JavaScript NENÍ povolen !

The project proposes to develop software usable in clinical practice for computer aided diagnosis of neuropsychiatric disorders from MR images of brain. It is based on experience with advanced analysis of MR images, including assessment of brain morphology in the first episode of schizophrenia. Authorized software - the main subject of the proposed project - will combine methods for image processing and analysis with advanced machine learning algorithms for prediction, classification and recognition. This will provide a new tool for analyzing image data, which will bring medical imaging closer to the clinical psychiatry by making diagnosis objective, which is in the current practice based on subjective evaluation of clinically evident changes in mental function and behavior. The methodology includes the development of algorithms aimed at the description of the images with the use of automated morphometry as well as the development of classifiers using features extracted from various data sources.

Předkládaný projekt navrhuje vytvořit software využitelný v klinické praxi při počítačové diagnostice neuropsychiatrických poruch z obrazů mozku pořízených magnetickou rezonancí (MR). Projekt vychází ze zkušeností s pokročilou analýzou MR obrazů včetně hodnocení morfologie mozku pacientů s první epizodou schizofrenie. Autorizovaný software - hlavní předmět předkládaného projektu - bude spojovat metody zpracování a analýzy obrazů mozku s pokročilými algoritmy strojového učení pro predikci, klasifikaci a rozpoznávání. Vznikne tak nový prostředek pro analýzu obrazových dat, který přiblíží zobrazovací metody klinické praxi v psychiatrii, umožní objektivní diagnostiku, která je v současné praxi založena na subjektivním hodnocení klinicky patrných změn psychických funkcí a chování. Metodika řešení projektu zahrnuje jednak vývoj metod zaměřených na popis obrazů s důrazem na využití automatických morfometrických metod a dále vývoj klasifikátorů využívajících příznakového popisu z různých datových zdrojů.

Konspekt
Patologie. Klinická medicína
NLK Obory
neurologie
neurovědy
psychiatrie
NLK Publikační typ
závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Výzkumná zpráva

Integrativní vývoj multimodálního rizikového skóre pro odhad relapsu u pacientek s karcinomem prsu

Popovici, Vlad
Autor Autorita ORCID
Masarykova univerzita. Institut biostatistiky a analýz
Autor Autorita

2016

Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR

1 svazek ; 30 cm

The main goal of the proposed project is to bridge the gap between histo-pathological readings and the molecular signatures by combining the two modalities into an improved risk scoring system. The current practice considers the pathological examination and the molecular profiling as two independent stages in patient diagnosis. It is conceivable that new histo-pathological descriptors of the tumor, that are not usually estimated by the pathologist, can be extracted by using quantitative methods for image analysis, such that they are either predicting aspects of molecular profiles or complementing the gene signatures. Such descriptors will enhance the pathological assessment of the tumor and enrich the risk scores. The project will provide both the software tools for computing the image descriptors and the methods for estimating the risk scores. The independent validation of the results will be performed in a retrospective cohort in a follow up project.

Hlavním cílem překládaného projektu je přemostit histopatologické čtení nádorových tkáňových řezů a molekulárních genomických dat integrací obou modalit do vylepšeného rizikového skóre pro relaps. Současná praxe považuje patologické vyšetření a molekulární profilování za dva nezávislé kroky diagnózy nádoru. Předpokládáme, že kvantitativními metodami analýzy obrazu mohou být objeveny některé nové histopatologické charakteristiky nádoru, které normálně nejsou patologem vyhodnocovány, ale jsou buď prediktory molekulárních procesů, a/nebo představují jejich doplňky vylepšující patologické hodnocení nádoru a rizikové skóre. Výsledkem tohoto projektu budou softwarovérové nástroje pro nalezení obrazových charakteristik tkáňových řezů a vylepšená metoda odhadu rizikového skóre, které budou používány patologem a onkologem k lepší rizikové diagnostice nádoru. V případě úspěchu projektu budou výsledky dále validovány na nezávislé retrospektivní kohortě v samostatném projektu.

Konspekt
Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
NLK Obory
molekulární biologie, molekulární medicína
gynekologie a porodnictví
onkologie
NLK Publikační typ
závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Výzkumná zpráva

Přesnost CT angiografie, DSA, MRAg a DUS u stenóz krkavice v porovnání s histologickými nálezy

Beneš, Vladimír, 1953-
Autor Autorita ORCID
Ústřední vojenská nemocnice (Praha, Česko)
Autor Autorita

2016

Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR

1 svazek : ilustrace, tabulky ; 30 cm + CD

Patients with atherosclerotic carotid disease are endangered by ischemic stroke caused by cerebral embolisation. In the grant project IGA MZ 6980-3 we compared DSA and doppler ultrasonography with morphological stenosis, measured on histological specimen from the atherosclerotic plaque. Conclusions: angiography underestimates significantly degree of stenosis, in range of stenoses 30-50% the underestiation is so profound, that angiography is almost unacceptable. Doppler ultrasongraphy is more precise than angiography, in lesser stenoses less frequently and less severely underestimates the degree of stenosis. In the grant project IGA MZ 9435-3 we compared angiography, doppler ultrasonography and MR angiography. Conclusions: angiography underestimates the severity of stenosis, MRangiography is precise in stenoses 50-69%, ultrasonography is more precise in mild stenoses. There is an evident need of study comparing another noninvasive diagnostic tool (CT angiography) with morphological stenosis.

Nemocní s aterosklerotickým postižením karotidy jsou ohroženi ischemickým iktem . V rámci IGA MZ 6980-3 jsme srovnávali DSA a dopplerovskou ultrasonografií s nálezy aterosklerotických plátech. Závěry: DSA významně podhodnocuje stupeň stenózy. U stenóz 30 – 50% je nepřesnost této metodiky natolik závažná, že je obtížně akceptovatelná. Dopplerovská ultrasonografie poskytuje přesnější výsledky než DSA. U nižších stenóz UZ méně často a o méně procent podhodnocuje stenózu karotidy, než DSA. V rámci IGA MZ 9435-3 jsme srovnávali DSA, MRA a dopplerovskou ultrasonografii. Závěry: potvrzení podhodnocování nálezů dle DSA, MRA nejpřesnější u stenóz 50-69%, UZ je nejpřesnější u mírných stenóz. Z výsledků předchozích studií vyplývá potřeba studie srovnávající další neinvazivní diagnostickou metodiku, tj. CT angiografii s morfologií aterosklerotického plátu. Publikace o korelaci CT angiografie s hodnocením morfologie aterosklerotického plátu jsou ojedinělé.