o srovnání efektivity protidestičkových léků u této subpopulace pacientů zcela chybí. Projekt je randomizovanou multicentrickou dvojitě zaslepenou studií srovnávající efektivitu cangreloru a ticagreloru. Vychází z předpokladu, že cangrelor, parenterální a přímý inhibitor P2Y12, má potenciál být optimálním lékem pro pacienty s AIM komplikovaným iniciálně KŠ, kteří podstupují PCI. Vzhledem k hypoperfuzy splanchnika je totiž preferovanou aplikací intravenózní a z léků mají přednost ty, jež nevyžadují metabolizaci.

• Klíčová slova
• prognóza, mortalita, mortality, Outcome, akutní infarkt myokardu, kardiogenní šok, protidestičková léčba, velké kardiovaskulární příhody, cardiogenic shock, antiplatelet therapy, major cardiovascular events, acute myocardial infartion,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Skull base meningiomas often cause important neurological symptoms due to the compression of neurovascular structures. Surgical resection of the tumor is the first line treatment. The correlation between the extent of resection and both recurrence rate and overall survival is well described. However, aggressive resection of skull base meningiomas may increase mortality/morbidity rate. Meningiomas originate from arachnoid cap cells and during its growth, they cause pathological displacement of arachnoid membranes which form the basalarachnoid cisterns. From the surgical point of view, the arachnoid covering the tumor constitutes the dissection plane and natural surgical corridor. Basal meningioma classification considering this principle should help in the choice of treatment approach as well as preoperative surgical planning. Multicentric retrospective and prospective study should test this hypothesis and it should determine the risk factors in various groups of skull base meningiomas.

Meningiomy baze lební se často projeví neurologickou symptomatikou, která je způsobena kompresí neurovaskulárních struktur. Základním terapeutickým principem je chirurgická resekce. Vztah mezi rozsahem chirurgické resekce, recidivou a celkovou dobou přežití pacientů je dobře dokumentován. Radikální resekce je však v některých případech zatížena poměrně vysokou morbiditou a mortalitou. Dobrá znalost anatomických poměrů, zejména vztahu nádoru k arachnoidálníkm membránám, by mělo pomoci ke snížení morbidity i mortality chirurgické léčby. Meningiomy během svého růstu způsobují postupnou dislokaci arachnoideálních membrán a okolních struktur. Arachnoidea formuje disekční koridor čím je vrstva pevnější a vícevrstevnatá tím radikálnější může být resekce. Klasifikace meningiomů baze lební zohledňující tento princip umožní snazšívolbu vhodného terapeutického přístupu a usnadní plánovaní chirurgického zákroku. Plánovaná retrospektivní a prospektivní multicentrická studie otestuje danou hypotézu a ozřejmí rizikové faktory pro resekci meningiomů baze lební.

• Klíčová slova
• meningiom;, arachnoidea;, neurologická morbidita;, meningioma;, arachnoid membrane;, neurologic morbidity;,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Search for molecular biomarkers enabling prediction of cancer treatment efficacy and establishment of optimal method for their assessment represent major opportunities, but also challenges in translational research. This project aims to explore feasibility of the next generation sequencing method for discovery of Czech population-specific genetic biomarkers for stratification of cancer patients into prognostically meaningful groups. Genetic background of patients treated with adjuvant chemotherapy regimens based on nucleoside analogs, taxanes and platinum derivatives will be explored by whole exome profiling method in cancer patients of Czech origin for the first time. Results will be compared with data in publicly available databases as TCGA and ICGC and with data from Czech NCGM genetic variability project. Panel of germline variants and somatically relevant genes for prognostication of patients will subsequently be validated and its cost efficacy and benefit will be evaluated in comparison with the whole exome approach.

Analýza molekulárních biomarkerů umožňujících predikci reakce nádorů na léčbu a zavedení optimální metody pro jejich sledování představují zásadní výzvy současného translačního výzkumu. Tento projekt má za cíl prozkoumat využitelnost metody sekvenování příští generace pro hledání genetických biomarkerů, specifických pro českou populaci, které by umožnily rozdělení pacientů se solidními nádory do prognosticky významných skupin. V rámci projektu bude studován genetický profil pacientů se solidními nádory léčenými adjuvantní terapií režimy založenými na nukleosidových analozích, taxanech a platinových derivátech. Metoda celoexomového sekvenování bude poprvé použita ke studiu tohoto fenoménu u českých pacientů s malignitami. Výsledky studie budou porovnány s daty ve veřejně dostupných databázích, např. TCGA, ICGC a s výstupy projektu NCLG, který mapuje genetickou variabilitu obecné české populace. Hlavním výstupem projektu bude validovaný panel zárodečných variant a somaticky významných genů pro další studie a analýza účinnosti panelového sekvenování, ve srovnání s celoexomovým přístupem.

• Klíčová slova
• prognosis, sekvenování nové generace, Next generation sequencing, therapy, nádor, cancer, terapie, proveditelnost, feasibility, prognoza,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Renal cell carcinoma (RCC) represents a serious oncological disease with the highest incidence in the Czech Republic across the world, for which reliable molecular prognostic and predictive biomarkers are still unavailable. We will implement a novel digital biobanking technology based on protein fingerprints (proteotypes) using mass spectrometry in data independent acquisition mode. With the use of a new technique, we will analyze two well-characterized sets of tumors, the resulting data will be statistically evaluated in order to find: (i) protein biomarkers identifying patients with localized RCC, but with higher risk, who should be monitored more intensively, and (ii) protein biomarkers associated with poor prognosis of metastatic RCC treated by tyrosine kinase inhibitors in the first line. We expect that the identified patterns, potential biomarkers, and potential therapy targets can contribute to more efficient treatment of RCC patients.

Renální karcinom (RCC) přestavuje závažné onkologické onemocnění s celosvětově nejvyšší incidencí v České republice, přičemž spolehlivé molekulární prognostické a prediktivní biomarkery nejsou dosud k dispozici. Pro jejich “high-throughput“ vyhledávání a validaci zavedeme novou metodiku digitálního biobankingu založenou na získávání proteinových fingerprintů (proteotypů) pomocí hmotnostní spektrometrie v tzv. “data independent acquisition” módu. S využitím nově zavedené techniky budou analyzovány dva velmi dobře charakterizované soubory nádorů, získaná data budou statisticky hodnocena s cílem nalézt: (i) proteinové biomarkery identifikující pacienty s lokalizovaným RCC avšak s vyšším rizikem, kteří by měli být detailněji sledováni, a (ii) proteinové biomarkery související se špatnou odpovědí metastatických nádorů ledvin na léčbu tyrosinkinasovými inhibitory v první linii. Očekáváme, že nalezené patterny, potenciální biomarkery, resp. potenciální terapeutické cíle pomohou přispět k zefektivnění terapie pacientů s nádory ledvin.

• Klíčová slova
• renal cell carcinoma, Hmotnostní spektrometrie, Mass Spectrometry, karcinom ledviny, datově nezávislý sběr dat, data independent acquisition,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

The number of food-borne outbreaks caused by viruses increased in the European Union. In spite of it, the viruses are rarely determined as causes of food- or water-borne outbreaks in the Czech Republic. The unpreparedness of the national surveillance system for food-borne diseases was revealed recently when a norovirus water-borne outbreak occurred in May 2015 in Prague. The main problem was the amble determination of the causative agents and the source of the contamination. Therefore a rapid multiplex one-step screening methods will be introduced and monitoring together with molecular typing of food-borne viruses originating from clinical material and food- or water-borne outbreaks will be performed. Knowledge about the prevalence and ecology of these viruses will be improved in the Czech Republic. The methodology (molecular biological methods) used in the project will be distributed among the collaborative laboratories, their methodological expertise will be improved and cooperation between human and veterinary laboratories will be strengthen.

Počet virových epidemií způsobených kontaminovanými potravinami či vodou v Evropské unii stále vzrůstá. Přesto jsou virová agens v České republice jen výjimečně stanovena jako příčina takovýchto epidemií. O nepřipravenosti tuzemského systému sledování alimentárních onemocnění svědčí vodní norovirová epidemie v Praze (květen 2015), kde hlavním problémem bylo nedostatečně rychlé stanovení původců a zdroje kontaminace. Proto budou v řešeném projektu zavedeny metody sloužící k rychlé a multiplexní detekci virů způsobujících alimentární infekce a bude proveden monitoring spojený s molekulární typizací těchto virů v klinických vzorcích a vzorcích pocházejících z epidemií. Takto budou v České republice získány znalosti týkající se rozšíření a ekologie virů v souvislosti s alimentárními infekcemi. Molekulárně biologické metody použité v rámci projektu budou sdíleny se spolupracujícími laboratořemi, čímž bude zlepšena jejich metodická odbornost a bude posílena spolupráce mezi humánní a veterinární sférou.

• Klíčová slova
• NGS, NGS, sequencing, potraviny, food, sekvenování, norovirus, virus hepatitidy A, virus hepatitidy E, rychlá multiplexní detekce, RT-qPCR, xMAP suspenzní array, voda, dosledovatelnost, norovirus, hepatitis A virus, hepatitis E virus, rapid multiplex detection, RT-qPCR, xMAP suspension array, water, traceability,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Background. Current clinical Guidelines recommend consideration of veno-arterial extracorporeal membrane oxygenation (ECMO) use in patients with severe cardiogenic shock. Until now, however, randomized prospective study supporting this recommendation has not been performed. Objectives. The aim of this project is to compare early conservative therapy and immediate implantation of ECMO in patients with severe cardiogenic shock. Methods. Eligible patients with severe cardiogenic shock will be randomized to early conservative therapy or ECMO implantation on the background of standard care including all other invasive procedures. Implantation of other mechanical support devices including ECMO in the primary conservative group is allowed in the case of shock progression. Primary endpoint. Composite of death from any cause, resuscitated circulatory arrest, and implantation of another mechanical circulatory support device at 30 days. Discussion. The results of this trial may provide clear evidence on the efficacy and safety of ECMO implantation in patients with severe cardiogenic shock.

Úvod. Současná Guidelines doporučují zvážit zavedení venoarteriální extrakorporální membránové oxygenace (ECMO) u nemocných s těžkým kardiogenním šokem. Doposud však nebyla provedena prospektivní randomizovaná studie, zaměřená na ECMO u kardiogenního šoku. Cíl. Předkládaný projekt se zabývá srovnáním časně konzervativního postupu a okamžité implantace ECMO u pacientů s těžkým kardiogenním šokem. Metody. Nemocní s těžkým kardiogenním šokem budou randomizováni k časně konzervativní léčbě nebo zavedení ECMO. Veškerá další péče včetně případných jiných invazivních výkonů bude poskytována podle současných standardů. Implantace mechanické podpory v primárně konzervativní skupině je povolena v případě progrese šokového stavu. Primární kombinovaný cílový ukazatel. Úmrtí z jakékoli příčiny, resuscitovaná oběhová zástava a zavedení další mechanické oběhové podpory v prvních 30 dnech. Diskuze. Výsledky této studie mohou jednoznačně zhodnotit účinnost a bezpečnost oběhové podpory ECMO u nemocných s těžkým kardiogenním šokem.

• Klíčová slova
• kardiogenní šok, cardiogenic shock, Extrakorporální membránová oxygenace, Mechanická podpora oběhu, Extracorporeal membrane oxygenation, Mechanical circulatory support,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

The EUROASPIRE V Study will be carried out in 2017 -2019 in about 25 European countries. In patients treated previously in hospitals with established CHD, in their Ist-degree relatives and in persons at high cardiovascular (CV) risk, it will assess the prevalence of CHD risk factors and CHD risk control by lifestyle interventions and medication. The Czech EUROASPIRE V, as integral part of an international project, will compare the level of CV prevention in the Czech Republic with requirements of the European CV prevention guidelines, with the standard of prevention in other European countries and time trends since 1995. Diagnosis and treatment of diabetes mellitus, atrial fibrillation, heart failure and some other CV risk factors will be analysed in particular. In a sample of patients with confirmed CHD, substudies of new CV (CHD) risk factors will be carried out. Study results will be published in journals with IF and will be used in the preparation of the next CV prevention guidelines.

Studie EURASPIRE V, která bude pobíhat v letech 2017-2019, bude v cca 25 evropských zemích zjišťovat u pacientů původně hospitalizovaných s prokázanou ICHS, u jejich příbuzných I. stupně a u osob s vysokým kardiovaskulárním (KV) rizikem prevalenci rizikových faktorů ICHS a kontrolu KV rizika intervencí životního stylu a medikamentózní léčbou. Česká část studie EUROASPIRE V porovná úroveň prevence v ČR s požadavky evropských doporučení KV prevence z roku 2012 a 2016, se stavem prevence v dalších evropských zemích a časové trendy od roku 1995. Studie se věnuje také diagnostice a léčbě DM, fibrilace síní a srdečního selhání a některým dalším klinickým stavům a faktorům KV rizika. Aktuální analýza sekundární prevence ICHS, časové trendy a porovnání s dalšími evropskými zeměmi, analýza souboru vysokého KV rizika a substudie v definovaném souboru pacientů s prokázanou a intervenovanou ICHS, zaměřené na nové KV rizikové faktory, budou publikovány v časopisech s IF, recenzovaných časopisech bez IF a aplikovány při přípravě nových doporučení KV prevence.

• Klíčová slova
• sekundární prevence, secondary prevention, rizikové faktory, risk factors, ICHS, implementace, EUROASPIRE, CHD, implementation, EUROASPIRE,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Imaging methods are fundamental for diagnosis, staging and monitoring of therapy of lung cancer. Functional imaging combines morphology with clinical parameters - e.g. metabolic activity (PET/CT), diffusivity (MR) or vascularization (CT) is a new trend to improve accuracy of clinical description of the actual disease status and information on the dynamics of its progress. Development of methods in the field of cancer genomics in the last few years has led to a new minimally-invasive procedures for molecular profiling of DNA released from the tumor mass into the peripheral circulation (circulating tumor DNA, ctDNA) and its usage for more accurate diagnosis and rational choice of targeted anticancer therapies. The present project proposes an entirely new concept of functional imaging methods based on the combination of PET/CT examination with quantitative determination of ctDNA which will be developed on the set of 200 patients undergoing systemic therapy of lung cancer. The clinical course of the disease treatment will be followed over time using this new combination approach.

Zobrazovací metody jsou základem diagnostiky, stagingu i sledování efektu terapie plicního karcinomu. Trendem posledních let je využití tzv. funkčních zobrazovacích metod, které kombinují morfologii s určitým klinickým parametrem - např. metabolickou aktivitou (PET/CT), difuzivitou (MR) či vaskularizací (CT). Tato kombinace umožňuje jednak zpřesnění klinického obrazu onemocnění a současně poskytuje informaci o dynamice jeho průběhu. Vývoj metod v oblasti nádorové genomiky v posledních několika letech vedl k novým minimálně-invazivním postupům molekulárních vyšetření DNA uvolňované z nádorové masy do periferního oběhu (circulating tumor DNA, ctDNA) a jejich využití pro zpřesnění diagnostiky a racionální volbu cílené protinádorové terapie. V tomto projektu je předkládán zcela nový koncept funkčních zobrazovacích metod založených na kombinaci PET/CT vyšetření s kvantitativním stanovením ctDNA, který bude vyvinut na souboru celkem 200 pacientů podstupující systémovou terapii bronchogenního karcinomu, u kterých bude v čase sledován a hodnocen klinický průběh onemocnění a léčby.

• Klíčová slova
• genotypizace, genotyping, FDG-PET/CT, plicní karcinom, fenotypizace, ctDNA, FDG-PET/CT, lung carcinoma, phenotyping, ctDNA,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Allogeneic haematopoietic cell transplantation is a standard therapy for severe hematologic malignancies. Despite the improvement of search for optimal donors, frequent complications such as graft-versus-host disease or relapses still occur. The number of potential donors is steadily increasing and it is often possible to choose the best donor from several alternative donors. Many transplant centers have already introduced a selection based on other criteria than the commonly used HLA match. Match/mismatch in other molecules that can affect the outcome of transplantation (e.g. KIR receptors) are being widely investigated. In addition to KIR receptors, it is possible to determine the match/mismatch in other receptors and their ligands. In the Czech Republic, the standard HLA criterion is HLA match and HLA-DPB permissive, and in some diseases the KIR haplotype is determined. The inclusion of secondary or tertiary criterion for choosing the best donor requires knowledge about polymorphisms in key molecules within the Czech population.

Alogenní transplantace hematopoetických buněk je standardní terapií závažných hematologických malignit. I přes zdokonalování vyhledávání vhodných dárců se stále vyskytují časté komplikace jako reakce štěpu proti hostiteli či relaps. Počet dárců v registrech stále stoupá a mnohdy je možné vybírat pro jednoho pacienta z několika alternativních dárců. Mnohá transplantační centra již zavedla výběr na základě dalších kritérií, než je běžně používaná shoda v „klasických“ HLA genech např. permisivitu HLA-DPB neshod. Stále více se vyšetřují i shody/neshody v molekulách, s potenciálem vlivu na výsledek transplantace, jako např. KIR receptory NK buněk. Vedle KIRů je možné stanovit i shodu/neshodu v jiných receptorech a jejich ligandech a tyto údaje mohou být použity při volbě nejlepšího dárce. V ČR je standardním kritériem HLA shoda, případně permisivita HLA-DPB, u myeloidních malignit se určuje genotyp KIR. Začlenění dalšího kritéria vyžaduje představu o míře polymorfizmů v klíčových molekulách v rámci české populace, aby se zvolilo nejlepší sekundární či terciární kritérium pro výběr dárce.

• Klíčová slova
• polymorphisms, KIR receptory, NKG2D receptor, MICA/B ligandy, polymorfizmy, česká populace, KIR receptors, NKG2D receptor, MICA/B ligands, Czech population,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR