Molecular diversity of rumen bacteria belonging to the species Selenomonas ruminantium was evaluated by biochemical and PCR analyses targeted at the 16S rRNA operon and lactate dehydrogenase gene. While extremely variable in metabolic characteristics, two different RISA (ribosomal intergenic spacer analysis), and five lactate dehydrogenase gene RFLP profiles were observed among the twelve strains studied. The strains showed very limited variability ARDRA ( amplified ribosomal DNA restriction analysis) when two different profiles were observed only. 16S rDNA sequence comparisons indicate complex genetic structure within S.ruminantium population.
- MeSH
- bachor mikrobiologie MeSH
- bakteriální proteiny genetika MeSH
- DNA bakterií genetika MeSH
- fylogeneze MeSH
- genetická variace * MeSH
- L-laktátdehydrogenasa genetika MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- polymorfismus délky restrikčních fragmentů MeSH
- ribozomální DNA genetika MeSH
- RNA ribozomální 16S genetika MeSH
- techniky typizace bakterií MeSH
- Veillonellaceae klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- vysoká zvěř mikrobiologie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- bakteriální proteiny MeSH
- DNA bakterií MeSH
- L-laktátdehydrogenasa MeSH
- ribozomální DNA MeSH
- RNA ribozomální 16S MeSH
The GATC-specific restriction and modification activities were analyzed in 11 major bacterial representatives of ruminal microflora. Modification phenotype was observed in 13 out of 40 ruminal strains. MboI isoschizomeric restriction endonucleases were detected in 10 bacterial strains tested; three strains lacked any detectable corresponding endonuclease activity. The only examined strain of Mitsuokella multi-acida was found to possess a different type of endonuclease activity. This is the first report on restriction activity in ruminal treponemes M. multiacida and Megasphaera elsdenii.
- MeSH
- bachor mikrobiologie MeSH
- Bacteria enzymologie izolace a purifikace MeSH
- DNA restrikčně-modifikační enzymy metabolismus MeSH
- DNA virů metabolismus MeSH
- elektroforéza v agarovém gelu MeSH
- Megasphaera enzymologie izolace a purifikace MeSH
- restrikční endonukleasy typu II metabolismus MeSH
- substrátová specifita MeSH
- Veillonellaceae enzymologie izolace a purifikace MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- DNA restrikčně-modifikační enzymy MeSH
- DNA virů MeSH
- GATC-specific type II deoxyribonucleases MeSH Prohlížeč
- restrikční endonukleasy typu II MeSH