We will use massive parallel sequencing (MPS – targeted as well as whole exome) for elucidation of causes of severe childhood epilepsies and epileptic encephalopathies. This approach is not yet available in the Czech Republic. A large cohort of patients with unknown cause of non-lesional epilepsy is available at our Centre for epilepsies. We will focus on epileptic encephalopathies, severe childhood epilepsies and familial epileptic syndromes and syndromes with epilepsy. We also have enough experience and equipment for data processing and filtering from MPS in other neurological disorders. In selected patients a panel of all (about 100) relevant known genes yet related to monogenic early childhood epilepsies and epileptic encephalopathies will be examined by the HaloPlex MPS method. About 50 patients per year will be tested. Results will be interpreted by experienced epileptologists according to clinical data and family history. The results will improve our understanding of the aethiology of epilepsies and improve Czech healthcare including personalized therapy.

Epilepsie jsou heterogenní skupinou onemocnění. Příčinou jsou strukturální vývojové vady mozku, metabolická onemocnění a v poslední době výrazně přibylo objevů řady genů, jejichž mutace způsobují epilepsie. V projektu budou využity metody molekulární genetiky - masivní paralelní sekvenování včetně exomového sekvenování – pro objasnění příčin dětských epilepsií a epileptických encefalopatií. Takové možnosti dosud nejsou v ČR dostupné. V projektu bude pomocí metody HaloPlex připraven panel genů, jejichž poruchy jsou spojeny s epilepsiemi dětského věku (již více než 100 genů). Cílem je vyšetřit cca. 100-150 pacientů (převážně z našeho Centra pro epilepsie) s těžkou epilepsií, kteří nemají objasněnou etiologii a mají negativní MRI mozku. Výsledky genetického testování budou interpretovány se zkušeným epileptologem v kontextu klinických příznaků a rodinné anamnézy. V naší laboratoři již máme velmi dobré zkušenosti s využitím sekvenování nové generace u geneticky heterogenního onemocnění (dědičné neuropatie). Výsledky budou mít velký význam pro klinickou praxi a zlepší péči o pacienty.

Massive parallel sequencing of genes related to infantile epilepsies and epileptic encephalopathies for diagnostics of epilepsy in Czech patients

Doba řešení: 2015-2018

Obsahuje literaturu