Hluchota je nejčastější smyslovou vadou. Víc než 60 % případů má genetickou příčinu, monogenní a většina je autozomálně recesivních(AR), nesyndromových. AR dědičná hluchota je geneticky vysoce heterogenní. Zjistili jsme, že u 40 % pacientů s prelingvální ztrátou sluchu jsou příčinou mutace v GJB2 genu. U zbylých 60 % pacientů však po vyšetření GJB2 genu zůstává příčina neobjasněna, protože šance na objasnění vyšetřením jednotlivého dalšího genu je pod 1-2 %. Těmto pacientům je třeba nabídnout vyšetření pomocí nového masivně paralelního sekvenování panelu všech dosud známých (>60) genů spojovaných s AR hluchotou. Není známo, jaký podíl na příčině hluchoty mají mutace v jednotlivých dosud známých genech a ani jaké procento pacientů lze objasnit současným vyšetřením všech genů nyní spojených s hluchotou. Po 12 letech DNA diagnostiky máme k dispozici vzorky od více než 600 neslyšících pacientů s vyloučenými mutacemi v GJB2 z nichž 100 má i neslyšícího sourozence. Tyto vzorky budou vyšetřeny masivně paralelním sekvenováním (NGS) panelu genů s využitím systému HaloPlex (Agilent).; Early severe deafness has prevalence of 1:1000 and is the most frequent sensory deficit. More than 60% of the cases have genetic, monogenic origin, most frequently autosomal recessive and are non-syndromic. Hereditary deafness is genetically highly heterogeneous. Mutations in the major gene GJB2 gene are found in 40% of patients with pre-lingual hearing loss. But in more than 60% of patients already tested for GJB2 the cause of deafness remains unknown and the probability of finding the causal mutation in another single gene drops to 1-2%. Patients without GJB2 mutations should be tested by massive parallel sequencing of a gene panel containing about 60 actually known genes relevant for hearing impairment. During 12 years of DNA diagnostics GJB2 gene testing, we collected more than 600 deaf patients with unknown cause of prelingual deafness who should be tested by the AR hereditary hearing loss gene panel using massive parallel sequencing. We want to test how many patients can be clarified by the gene panel testing and what genes are more frequently mutated in Czech patients.

Massive parallel sequencing (MPS) for elucidation of causes of early hereditary hearing loss in Czech patients without GJB2 mutations

Doba řešení: 2016-2019

Obsahuje literaturu