Understanding the effects of metabolism on the rational design of novel and more effective drugs is still a considerable challenge. To the best of our knowledge, there are no entirely computational strategies that make it possible to predict these effects. From this perspective, the development of such methodologies could contribute to significantly reduce the side effects of medicines, leading to the emergence of more effective and safer drugs. Thereby, in this study, our strategy is based on simulating the electron ionization mass spectrometry (EI-MS) fragmentation of the drug molecules and combined with molecular docking and ADMET models in two different situations. In the first model, the drug is docked without considering the possible metabolic effects. In the second model, each of the intermediates from the EI-MS results is docked, and metabolism occurs before the drug accesses the biological target. As a proof of concept, in this work, we investigate the main antiviral drugs used in clinical research to treat COVID-19. As a result, our strategy made it possible to assess the biological activity and toxicity of all potential by-products. We believed that our findings provide new chemical insights that can benefit the rational development of novel drugs in the future.

• MeSH
• adenin škodlivé účinky   analogy a deriváty   metabolismus   farmakologie   MeSH
• adenosin škodlivé účinky   analogy a deriváty   metabolismus   farmakologie   MeSH
• adenosinmonofosfát škodlivé účinky   analogy a deriváty   metabolismus   farmakologie   MeSH
• alanin škodlivé účinky   analogy a deriváty   metabolismus   farmakologie   MeSH
• amidy škodlivé účinky   metabolismus   farmakologie   MeSH
• antivirové látky škodlivé účinky   metabolismus   farmakologie   MeSH
• chlorochin škodlivé účinky   analogy a deriváty   metabolismus   farmakologie   MeSH
• COVID-19 metabolismus   MeSH
• dusíkaté sloučeniny škodlivé účinky   metabolismus   farmakologie   MeSH
• farmakoterapie COVID-19 * MeSH
• lidé MeSH
• metabolické sítě a dráhy MeSH
• objevování léků * MeSH
• pyraziny škodlivé účinky   metabolismus   farmakologie   MeSH
• pyrrolidiny škodlivé účinky   metabolismus   farmakologie   MeSH
• racionální návrh léčiv MeSH
• ribavirin škodlivé účinky   metabolismus   farmakologie   MeSH
• SARS-CoV-2 účinky léků   metabolismus   MeSH
• simulace molekulového dockingu MeSH
• thiazoly škodlivé účinky   metabolismus   farmakologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Názvy látek
• adenin MeSH
• adenosin MeSH
• adenosinmonofosfát MeSH
• alanin MeSH
• amidy MeSH
• antivirové látky MeSH
• chlorochin MeSH
• dusíkaté sloučeniny MeSH
• favipiravir MeSH Prohlížeč
• galidesivir MeSH Prohlížeč
• nitazoxanide MeSH Prohlížeč
• pyraziny MeSH
• pyrrolidiny MeSH
• remdesivir MeSH Prohlížeč
• ribavirin MeSH
• thiazoly MeSH