Patients with MDS are treated by hypomethylating agents, of which they benefit significantly. However, only half of the patients respond positively to the treatment. Using RNA and DNA microarrays, we will attempt to define a gene profile, which will predict which patients will likely respond to treatment with demethylation agents. We plan to analyze CD34 + cells before and during treatment with azacitidine. We will characterize expression (mRNA and microRNA) and DNA methylation profiles of the cells from patients who respond or do not respond to the treatment. We will integrate all the observed experimental data and correlate with clinical responses to demethylation treatment. In data analysis, we will use the standard statistical methods and predictive classifiers expressing a causal association between the measured variables and diagnosis and clinical symptoms. In this study, we will apply modern methods of molecular genetics as a tool for personalizing treatment for patients with MDS.

Pacientům ze střední a vysoce rizikové skupiny myelodysplastického syndromu je podávána hypometylační léčba (především azacitidin), z které pacienti významně profitují. Pouze však polovina pacientů na léčbu pozitivně reaguje. S použitím RNA a DNA mikročipů chceme sestavit genový profil, který by predikoval úspěšnost demetylační léčby. Plánujeme vyšetřovat CD34+ progenitorové hematopoetické buňky pacientů před a v průběhu léčby azacitidinem. Vytvořit celogenomové expresní (mRNA i microRNA ) a DNA metylační profily pacientů, kteří reagují či nereagují na léčbu. Všechna zjištěná experimentální data vzájemně propojit a korelovat s odpovědí na demetylační léčbu. Při vyhodnocení chceme použít klasické statistické metody a také prediktivní klasifikátory vyjadřující kauzální vztah mezi měřenými příznaky a diagnózou. V této studii bychom chtěli využít moderní metody molekulární genetiky jako nástroje pro individualizaci léčby pacientů s MDS.

Doba řešení: 2013-2015