V rámci předkládaného projektu budeme analysovat buňky hyperdiploidních akutních lymfoblastických leukemií. Získáme data o charakteru genetických a funkčních změn typických pro tento nejčastější podtyp dětských leukemii a o jeho patogenesi. To může vést ke správnější stratifikaci a terapii těchto pacientů.; Within the proposed project we will analyse the cells of hyperdiplid acute lymphoblastic leukaemia. We will collect data on a type of genetic and functional changes typical for this most frequent subtype ofchildhood ALL and also data on its pathogenesis. This could lead to a better stratification and treatment of these patients.

• MeSH
• Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma MeSH
• Chromosome Aberrations MeSH
• Cytogenetics MeSH
• Diploidy MeSH
• Child MeSH
• Gene Expression MeSH
• In Situ Hybridization, Fluorescence MeSH
• Real-Time Polymerase Chain Reaction MeSH
• Cordocentesis MeSH
• Flow Cytometry MeSH
• Transcriptome MeSH
• Bone Marrow Examination MeSH
• Check Tag
• Child MeSH

• Conspectus
• Pediatrie
• NML Fields
• pediatrie
• onkologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• molekulární biologie, molekulární medicína
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Abnormní DNA obsah v jádrech nádorových buněk, který je dán zpravidla chromozomální aneuplopiditou, je častým nálezem u maligních tumorů. Polyploidita je obvykle spojena s prognosticky nepříznivým průběhem onemocnění. Onkogeny jsou aktivní geny schopné způsobit nebo podpořit nádorovou transformaci. Porucha funkce nebo zvýšená exprese produktu onkogenu vede v konečném důsledku k stimulaci nádorového růstu. Tumor supresorové geny kódují proteiny, které inhibují buněčné dělení. Při jejich poškození docházík úniku buněk z kontrolních mechanizmů vedoucí opět k nádorovému bujení. Cílem projektu je komparace změn v buněčné ploiditě s některými nádorovými biomarkery, zejména p53, bcl-2, HER-2/neu a Ki-67 ve vztahu k dalším prognostickým faktorům a klinickémuprůběhu onemocnění.; Abnormal DNA content in the nuclei of tumour cells, which usually arises from chromosomal aneuploidy, is a frequent finding in malignant tumours. Polyploidy is usually connected to prognostically unfavourable course of disease. Oncogenes are active genesable to cause or support malignant transformation. The disorder of function or increased expression of the product of oncogene leads in a final consequence to the stimulation of tumour growth. Tumour suppressor genes encode proteins which inhibit cell division. When these genes are damaged it may happen that cells escape from control mechanisms and this also opens the way for tumour proliferation. The aim of the project is a comparison of changes in cell ploidy with some tumour biomarkers, namely p53,bcl-2, HER-2/neu and Ki-67 in relation to the other prognostic factors and the clinical course of the disease.

• MeSH
• Aneuploidy MeSH
• Ki-67 Antigen MeSH
• Karyotyping MeSH
• Biomarkers, Tumor MeSH
• Tumor Suppressor Protein p53 MeSH
• Endometrial Neoplasms diagnosis   genetics   MeSH
• Oncogenes MeSH
• Ploidies MeSH
• Receptor, ErbB-2 MeSH
• Receptors, Steroid MeSH
• Genes, Suppressor MeSH

• Conspectus
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NML Fields
• biologie
• gynekologie a porodnictví
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

U pacientek s karcinomem endometria a ovária bude stanovena DNA ploidita. U aneuploidních nádorů bude zvolena radikálnější forma terapie v rámci doporučeného postupu. Provedeme analýzu výsledků ve vztahu k dalšímu průběhu onemocnění.; Cytometric DNA analysis of endometrial and ovarian carcinoma will be performed using fresh/frozen tissue and standard technique. We will choose more radical therapy in DNA aneuploid tumors. We will perform data analysis in relation to clinical outcome (disease-free survival, overall survival).

• MeSH
• Aneuploidy MeSH
• DNA, Neoplasm MeSH
• Biomarkers, Tumor MeSH
• Endometrial Neoplasms therapy   MeSH
• Ovarian Neoplasms therapy   MeSH
• Ploidies MeSH
• Prospective Studies MeSH
• Flow Cytometry MeSH
• Neoplasm Staging MeSH
• Women MeSH

• Conspectus
• Gynekologie. Porodnictví
• NML Fields
• gynekologie a porodnictví
• onkologie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• Aneuploidy MeSH
• Stem Cells MeSH
• Pluripotent Stem Cells MeSH
• Regeneration MeSH
• Regenerative Medicine MeSH
• Publication type
• Collected Work MeSH

• Conspectus
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NML Fields
• biologie

Detekce specifických klonálních chromosomových aberací v imunofluorescenčně značených plazmatických buňkách u nemocných s mnohočetným myelomem molekulárně-cytogenetickými metodami. Zhodnocení prognostického významu specifických chromosomových změn.; Detection of selected clonal chromosomal aberrations in immunofluorescence-marked plasma cells in patients with multiple myeloma using molecular cytogenetic methods. Evaluation of the impact of selected chromosomal abnormalities on the prognosis of patients.

• MeSH
• Chromosome Aberrations MeSH
• Chromosome Deletion MeSH
• Cytogenetics MeSH
• In Situ Hybridization, Fluorescence MeSH
• Multiple Myeloma MeSH
• Prognosis MeSH
• Immunoglobulin Heavy Chains MeSH
• Translocation, Genetic MeSH

• Conspectus
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NML Fields
• onkologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• biologie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Cíleně kvantifikovat a charakterizovat extracelulární fetální DNA v maternalním séru s využitím inovované techniky QF PCR v průběhu těhotenství a krátce po něm u normálních a patologických gravidit a statisticky posoudit výsledky. Rozpoznat a molekulárně- cytogeneticky analyzovat fetální apoptickou DNA v průběhu těhotenství u normálních a patologických gravidit a statisticky vyhodnotit a porovnat oba soubory.; To do proper quantification and characterization of extra-cellular fetal DNA in maternal serum and use innovated technique of QF PCR during pregnancy and after delivery in normal and pathological pregnancies and statistical evaluation of the results. Identification of fetal apoptic DNA, and its analyses with molecular-cytogenetic methods in normal and pathologic pregnancies. Statistical evaluation and comparison of both sets.

• MeSH
• Aneuploidy MeSH
• Apoptosis MeSH
• Biomarkers analysis   MeSH
• Down Syndrome diagnosis   MeSH
• Electrophoresis, Capillary methods   utilization   MeSH
• Erythroblastosis, Fetal MeSH
• Ploidies MeSH
• Prenatal Diagnosis methods   MeSH
• Sequence Analysis, DNA MeSH
• Pregnancy genetics   MeSH
• Women MeSH
• Check Tag
• Pregnancy genetics   MeSH

• Conspectus
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NML Fields
• gynekologie a porodnictví
• gynekologie a porodnictví
• biologie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Mapování zlomových míst na chromosomech 3 a 7 v buňkách kostní dřeně nemocných s myeloidními a lymfatickými malignitami molekulárně cytogenetickými metodami. Vyhodnocení významu odlišných zlomových míst pro prognózu nemocných.; Mapping of the breakpoints on chromosomes 3 and 7 in bone marrow cells of patients with myeloid and lymphoid malignancies. Evaluation of significance of different breakpoints for the prognosis of the patients.

• MeSH
• Chromosome Aberrations MeSH
• Chromosome Deletion MeSH
• Chromosome Disorders MeSH
• Cytogenetics methods   trends   MeSH
• In Situ Hybridization, Fluorescence methods   MeSH
• Leukemia genetics   MeSH

• Conspectus
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NML Fields
• hematologie a transfuzní lékařství
• onkologie
• biologie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Projekt je pokračováním dlouhodobého prospektivního sledování skupiny pacientů s imunodeficiencí na podkladě syndromu diGeorge. Většina pacientů s tímto onemocněním má mikrodeleci na 22 chromozomu a následné komplexní postižení zahrnující chybění thymu.U pacientů sledujeme dysregulaci imunitního systému, dvojitě pozitivní T lymnfocyty, které mohou uniknoout procesům centrální tolerance, TCR Vbeta restrikci lymfocytárních klonů, systémové a orgánově specifické autoprotilátky. U všech pacientů mapujeme mikrodeleci na 22 chromozomu metodou in situ hybridizace FISH. Nově se zaměříme na pacienty, u kterých tato relativně rozsáhlá delece nebyla prokázána, u kterých budeme detailně mapovat kritickou oblast na 22 chromozomu. Při těchto genetických vyšetřeníchse zaměříme na popsaný gen Tbx1, který je kandidátním genem, hrajícím klíčovou roli v patogeneze syndromu diGeorge.; Project is the continuation of prospective study of patients with immunodeficiency based on the syndrome diGeorge. The majority of patients has detectable microdeletion on chromosome 22 and subsequent complex symptomatology including missing thymus. Dysregulation of the immune system is followed according to the investigation of double positive CD4+CD8+cells, that might escape central tolerance, TCR Vbeta clonality, gama/delta T lymphocytes, systemic and organ specific autoantibodies. All patients are tested for 22q11 microdeletion by in situ hybridisation FISH. Patients with diGeorge phenotype, but not proven 22q11 vaste microdeletion, would be included to more detailed analysis of critical 22q11 region. The genetic investigation of these patients would include gene Tbx1, described as candidate gene involved most probably in the pathogenesis of syndrome diGeorge.

• MeSH
• Autoimmunity MeSH
• Chromosome Deletion MeSH
• Cytogenetic Analysis MeSH
• DiGeorge Syndrome immunology   MeSH
• Child MeSH
• Lymphatic Diseases MeSH
• Spectral Karyotyping MeSH
• T-Lymphocytes MeSH
• Check Tag
• Child MeSH

• Conspectus
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NML Fields
• histologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• alergologie a imunologie
• pediatrie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Zavedení nové "čipové" technologie, array-CGH, pro diagnostiku genových změn u nemocných s akutní leukémií(AL). Použití techniky array-CGH pro vyšetření nemocných s akutní myeloidní a lymfoblastickou leukémií s cytogeneticky normálním karyotypem pro přesné určení amplifikací a delecí 300 vybraných genů umístěných na hybridizačním skle GenoSensor Array 300. Využití výsledků array-CGH pro subklasicikaci akutních leukémií a určení nových genů, zahrnutých do maligní transfornace. Určení prognostického významu nalezených genových změn.; The introduction of new microarray technology ( array-CGH) for determination of human DNA for changes in copy number of specific sequences in patients with acute leukemia. Use of array-CGH technique in patients suffering from acute myeloid and lymphoblastic leukemia with normal karyotype obtained by cytogenetics for precise identification od deletions and amplifications of 300 target clone DNA arrayed in target spots on Ge Application of Array-CGH result for sub classification of acute leukemias and determination of new genes involved in malignant transformation in acute leukemia. Determination of prognostic importance of identified gene changes.

• MeSH
• Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma MeSH
• Leukemia, Myeloid, Acute MeSH
• Gene Amplification MeSH
• Chromosome Aberrations MeSH
• Chromosome Deletion MeSH
• Cytogenetic Analysis methods   utilization   MeSH
• Molecular Diagnostic Techniques methods   MeSH
• DNA, Neoplasm analysis   MeSH
• Hybridization, Genetic MeSH
• In Situ Hybridization, Fluorescence methods   MeSH
• Karyotyping MeSH
• Microarray Analysis methods   utilization   MeSH
• Software MeSH
• Genes, Tumor Suppressor MeSH

• Conspectus
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NML Fields
• onkologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• biologie
• genetika, lékařská genetika
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Cílem projektu je zdokonalení nejčasnější prevence chromozomálních VVV a cystické fibrózy (CF) v preimplantační fázi vývoje ke zvýšení efektivity asistované reprodukce (AR) a prenatální prevence těchto závažných poruch prenatálního a postnatálního vývojePreimplantační screening (PGS) chromozomálních aberací zvýší úspěch IVF u žen starších, s opakovnými potraty a neúspěchy stávajících forem AR. Preimplantační diagnostika (PGD) mutací CF umožní volbu nepostiženého plodu bez nutnosti ukončení těhotenství.K detekci specifických mutací a chromozomálních aberací pro optimální volbu gamet a embryí budou využity metody molekulární cytogenetiky (FISH/PRINS, CGH), molekulární genetiky (QF-PCR, QRT-PCR, DGGE a sekvenování) a polarizační mikroskopie. Vyšetření séra těhotných žen biochemickými markery a fetální DNA/RNA zdokonalí péči o prenatální vývoj plodu a gravidity s predikcí a prevencí preeklampsie a diagnózou Rh inkompatibility a geneticky rizikového pohlaví.; The aim is improvement of prevetion of the most common chromosomal aberrations and cystic fibrosis in the preimplantation phase of development for the improvement of IVF success rates and prevention of these severe errors of prenatal and postnatal phase.Preimplantation screening (PGS) of chromosomal aberrations will improve IVF success rates in older patients, with repeated miscarriages and unsuccessful IVF. Preimplantation diagnosis (PGD) of CF mutations will circumvent the necessity for selective TOPs We will use techniques of molecular cytogenetics (e.g. FISH, PRINS, CGH) and molecular genetics (QF-PCR, QRT-PCR, DGGE and minisequencing), including polarization microscopy for detection of chromosomal aneuploidies and genomic mutations. Examination selected biochemical markers and fetal DNA/RNA will improve our care about the prenatal development of the fetus, will predict preeclampsia, diagnose Rh-incompatibility and genetic risk gender.

• MeSH
• Aneuploidy MeSH
• Chromosome Disorders prevention & control   MeSH
• Cystic Fibrosis prevention & control   MeSH
• Embryo, Mammalian MeSH
• Fluorescence MeSH
• Mutation MeSH
• Preimplantation Diagnosis MeSH
• Reproductive Medicine MeSH
• Reproduction MeSH

• Conspectus
• Fyziologie člověka a srovnávací fyziologie
• NML Fields
• reprodukční lékařství
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR