BACKGROUND: Multiple studies have reported the prognostic impact of DNA methylation changes in acute myeloid leukemia (AML). However, these epigenetic markers have not been thoroughly validated and therefore are still not considered in clinical practice. Hence, we aimed to independently verify results of selected studies describing the relationship between DNA methylation of specific genes and their prognostic potential in predicting overall survival (OS) and event-free survival (EFS). RESULTS: Fourteen studies (published 2011-2019) comprising of 27 genes were subjected to validation by a custom NGS-based sequencing panel in 178 newly diagnosed non-M3 AML patients treated by 3 + 7 induction regimen. The results were considered as successfully validated, if both the log-rank test and multivariate Cox regression analysis had a p-value ≤ 0.05. The predictive role of DNA methylation was confirmed for three studies comprising of four genes: CEBPA (OS: p = 0.02; EFS: p = 0.03), PBX3 (EFS: p = 0.01), LZTS2 (OS: p = 0.05; EFS: p = 0.0003), and NR6A1 (OS: p = 0.004; EFS: p = 0.0003). For all of these genes, higher methylation was an indicator of longer survival. Concurrent higher methylation of both LZTS2 and NR6A1 was highly significant for survival in cytogenetically normal (CN) AML group (OS: p < 0.0001; EFS: p < 0.0001) as well as for the whole AML cohort (OS: p = 0.01; EFS < 0.0001). In contrast, for two studies reporting the poor prognostic effect of higher GPX3 and DLX4 methylation, we found the exact opposite, again linking higher GPX3 (OS: p = 0.006; EFS: p < 0.0001) and DLX4 (OS: p = 0.03; EFS = 0.03) methylation to a favorable treatment outcome. Individual gene significance levels refer to the outcomes of multivariate Cox regression analysis. CONCLUSIONS: Out of twenty-seven genes subjected to DNA methylation validation, a prognostic role was observed for six genes. Therefore, independent validation studies are necessary to reveal truly prognostic DNA methylation changes and to enable the introduction of these promising epigenetic markers into clinical practice.
- MeSH
- akutní myeloidní leukemie diagnóza genetika MeSH
- dospělí MeSH
- imunochemie metody statistika a číselné údaje MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- metylace DNA genetika fyziologie MeSH
- nádorové biomarkery analýza genetika MeSH
- prognóza MeSH
- sekvenční analýza DNA metody statistika a číselné údaje MeSH
- transkripční faktory genetika MeSH
- validační studie jako téma MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- MeSH
- bezpečnost krve * dějiny metody přístrojové vybavení trendy MeSH
- diagnostické techniky molekulární metody přístrojové vybavení MeSH
- fotometrie metody přístrojové vybavení MeSH
- imunochemie metody přístrojové vybavení MeSH
- imunologické techniky klasifikace metody přístrojové vybavení MeSH
- klinické laboratorní techniky klasifikace metody přístrojové vybavení MeSH
- laboratorní automatizace MeSH
- lidé MeSH
- sérologické testy metody přístrojové vybavení MeSH
- transfuzní lékařství * dějiny metody přístrojové vybavení trendy MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Preanalytické a analytické aspekty kvantitativní metody stanovení hemoglobinu ve stolici mají podstatný význam na vyhodnocení testu, jehož pozitivita je indikací ke kolonoskopii při screeningu kolorektálních nádorů. Požadavky na kvalitu laboratorní analýzy vyžadují podle normy ČSN EN ISO 15189, aby byla hodnocena variabilita ve všech fázích procesu zkoušky. Preanalytickým aspektem je odběr a transport vzorku zahrnující odběrovou kazetu (množství stolice, objem a složení extrakčního pufru), konzistenci stolice, stabilitu vzorku (doba a teplota transportu). Analytickým aspektem je především variabilita imunochemické technologie, rozdílné protilátky, pufry, standardy a kalibrace analyzátorů. Harmonizace a standardizace stanovení hemoglobinu ve vzorcích stolice je tématem pracovní skupiny IFCC - WG-FIT (Working Group for Fecal Immunochemical Testing).
Preanalytical and analytical aspects of the quantitative method for the determination of haemoglobin in stool are essential for the evaluation of the test, the positivity of which is an indication for colonoscopy in the screening of colorectal tumors. The quality requirements for laboratory analysis require, according to standard ISO 15189, that variability be assessed at all stages of the test process. The pre-analytical aspect is the collection and transport of the sample including the collection cassette (amount of stool, volume and composition of the extraction buffer), stool consistency, stability of the sample (time and temperature of transport). The analytical aspect is mainly the variability of immunochemical technology, different antibodies, buffers, standards and calibration of analysers. Harmonization and standardization of hemoglobin determination in stool samples is the topic of the IFCC Working Group for Faecal Immunochemical Testing (WG-FIT).
- Klíčová slova
- imunochemický test na okultní krvácení,
- MeSH
- feces chemie MeSH
- hemoglobiny * analýza MeSH
- imunochemie metody MeSH
- kolorektální nádory * prevence a kontrola MeSH
- lidé MeSH
- okultní krev MeSH
- plošný screening MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Methods for determination of biocompounds in biological samples, mainly molecules of steroid nature, have always been a well-discussed issue. This review is focused on the recent trend in clinical biochemistry, namely the use of methods that provide extreme accuracy for both research and clinical practice, such as liquid chromatography – mass spectroscopy/mass spectroscopy. These highly sophisticated methods may seem to have some advantages over the traditionally employed immunochemical methods (usually various types of enzyme immunoassay, mostly different modes of enzyme-linked immunosorbent assay). However, the former is significantly more costly, more time-consuming (as taken from the pre-analytic phase to verified results), and more demanding with respect to the qualification of the personnel. Thus, this review shows that, in many cases, these drawbacks cannot be compensated for by the benefits.
Cíl studie: Česká republika patří k největším světovým producentům máku setého. Tato plodina je kromě medicínského využití součástí tradičních pokrmů. Mák setý obsahuje řadu alkaloidů, včetně morfinu a kodeinu. Cílem práce bylo zjistit, zda lze prokázat opiáty v moči po jednorázovém požití semen máku setého v potravinářské úpravě u souboru dobrovolníků. Typ studie: prospektivní. Název a sídlo pracoviště: Psychiatrická a psychoterapeutická ambulance, Slovanská tř. 69, Plzeň, MedAvante Inc., Smrková 23, Plzeň a Ústav klinické biochemie a hematologie LF UK a FN v Plzni. Materiál a metody: Opiáty v moči byly vyšetřeny kvalitativní a semikvantitativní imunochemickou metodou u 14 dobrovolníků 15 hodin po jednorázovém požití definovaného množství máku v makových koláčích. Byl sledován vztah mezi množstvím požití máku a koncentrací opiátů v moči. Výsledky: U 12 osob byla prokázána přítomnost opiátů kvalitativním imunochemickým testem. Při užití semikvantitativního imunochemického testu byla zjištěna významná korelace mezi koncentrací opiátů v moči (po korekci na koncentraci kreatininu v moči) a množstvím požitého máku. U dvou jedinců byla zjištěna koncentrace opiátů vyšší než 300 μg/L, která je považována za pozitivní při kontrole osob závislých na opiátech. Závěr: Na základě výsledků studie a na případu pacienta v bezvědomí s pozitivním nálezem opiátů v moči je ukázáno, že při hodnocení tohoto nálezu musíme vzít v úvahu vliv předchozího požití pečiva s obsahem máku.
Objective: Czech Republic belongs among the biggest world producers of poppy seeds. Poppy seeds are used in medicine and are part of traditional food. This plant contains several alkaloids including morphine and codeine. The aim of our study was to investigate whether opiates can be detected in urine samples after single ingestion of poppy seeds in cakes in a group of volunteers. Design: prospective trial. Settings: Psychiatric a psychotherapeutic out-patient department, Slovanska 69, Plzen, MedAvante Inc., Smrkova 23, Plzen and Department of Clinical Biochemistry and Haematology, Faculty of Medicine, Charles University and University Hospital, Pilsen, Czech Republic. Material and Methods: We examined opiates with a qualitative and semiquantitative method in urine samples of 14 volunteers 15 hours after ingestion of a definitive amount of poppy seeds in home-made cakes. Correlation between amount of ingested poppy seeds and concentration of opiates in urine was observed. Results: In 12 volunteers opiates in urine were detected by a qualitative immunochemical test 15 hours after poppy seeds ingestion. Using a semiquantitative immunochemical method, a significant correlation between opiates concentration in urine (after correction for urine creatinine) and amount of ingested poppy seeds was found. In two persons concentration of opiates in urine exceeded 300 μg/L; this concentration is considered positive when testing opiate-addicted persons. Conclusion: On the basis of the study results and a case of a patient with unconsciousness and a positive finding of opiates in urine we can conclude that preceding ingestion of poppy seeds in diet must be taken into account when evaluating this laboratory finding.
- MeSH
- analýza moči metody MeSH
- cukrovinky MeSH
- dospělí MeSH
- imunochemie metody MeSH
- kodein analýza moč MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- morfin analýza moč MeSH
- odhalování abúzu drog MeSH
- opiové alkaloidy * analýza moč MeSH
- Papaveraceae * MeSH
- pozorovací studie jako téma MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Kolonická kapslová endoskopie (colon capsule endoscopy, CCE) má potenciál stát se tzv. filtrovým testem u jedinců s pozitivním testem na okultní krvácení do stolice (fecal immunochemical test, FIT). Většina těchto osob nemá na vyšetření optickou kolonoskopií (optical colonoscopy, OC) nález pokročilého adenomu nebo karcinomu, což vyvolává ekonomické otázky a současně zatěžuje pacienty zbytečným invazivním vyšetřením. V České republice probíhá od roku 2016 multicentrická studie zaměřená na využití kapslové kolonoskopie u jedinců s pozitivním FIT. Hlavním cílem studie je určit negativní prediktivní hodnotu druhé generace kolonické kapsle (CCE2) pro polypy ≥ 10 mm. Materiál a metody: Do prospektivní studie byli zařazeni jedinci na třech endoskopických pracovištích v České republice - osoby splňující následující inkluzní kritéria: asymptomatičtí jedinci mezi 50. a 75. rokem, bez rodinné či osobní anamnézy kolorektální neoplazie, s pozitivním imunochemickým testem (cut-off 75 ng/ml). Hlavním sledovaným parametrem je negativní prediktivní hodnota CCE2 pro velké polypy (≥ 10 mm). Dalšími sledovanými parametry byly detekce polypů velikosti ≥ 6 mm, ≥ 10 mm, adenomů ≥ 10 mm a karcinomů, stupeň střevní přípravy (hodnocena jako adekvátní, nebo neadekvátní), tolerance vyšetření nemocnými (na základě dotazníku) a komplikace vyšetření kolonickou kapslí (hodnoceny jako závažné, nebo nezávažné). Výsledky: Dosud bylo ve studii vyšetřeno 248 osob ve všech endoskopických centrech, do dalšího zpracování dat bylo zařazeno 178 osob s kompletním vyšetřením CCE2 a OC. Polypy byly diagnostikovány během OC u 144 jedinců (81 %), polypy ≥ 6 mm a ≥ 10 mm u 90 (51 %), respektive u 47 (26 %) osob. Senzitivita pro polypy ≥ 6 mm a ≥ 10 mm činila 82 % (95% interval spolehlivosti [confidence interval, CI] 73-89 %), respektive 79 % (95% CI 64-89 %). Specificita pro polypy ≥ 6 mm a ≥ 10 mm dosáhla 85 % (95% CI 76-92 %) a 92 % (95% CI 86-96 %). Negativní prediktivní hodnota CCE2 pro polypy ≥ 10 mm dosáhla 92 % (95% CI 86-96 %). Zdravotní sestry identifikovaly 73 polypů ≥ 6 mm z 90 (83 %) a 37 polypů ≥ 10 mm ze 47 (79 %) nalezených na OC. Byla zaznamenána jedna retence kapsle ve stenozujícím tumoru colon ascendens, jiné závažné komplikace nebyly zaznamenány. Kapslovou kolonoskopii jako primární screeningový test preferovalo 66 % vyšetřených. Závěr: CCE2 dosahuje vysoké negativní prediktivní hodnoty pro velké polypy. Jedná se o dobře akceptovanou metodu, která má potenciál stát se filtrovým testem u jedinců s pozitivním FIT.
Background: Fecal immunochemical tests (FIT) have been used as an initial test in CRC screening programs. However, majority of patients don't have advanced neoplasia on colonoscopy. Colon capsule endoscopy (CCE) has the potential to reduce the need for optical colonoscopy (OC). Main aim of the study was negative predictive value (NPV) of the second generation of colon capsule endoscopy (CCE2) for large polyps (≥ 10 mm). The secondary aims were accuracy of detection of all polyps (polyps ≥ 6 mm and ≥ 10 mm) and cancers, number of complications and target population acceptance of both methods (CCE2 and OC). Material and methods: In this multicenter (three gastroenterology units) feasibility study, second generation of colon capsule endoscopy (CCE2) has been prospectively compared with OC in persons with positive semi-quantitative FIT with cut-off level 75 ng/ml. Colonoscopy was performed within 10 hours after capsule ingestion. CCE2 videos were viewed independently by a nurse and a physician, both blinded to the results of OC. Complications were assessed as serious (bleeding, perforation) or mild to moderate. The methods of acceptance were evaluated based on the questionnaire completed after both procedures (CCE2 and OC) were finished. The interim analysis of results is presented. Results: From April 2016, 248 individuals have been enrolled; data from 178 persons has been analyzed. During optical colonoscopy, polyps were diagnosed in 144 persons (81%), polyps ≥ 6 mm and ≥ 10 mm in 90 (51%) and 47 (26%) persons, respectively. The sensitivity of CCE2 for polyps ≥ 6 mm and ≥ 10 mm was 82% (95% confidence interval [CI]: 73-89%) and 79% (95% CI: 64-89%), respectively. The specificity for polyps ≥ 6 mm and ≥ 10 mm reached 85% (95% CI: 76-92%) and 92% (95% CI: 86-96%), respectively. The negative predictive value of CCE2 for polyps ≥ 10 mm was 92% (95% CI: 86-96%). Nurses identified 73 polyps ≥ 6 mm of 90 (83%) and 37 polyps ≥ 10 mm of 47 (79%) found on OC. A total of 119 patients (66%) preferred CCE2 as the primary screening method. Conclusion: Second generation of colon capsule has appeared to have a high negative predictive value for the detection of clinically relevant colorectal neoplasia in screening population. This method might be considered as an adequate tool for colorectal cancer screening.
- Klíčová slova
- kolonická kapslová endoskopie,
- MeSH
- imunochemie metody MeSH
- kapslová endoskopie * metody MeSH
- kolonoskopie metody MeSH
- kolorektální nádory * prevence a kontrola MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- multicentrické studie jako téma MeSH
- plošný screening MeSH
- polypy střeva diagnóza MeSH
- polypy tlustého střeva diagnóza MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- prospektivní studie MeSH
- senioři MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- senioři MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Úvod: Kolonická kapslová endoskopie má potenciál stát se tzv. filtrovým testem u jedinců s pozitivním testem na okultní krvácení do stolice. Většina těchto osob nemá při vyšetření kolonoskopií pokročilý adenom nebo karcinom, což vyvolává ekonomické otázky a současně zatěžuje pacienty zbytečným invazivním vyšetřením. V České republice probíhá od roku 2016 multicentrická studie zaměřená na využití kapslové kolonoskopie u jedinců s pozitivním testem na okultní krvácení. Hlavním cílem studie je určit negativní prediktivní hodnotu druhé generace kolonické kapsle pro polypy ≥ 10 mm. Materiál a metody: Do prospektivní studie jsou zařazeni jedinci ve třech endoskopických pracovištích v ČR. V plánu je vyšetřit 230 osob splňujících tato inkluzní kritéria: asymptomatičtí jedinci mezi 50. a 75. rokem, bez rodinné či osobní anamnézy kolorektální neoplazie a s pozitivním imunochemickým testem na okultní krvácení (cut-off 75 ng/ml). Hlavním sledovaným parametrem je negativní prediktivní hodnota druhé generace kolonické kapsle pro velké polypy (≥ 10 mm). Dalšími sledovanými parametry jsou detekce polypů velikosti ≥ 6 mm, ≥ 10 mm, adenomů ≥ 10 mm a karcinomů, stupeň střevní přípravy (hodnocena jako adekvátní nebo neadekvátní), tolerance vyšetření nemocnými (na základě dotazníků) a komplikace vyšetření kolonickou kapslí (hodnoceny jako závažné a nezávažné). Výsledky: Dosud bylo ve studii vyšetřeno 167 osob ve všech endoskopických centrech, do dalšího zpracování dat bylo zařazeno 95 osob s kompletním vyšetřením CCE2 a OC. Polypy byly diagnostikovány během optické kolonoskopie u 70 jedinců (74 %), polypy ≥ 6 mm a ≥ 10 mm u 42 (44 %), respektive u 26 (27 %) osob. Senzitivita pro polypy ≥ 6 mm a ≥ 10 mm činila 88 % (95% interval spolehlivosti [confidence interval, CI] 74-96 %), respektive 85 % (95% CI 65-96 %). Specificita pro polypy ≥ 6 mm a ≥ 10 mm dosáhla 85 % (95% CI 72-93 %) a 93 % (95% CI 84-98 %). Negativní prediktivní hodnota CCE2 pro polypy ≥ 10 mm dosáhla 94 % (95% CI 86-98 %). Sestry identifikovaly 36 polypů ≥ 6 mm ze 42 (86 %) a 23 polypů ≥ 10 mm z 26 (88 %) nalezených při optické kolonoskopii. Byla zaznamenána jedna stagnace kapsle ve stenotizujícím tumoru colon ascendens, závažné komplikace nebyly zaznamenány. Kapslovou kolonoskopii jako primární screeningový test preferovalo 68 % vyšetřených. Závěr: Kolonická kapsle druhé generace dosahuje vysokou negativní prediktivní hodnotu pro velké polypy. Jedná se o dobře akceptovanou metodu, která má potenciál stát se filtrovým testem u jedinců s pozitivním testem na okultní krvácení.
Background: Fecal immunochemical tests havebeen used as an initial test in colorectal cancer screening programs. However, majority of patients don't have advanced neoplasia on colonoscopy. Colon capsule endoscopy has the potential to reduce the need for optical colonoscopy. The main aim of the study was a negative predictive value of the second generation of colon capsule endoscopy for large polyps (≥ 10 mm). The secondary aims were: accuracy of detection of all polyps (polyps ≥ 6 mm and ≥ 10 mm) and cancers, the number of complications and target population acceptance of both methods (colon capsule endoscopy and optical colonoscopy). Material and methods: In this multicentre (three gastroenterology units) feasibility study, the second generation of colon capsule endoscopy (CCE2) has been prospectively compared with OC in persons with positive semi-quantitative FIT with cut-off level 75 ng/ml. Colonoscopy was performed within 10 hours after capsule ingestion. CCE2 videos were viewed independently by a nurse and a physician, both blinded to the results of OC. Complications were assessed as severe (bleeding, perforation) or mild to moderate. The methods of acceptance were evaluated based on the questionnaire completed after both procedures (CCE2 and OC) were finished. The interim analysis of results is presented. Results: From April 2016, 167 individuals have been enrolled; data from 95 persons have been analyzed. During the optical colonoscopy, polyps were diagnosed in 70 persons (74%), polyps ≥ 6 mm and ≥ 10 mm in 42 (44 %) and 26 (27 %) persons, respectively. The sensitivity of CCE2 for polyps ≥ 6 mm and ≥ 10 mm was 88 % (95% confidence interval [CI] 74-96 %) and 85 % (95% CI 65-96 %), respectively. The specificity for polyps ≥ 6 mm and ≥ 10 mm reached 85 % (95% CI 72-93 %) and 93 % (95% CI 84-98 %), respectively. The negative predictive value of CCE2 for polyps ≥ 10 mm was 94 % (95% CI 86-98 %). Nurses identified 36 polyps ≥ 6 mm of 42 (86 %) and 23 polyps ≥ 10 mm of 26 (88 %) found on OC. A total of 64 patients (68 %) preferred CCE2 as the primary screening method. Conclusion: The second generation of colon capsule has appeared to have a high negative predictive value for the detection of clinically relevant colorectal neoplasia in a screening population. This method might be considered as an adequate tool for colorectal cancer screening.
- MeSH
- adenom diagnóza prevence a kontrola MeSH
- hodnocení biomedicínských technologií metody trendy MeSH
- imunochemie metody trendy MeSH
- kapslová endoskopie * metody trendy MeSH
- kolonoskopie * klasifikace metody trendy MeSH
- kolorektální nádory * diagnóza prevence a kontrola MeSH
- lidé MeSH
- multicentrické studie jako téma MeSH
- okultní krev MeSH
- prospektivní studie MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- statistika jako téma MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
Screening kolorektálního karcinomu má v České republice dlouhou tradici. Vysoká specificita screeningových testů je nezbytnou podmínkou pro použití v masové depistáži. Na rozdíl od individuální diagnostiky je v populačním screeningu větším rizikem falešná pozitivita než negativita, protože vede ke zvyšování nákladů, zbytečnému vyšetřování, komplikacím a negativnímu ovlivnění kvality života zdravých lidí. Kvantitativní stanovení hemoglobinu ve stolici je v současné době nejpřesnější metodou stanovení okultního krvácení vhodnou pro screening kolorektálního karcinomu. Optimalizace screeningu je řešena ve všech zemích, kde fekální imunochemický test (faecal immunochemical test, FIT) nahradil guajakové testy, a týká se cut-off kritéria pozitivity, počtu provedených testů, kombinace FIT s dalšími biomarkery a způsobu distribuce i analýzy vzorků. Standardizace a harmonizace FIT je nezbytnou podmínkou populačního screeningu kolorektálního karcinomu, přesnost a spolehlivost kvantitativní detekce hemoglobinu ve stolici musí být zajištěna externí kontrolou kvality.
Colorectal cancer screening has a long tradition in the Czech Republic. High specificity of screening tests is a prerequisite for use in mass screening. Unlike individual diagnostics, there is a higher risk of false positivity than negativity in population screening because it leads to increased costs, unnecessary investigation, complications, and a negative impact on the quality of life of healthy people. Quantitative haemoglobin detection in stool is currently the most accurate method of determining occult bleeding suitable for colorectal cancer screening. Optimization of screening is addressed in all countries where faecal immunochemical test (FIT) has replaced guaiac tests and involves cut-off criteria for positivity, number of tests performed, combination of FIT with other biomarkers, and distribution and sample analysis. Standardization and harmonization of FIT is a prerequisite for population screening of colorectal cancer and the accuracy and reliability of quantitative detection of haemoglobin in the stool should be ensured by external quality control.
- Klíčová slova
- kvantitativní analýza,
- MeSH
- adenom diagnóza MeSH
- biologické markery analýza MeSH
- časná detekce nádoru metody MeSH
- feces chemie MeSH
- hemoglobiny * analýza MeSH
- imunochemie metody MeSH
- klinická studie jako téma MeSH
- kolorektální nádory * prevence a kontrola MeSH
- lidé MeSH
- okultní krev MeSH
- plošný screening * metody MeSH
- prekancerózy diagnóza MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
