Despite an enormous effort, the current molecular predictive and prognostic classifiers of colorectal cancer (CRC) are only marginally better than standard clinical risk factors. The reasons why lie in the tumour heterogeneity on one side and on inability of tumour molecular profiling to capture several other aspects that might be equally important, such as tumour microenvironment, including gut microbiota. We believe that microbiota and its interaction with immune system remains one of the missing pieces in the puzzle of CRC heterogeneity characterization. In this project, samples from patients with primary CRC will be assessed from different perspectives (tumour molecular pathology, stroma, immune cells, microbiota). The results will lead to identification of high-risk microbial-immune-molecular CRC pathophenotypes, which will contribute to a significant refinement of colorectal carcinoma classification and to the discovery of new / improvement of existing predictive and prognostic markers.

Přes obrovské úsilí věnované vývoji molekulárních prediktivních a prognostických modelů kolorektálního karcinomu (CRC) mají tyto jen okrajově lepší výsledky než standardně klinicky používané rizikové faktory. Důvodem je nádorová heterogenita na jedné straně a neschopnost molekulárního profilování popsat další důležité faktory, jako je mikroprostředí nádoru, včetně střevní mikroflóry. Jsme přesvědčeni, že mikroflóra a její interakce s imunitním systémem zůstává jedním z chybějících kousků v puzzle heterogenity CRC. V tomto projektu budeme prospektivně sbírat vzorky pacientů s kolorektálním karcinomem stadia II a III a charakterizovat je z pohledu molekulární patologie, imunitního profilu a složení střevní mikroflóry. Výsledky povedou k identifikaci vysoce rizikových mikrobiálně-imunitně-molekulárních CRC patofenotypů, které přispějí k významnému vylepšení klasifikace CRC a k objevu nových, nebo vylepšení stávajících prediktivních a prognostických ukazetelů.

• MeSH
• Bacteria MeSH
• fenotyp MeSH
• imunita MeSH
• kolorektální nádory diagnóza   imunologie   mikrobiologie   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiologické techniky MeSH
• nádorové mikroprostředí MeSH
• rizikové faktory MeSH
• střevní mikroflóra MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• koloproktologie
• onkologie
• mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

The project is focused on patients with locally advanced rectal cancer and the aim is to identify gene expression profile of these tumors (in vivo). It is clearly demonstrated that biological correlates of gene expression are identifiable, therefore combining microarrays analysis with clinicopathological data, we are able to identify gene expression profiles relating to respond to a given therapy. The ability to provide the individualized therapy is based on existence of strong predictive molecular markes. We expect that by using these profiles to minimalize adverse effects and to achieve the highest quality of live of patients with rectal cancer.

Projekt je zaměřen na pacienty s lokálně pokročilým nádorem konečníku, s cílem stanovit profil genové exprese těchto nádorů pomocí DNA čipů. Biologické koreláty genové exprese jsou identifikovatelné, a proto předpokládáme, že biostatistickými nástroji lze integrovat data z DNA čipových analýz a klinickopatologické parametry nádorů a identifikovat prediktivní profily genové exprese. Navrhovaný projekt a použitá metodika dávají předpoklad k identifikaci molekulárních prediktorů a k jejich budoucímu začlenění do funkční diagnostiky nádorů konečníku. Funkční diagnostika a silné molekulární prediktory jsou předpokladem k individualizaci terapie a k dosažení lepších léčebných výsledků a vyšší kvality života pacientů.

• MeSH
• adjuvantní chemoterapie MeSH
• čipová analýza proteinů MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• exprese genu MeSH
• genetické testování MeSH
• kolorektální nádory terapie   MeSH
• kvalita života MeSH
• nanotechnologie MeSH
• prediktivní hodnota testů MeSH
• radioterapie MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biochemie
• gastroenterologie
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR