Bordetella pertussis is the causative agent of human whooping cough (pertussis), a highly contagious respiratory disease that remains to be the least controlled vaccine-preventable infectious disease. Despite generalized vaccination, pertussis is again on the rise in highly vaccinated populations including Czech Republic. The increase in pertussis cases has been mostly attributed to short-lived immunity induced by the acellular vaccine and escape from immunity due to pathogen adaptation and antigen variation. Therefore, using comparative genomics we will analyze Czech clinical isolates of B. pertussis collected during the recent period 2008 - 2015. Importantly, genomic sequences, expression and production of virulence factors will be compared with those of B. pertussis vaccine strains. In addition, using proteomics and immunoprecipitation we will apply recent human sera of infected patients for identification of novel immunogenic antigens of B. pertussis.

Bordetella pertussis je lidský patogen, který je původcem černého kašle, vysoce nakažlivé respirační choroby, jejíž výskyt je v současné době na vzestupu a to i v ekonomicky vyspělých zemích s vysokou proočkovaností jako je Česká republika. Tento vzestup je přičítán zejména přechodu z celobuněčných vakcín na vakcíny acelulární. Acelulární vakcíny jsou sice ve srovnání s celobuněčnými méně reaktogenní, nicméně poskytují sníženou a kratší ochranu před nákazou. Navíc došlo u cirkulujících kmenů B. pertussis v reakci na antigeny obsažené ve vakcínách ke genotypovým změnám. Naším cílem je analyzovat celogenomové sekvence a produkci faktorů virulence v klinických izolátech získaných na území České republiky v letech 2008 – 2015. Pro srovnávací analýzu budou využity i původní vakcinační kmeny používané k výrobě celobuněčné vakcíny. Dále pomocí proteomiky a imunoprecipitace použijeme séra pacientů nakažených černým kašlem k identifikaci nových imunogenních antigenů produkovaných současnými kmeny B. pertussis.

• MeSH
• Bordetella pertussis genetika   patogenita   MeSH
• faktory virulence rodu Bordetella analýza   MeSH
• lidé MeSH
• pertuse genetika   prevence a kontrola   MeSH
• sekvenování celého genomu metody   MeSH
• virulence MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• pneumologie a ftizeologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

B. pertussis isolates from 1964-2015 obtained from CR will be analysed by the following molecular methods: multilocus variable-number tandem-repeat analysis, sequencing of the ptxA/C, prnA and fim genes, and multilocus sequence typing. The study set will include 190 isolates of B. pertussis. The data will be used for analysing clonal and antigenic shifts in BP following the countrywide vaccination with the whole-cell and later with acellular pertussis vaccines in the period 1964-2015. The project is expected to answer the question whether there are new lines of B. pertussis in CR, which have the ability to spread in the vaccinated population. If so, the results of the study would be served as a basis for the draft update of vaccination strategies in CR. The fifty-year span study design is significant worldwide. The providing of B. pertussis molecular characteristics to the international databases will be relevant to the development of a novel more efficient vaccine against pertussis

V navrhovaném projektu budou izoláty B. pertussis z celé ČR z období 1964-2015 studovány molekulárními metodami: multilocus variable number tandem repeat analysis (MLVA) a sekvenací genů ptxA, prnA, fim, promotoru ptxP, a vybrané izoláty metodou multilocus sequence typing (MLST). Předpokládaná velikost studovaného souboru je 190 izolátů B. pertussis. Bude sledováno, zda v ČR došlo ke genetickému a antigennímu posunu B. pertussis v průběhu plošného očkování celobuněčnou a později acelulární vakcínou v období 1964-2015. Projekt by měl zodpovědět otázku, zda se v ČR objevují nové linie B. pertussis, které mají schopnost šířit se i v proočkované populaci. V kladném případě by výsledky studie sloužily jako podklad pro návrh aktualizace vakcinační strategie v ČR. Pokrytí padesátiletého období je významné i z mezinárodního hlediska. Poskytnutí molekulárních charakteristik B. pertussis do mezinárodních databází rozšíří poznatky potřebné k vývoji nové účinnější vakcíny proti pertusi.

• MeSH
• Bordetella pertussis genetika   MeSH
• faktory virulence rodu Bordetella analýza   MeSH
• infekce bakteriemi rodu Bordetella MeSH
• molekulární biologie MeSH
• molekulární epidemiologie MeSH
• multilokusová sekvenční typizace MeSH
• pertuse MeSH
• pertusová vakcína MeSH
• vakcinace MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• infekční lékařství
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Diplomová práce, která se zaměřila na vliv dlouhodobě podávaných dietárních nukleotidů na imunitu.

• MeSH
• buněčná imunita MeSH
• fyziologie výživy MeSH
• humorální imunita MeSH
• imunitní systém MeSH
• lymfocyty MeSH
• modely u zvířat MeSH
• myši MeSH
• nukleotidy MeSH
• nutriční vědy MeSH
• Check Tag
• myši MeSH
• Publikační typ
• vysokoškolské kvalifikační práce MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• experimentální medicína
• nutriční terapie, dietoterapie a výživa