Deset procent úmrtí dětí se solidními nádory je způsobeno meduloblastomem. Současná molekulární klasifikace meduloblastomu má prognostický význam. Je však založena na analýze transkriptomu, což je v běžné diagnostické praxi nákladné a jen obtížně realizovatelné. Proto v navrhovaném projektu aplikovaného výzkumu plánujeme využít kvantitativní proteomiku k identifikaci a validaci nových proteinových markerů recentně identifikovaných molekulárních podskupin meduloblastomu (tj. WNT, SHH, skupina 3, skupina 4). Proteiny se vztahem k rozdílné klinické prezentaci a prognóze onemocnění plánujeme odhalit i uvnitř jednotlivých podskupin. Součástí projektu je také ověření naší hypotézy o podílu tetraspaninů a dalších membránových proteinů (např. chloride intracellular channel 1) v patogenezi meduloblastomu a o jejich rozdílné expresi mezi podskupinami. Předpokládané výsledky poslouží k vývoji robustních a spolehlivých imunohistochemických testů pro rutinní diagnostiku molekulárních podskupin meduloblastomu a jsou východiskem pro vývoj cílené léčby meduloblastomu zaměřené na membránové protei...; Ten percent of all cancer related deaths in children are caused by medulloblastoma. The recent molecular classification of medulloblastoma has prognostic impact. However, it is based on transcriptome-arrays that are not suitable for daily diagnostic practice. In this project, using our established quantitative proteomics-based target discovery program, we propose to identify and validate protein-based markers of molecular subgroups (i.e. WNT, SHH, Group 3, Group 4). Proteins with impact on clinical presentation and prognoses will be defined also within the subgroups. Other expected results of the project validate our hypothesis that tetraspanins and other membrane proteins (e.g. chloride intracellular channel 1) are involved in pathogenesis and are differentially expressed in medulloblastoma molecular subgroups. This knowledge is expected to result to the robust and reliable immunohistochemical tests for routine diagnostics of medulloblastoma subgroups and could be a basis for development of targeted therapies using membrane proteins involved in medulloblastoma tumorigenesis.

Proteomic analysis of medulloblastoma molecular subgroups: discovery of novel clinically relevant markers

Doba řešení: 2015-2018

Obsahuje literaturu